More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0721 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0721  hydrolase, TatD family  100 
 
 
280 aa  570  1e-161  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00103897  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0185  TatD family hydrolase  55.68 
 
 
278 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2230  hydrolase, TatD family  54.95 
 
 
273 aa  295  4e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0074  TatD-related deoxyribonuclease  49.45 
 
 
276 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3219  hydrolase, TatD family  50.55 
 
 
272 aa  265  5e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0780  hydrolase, TatD family  50.55 
 
 
273 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  41.57 
 
 
457 aa  190  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  38.67 
 
 
257 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  38.4 
 
 
268 aa  183  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  34.75 
 
 
464 aa  176  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  33.86 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  35.97 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  34.25 
 
 
462 aa  170  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  33.99 
 
 
256 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  36.76 
 
 
606 aa  169  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  40.08 
 
 
264 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  38.35 
 
 
270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  37.01 
 
 
462 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  32.94 
 
 
260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  41.11 
 
 
261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  39.69 
 
 
258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0819  TatD family hydrolase  33.46 
 
 
257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.193936  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  40.7 
 
 
258 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32480  hydrolase, TatD family  37.65 
 
 
285 aa  162  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0980  hydrolase, TatD family  33.33 
 
 
276 aa  162  6e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  37.31 
 
 
257 aa  161  9e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  36.29 
 
 
259 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3661  TatD family hydrolase  34.56 
 
 
269 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  39.3 
 
 
258 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  39.06 
 
 
270 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  33.6 
 
 
255 aa  160  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0308  hydrolase, TatD family  33.6 
 
 
254 aa  160  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4702  hydrolase, TatD family  39.08 
 
 
265 aa  159  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4557  hydrolase, TatD family  38.7 
 
 
265 aa  159  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.204432 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  34.78 
 
 
258 aa  159  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  37.02 
 
 
267 aa  159  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  35.16 
 
 
260 aa  159  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  32.94 
 
 
256 aa  159  7e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  37.7 
 
 
268 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  33.72 
 
 
271 aa  158  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  32.54 
 
 
255 aa  158  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  32.94 
 
 
256 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2940  Sec-independent protein translocase TatD  34.77 
 
 
273 aa  157  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.355408  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  36.86 
 
 
256 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  34.12 
 
 
257 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4186  TatD family hydrolase  38.7 
 
 
265 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  34.25 
 
 
255 aa  156  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0715  Mg-dependent DNase  33.99 
 
 
258 aa  156  3e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  35.86 
 
 
256 aa  156  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  35.97 
 
 
268 aa  155  6e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  35.77 
 
 
458 aa  155  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  34.66 
 
 
256 aa  155  8e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  35.29 
 
 
256 aa  155  9e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  34.38 
 
 
257 aa  155  9e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  33.85 
 
 
257 aa  155  9e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  34.77 
 
 
260 aa  155  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  32.54 
 
 
255 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  35.41 
 
 
262 aa  154  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  35.52 
 
 
262 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  32.54 
 
 
255 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  32.54 
 
 
255 aa  153  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  32.54 
 
 
255 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1938  TatD-related deoxyribonuclease  36.02 
 
 
259 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  35.46 
 
 
258 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  32.54 
 
 
255 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  33.98 
 
 
258 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  38.13 
 
 
264 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0541  hydrolase, TatD family  34.77 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000604201 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  32.54 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  32.54 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  38.28 
 
 
259 aa  152  5e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2645  TatD family hydrolase  33.59 
 
 
262 aa  152  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  32.54 
 
 
255 aa  152  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  34.39 
 
 
461 aa  152  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  37.25 
 
 
256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  36.72 
 
 
253 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  34.87 
 
 
263 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  33.47 
 
 
256 aa  152  8e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  36.19 
 
 
257 aa  152  8e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0316  TatD family hydrolase  42 
 
 
257 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  0.040307 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1985  TatD family hydrolase  33.59 
 
 
262 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  35 
 
 
458 aa  151  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  33.46 
 
 
255 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1515  TatD family hydrolase  37.6 
 
 
266 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  35.16 
 
 
267 aa  150  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  35.46 
 
 
271 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  34.65 
 
 
258 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2265  TatD family hydrolase  34.35 
 
 
266 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.716983 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  30.16 
 
 
256 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  34.34 
 
 
273 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  34.36 
 
 
263 aa  150  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  32.94 
 
 
265 aa  150  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0090  hydrolase, TatD family  34.11 
 
 
255 aa  150  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00880503  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1656  hydrolase, TatD family  34.62 
 
 
269 aa  150  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  31.35 
 
 
256 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  33.07 
 
 
262 aa  150  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  31.78 
 
 
258 aa  149  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  34.9 
 
 
259 aa  149  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  39.92 
 
 
261 aa  149  6e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0910  TatD family hydrolase  33.07 
 
 
251 aa  149  7e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>