More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I3003 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I3003  TatD related DNase  100 
 
 		 265 aa  555  1e-157  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0100671  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001920  deoxyribonuclease TatD  81.82 
 
 		 253 aa  451  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00569  deoxyribonuclease  81.42 
 
 		 254 aa  449  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2415  hypothetical protein  74.5 
 
 		 255 aa  412  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000025534  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0246  hydrolase, TatD family  55.16 
 
 		 256 aa  305  7e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1922  hypothetical protein  50.99 
 
 		 256 aa  295  3e-79  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5476  hydrolase, TatD family  52.99 
 
 		 256 aa  286  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.230382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2234  hydrolase, TatD family  51.16 
 
 		 268 aa  268  8e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.154298  normal  0.291214 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2173  Sec-independent protein translocase TatD  45.42 
 
 		 261 aa  257  2e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.69531 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02785  Sec-independent protein translocase protein TatD  44.88 
 
 		 255 aa  253  3e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1278  TatD family hydrolase  43.7 
 
 		 259 aa  245  4e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0265  hydrolase, TatD family  43.87 
 
 		 253 aa  244  9.999999999999999e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0321314  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0541  hydrolase, TatD family  41.34 
 
 		 255 aa  230  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000604201 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  40.31 
 
 		 263 aa  216  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  38.4 
 
 		 462 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0783  hydrolase, putative  40.32 
 
 		 275 aa  202  4e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  38.04 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  38.34 
 
 		 255 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  37.94 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  37.94 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  37.94 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  37.94 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  36.86 
 
 		 256 aa  191  8e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  36.86 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  37.8 
 
 		 461 aa  191  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  36.86 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  37.65 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  38.4 
 
 		 462 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  36.86 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  37.15 
 
 		 255 aa  189  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  38.19 
 
 		 257 aa  188  7e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  36.86 
 
 		 606 aa  188  7e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  36.47 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  38.19 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  37.98 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  39.44 
 
 		 271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  38.58 
 
 		 256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  38.52 
 
 		 258 aa  183  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  35.29 
 
 		 458 aa  182  7e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  34.9 
 
 		 458 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  39.68 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  37.65 
 
 		 457 aa  181  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  37.11 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  33.73 
 
 		 255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  36.72 
 
 		 256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  35.94 
 
 		 257 aa  179  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  35.94 
 
 		 257 aa  179  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04351  putative deoxyribonuclease, TatD family  38.61 
 
 		 277 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2230  hydrolase, TatD family  39.15 
 
 		 273 aa  176  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  36.68 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0604  TatD-related deoxyribonuclease  36.96 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  37.25 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1192  YabD  36.15 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.937754  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  38.72 
 
 		 261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2068  TatD-related deoxyribonuclease  38.82 
 
 		 262 aa  172  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  33.73 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1776  hydrolase, TatD family  33.33 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  34.87 
 
 		 262 aa  169  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  35.43 
 
 		 268 aa  169  5e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  36.11 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  34.12 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  32.94 
 
 		 464 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  34.12 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0660  hydrolase, TatD family  35.25 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0516456  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  33.86 
 
 		 459 aa  166  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0780  hydrolase, TatD family  36.9 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0567  hydrolase, TatD family  34.51 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1656  hydrolase, TatD family  32.41 
 
 		 269 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  33.85 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  33.46 
 
 		 256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  34.24 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0706  TatD family hydrolase  34.9 
 
 		 255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  34.25 
 
 		 260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1609  TatD-related deoxyribonuclease  34.77 
 
 		 275 aa  162  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0793663  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  31.75 
 
 		 256 aa  161  9e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1799  hydrolase, TatD family  32.81 
 
 		 257 aa  160  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.339563  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  35.29 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  35.16 
 
 		 259 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  35.55 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  32.54 
 
 		 256 aa  160  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  36.33 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2940  Sec-independent protein translocase TatD  35.27 
 
 		 273 aa  161  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.355408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0185  TatD family hydrolase  37.01 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16081  TatD family deoxyribonuclease  33.33 
 
 		 261 aa  159  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  35.16 
 
 		 261 aa  159  6e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  32.3 
 
 		 264 aa  158  8e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  34.36 
 
 		 262 aa  158  9e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  33.59 
 
 		 255 aa  158  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  34.12 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1355  TatD family hydrolase  35 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.300834  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_805  hydrolase, TatD family, Mg-dependent DNase  35 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  34.77 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2645  TatD family hydrolase  34.88 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0051  TatD family hydrolase  34.39 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.563269  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1664  TatD family hydrolase  34.75 
 
 		 266 aa  156  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  33.85 
 
 		 262 aa  156  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04808  putative deoxyribonuclease YjjV  35.43 
 
 		 255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1985  TatD family hydrolase  34.5 
 
 		 262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  33.33 
 
 		 258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0316  TatD family hydrolase  40.32 
 
 		 257 aa  155  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  0.040307 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>