More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3167 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3167  TatD family hydrolase  100 
 
 		 285 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8621  Mg-dependent DNase  83.69 
 
 		 286 aa  473  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0980  hydrolase, TatD family  62.11 
 
 		 276 aa  352  5e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3965  TatD-related deoxyribonuclease  57.72 
 
 		 274 aa  292  5e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.659781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0766  TatD family hydrolase  57.78 
 
 		 274 aa  281  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1005  hydrolase TatD family  51.65 
 
 		 272 aa  263  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0725  TatD family hydrolase  54.29 
 
 		 309 aa  260  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075899 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0903  hydrolase, TatD family  53.09 
 
 		 287 aa  259  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153201  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0781  TatD family hydrolase  50.52 
 
 		 322 aa  258  6e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.063357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1043  hydrolase, TatD family  50.17 
 
 		 274 aa  256  4e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.322597  normal  0.991725 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4069  hydrolase, TatD family  51.3 
 
 		 307 aa  253  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.344791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03330  hydrolase, TatD family  50 
 
 		 287 aa  246  3e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.849452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4560  hydrolase, TatD family  50.54 
 
 		 280 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0398  TatD-related deoxyribonuclease  50.17 
 
 		 306 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05370  hydrolase, TatD family  48.75 
 
 		 317 aa  243  1.9999999999999999e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0586524  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30330  Mg-dependent DNase  44.74 
 
 		 303 aa  240  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0666529  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1511  hydrolase, TatD family  47.08 
 
 		 293 aa  233  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234409  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0972  hydrolase, TatD family  46.86 
 
 		 303 aa  229  4e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.571283  normal  0.0123708 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32480  hydrolase, TatD family  51.54 
 
 		 285 aa  229  4e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0851  TatD-related deoxyribonuclease  45.72 
 
 		 310 aa  228  8e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.581553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1281  hydrolase, TatD family  52.25 
 
 		 301 aa  225  6e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000534361 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3858  TatD family hydrolase  49.64 
 
 		 275 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0587  hydrolase, TatD family  51.81 
 
 		 328 aa  221  9e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0643  hydrolase, TatD family  47.39 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1211  TatD family hydrolase  46.74 
 
 		 295 aa  216  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.515901  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0176  TatD family hydrolase  49.3 
 
 		 274 aa  216  5e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.487487 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3234  hydrolase, TatD family  45.99 
 
 		 281 aa  215  5.9999999999999996e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2730  TatD-related deoxyribonuclease  41.37 
 
 		 305 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13290  hydrolase, TatD family  44.14 
 
 		 374 aa  211  9e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4644  TatD family hydrolase  47.18 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4351  TatD family hydrolase  47.18 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0254021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1931  TatD family hydrolase  48.76 
 
 		 285 aa  207  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4265  TatD-related deoxyribonuclease  47.08 
 
 		 265 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11027  deoxyribonuclease tatD (yjjV protein)  47.27 
 
 		 264 aa  206  5e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.789199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4802  TatD family hydrolase  46.18 
 
 		 283 aa  202  7e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  41.85 
 
 		 256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1956  TatD-related deoxyribonuclease  40.14 
 
 		 303 aa  195  6e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.942839 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  41.95 
 
 		 464 aa  191  8e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  39.41 
 
 		 257 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  37.31 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  42.86 
 
 		 257 aa  186  5e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  42.37 
 
 		 462 aa  185  6e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  40.25 
 
 		 606 aa  186  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1552  Mg-dependent DNase  37.17 
 
 		 319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  38.66 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  39.57 
 
 		 457 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  40.96 
 
 		 258 aa  183  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  36.94 
 
 		 256 aa  183  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  38.43 
 
 		 256 aa  183  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  39.11 
 
 		 458 aa  182  7e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  41.85 
 
 		 256 aa  181  9.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  37.41 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  37.55 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  37.55 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  37.55 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  37.55 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  37.41 
 
 		 255 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  41.53 
 
 		 458 aa  180  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5258  hydrolase, TatD family  43.66 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  37.55 
 
 		 255 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  37.17 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1248  hydrolase, TatD family  40.15 
 
 		 326 aa  179  4e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116067 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  40.6 
 
 		 258 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  37.78 
 
 		 255 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  43.35 
 
 		 271 aa  178  8e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  40.89 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  36.06 
 
 		 256 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  37.17 
 
 		 255 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  32.34 
 
 		 256 aa  176  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  42.31 
 
 		 258 aa  176  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  35.93 
 
 		 255 aa  175  8e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  36.12 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3632  hydrolase, TatD family  40.22 
 
 		 262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.508824  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  37.87 
 
 		 462 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  37.41 
 
 		 259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  39.18 
 
 		 255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  40.74 
 
 		 270 aa  172  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  39.11 
 
 		 267 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  41.7 
 
 		 461 aa  171  9e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  39.93 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  39.93 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  33.45 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  33.82 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0185  TatD family hydrolase  35.99 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  39.26 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  36.7 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2202  hypothetical protein  39.55 
 
 		 260 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  35.79 
 
 		 262 aa  169  6e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  36.7 
 
 		 255 aa  169  6e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  37.69 
 
 		 260 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  34.31 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  39.18 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  40.6 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  35.79 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  35.51 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1636  TatD family hydrolase  39.85 
 
 		 287 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  38.43 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.591757 
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  37.87 
 
 		 263 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  37.31 
 
 		 258 aa  165  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3391  TatD family hydrolase  37.76 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650196 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>