More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0185 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0185  TatD family hydrolase  100 
 
 		 278 aa  571  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2230  hydrolase, TatD family  73.99 
 
 		 273 aa  427  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0074  TatD-related deoxyribonuclease  63.97 
 
 		 276 aa  376  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0780  hydrolase, TatD family  62.64 
 
 		 273 aa  351  7e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0721  hydrolase, TatD family  55.68 
 
 		 280 aa  302  3.0000000000000004e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00103897  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3219  hydrolase, TatD family  56 
 
 		 272 aa  294  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  39.13 
 
 		 464 aa  212  5.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  43.08 
 
 		 462 aa  211  9e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  41.8 
 
 		 457 aa  211  9e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  40.71 
 
 		 606 aa  204  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  42.13 
 
 		 461 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  41.83 
 
 		 256 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  44.92 
 
 		 258 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  37.55 
 
 		 462 aa  198  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  37.15 
 
 		 255 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  44.92 
 
 		 258 aa  198  9e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  36.76 
 
 		 255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  39.13 
 
 		 458 aa  196  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  36.36 
 
 		 255 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  36.36 
 
 		 255 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  36.36 
 
 		 255 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  38.74 
 
 		 458 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  36.36 
 
 		 255 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  36.36 
 
 		 255 aa  195  6e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  35.97 
 
 		 255 aa  195  7e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  44.14 
 
 		 258 aa  195  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  35.02 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  35.97 
 
 		 255 aa  193  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  35.97 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  44.14 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2940  Sec-independent protein translocase TatD  36.47 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.355408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  35.57 
 
 		 256 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  36.47 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  41.83 
 
 		 271 aa  189  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  34.9 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0051  TatD family hydrolase  37.05 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.563269  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  33.73 
 
 		 255 aa  186  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  39.22 
 
 		 257 aa  186  5e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  38.91 
 
 		 257 aa  185  6e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  43.48 
 
 		 261 aa  185  7e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  37.64 
 
 		 268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  34.52 
 
 		 256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  36.08 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  42.02 
 
 		 261 aa  181  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  40.39 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  40.08 
 
 		 270 aa  181  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  33.73 
 
 		 257 aa  179  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  33.73 
 
 		 257 aa  179  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  33.33 
 
 		 255 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  40.08 
 
 		 270 aa  178  9e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  37.94 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  40.62 
 
 		 258 aa  176  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  37.8 
 
 		 263 aa  176  5e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  36.76 
 
 		 271 aa  176  5e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  37.8 
 
 		 263 aa  176  5e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  38.58 
 
 		 264 aa  176  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  36.19 
 
 		 259 aa  175  7e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  39.22 
 
 		 256 aa  175  8e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  31.5 
 
 		 260 aa  175  9e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  36.22 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  33.33 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  37.15 
 
 		 260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  35.06 
 
 		 256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  35.69 
 
 		 265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1018  TatD family hydrolase  36.68 
 
 		 261 aa  172  5e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.195274  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  37.4 
 
 		 260 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  40.08 
 
 		 268 aa  172  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  35.57 
 
 		 258 aa  172  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  39.69 
 
 		 264 aa  172  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1779  hydrolase, TatD family  35.02 
 
 		 265 aa  171  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1752  hydrolase, TatD family  35.02 
 
 		 265 aa  171  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3167  TatD family hydrolase  35.99 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  38.58 
 
 		 273 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  36.43 
 
 		 459 aa  171  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  38.04 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  37.15 
 
 		 262 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  33.85 
 
 		 256 aa  169  5e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  35.29 
 
 		 256 aa  169  6e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5258  hydrolase, TatD family  40.78 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  35.83 
 
 		 262 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  36.82 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  33.46 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0800  TatD family hydrolase  33.72 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0740  hydrolase, TatD family  33.85 
 
 		 270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  36.76 
 
 		 253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04351  putative deoxyribonuclease, TatD family  38.76 
 
 		 277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4206  Sec-independent protein translocase TatD  35.77 
 
 		 261 aa  166  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  33.47 
 
 		 256 aa  166  5e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  32.54 
 
 		 251 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  35.06 
 
 		 257 aa  165  9e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  35.8 
 
 		 268 aa  165  9e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3661  TatD family hydrolase  38.04 
 
 		 269 aa  165  9e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  33.86 
 
 		 255 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16081  TatD family deoxyribonuclease  35.02 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  38.43 
 
 		 257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0308  hydrolase, TatD family  33.99 
 
 		 254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  33.07 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  31.5 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  36.76 
 
 		 265 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2211  TatD family hydrolase  36.4 
 
 		 280 aa  163  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>