More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_32480 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_32480  hydrolase, TatD family  100 
 
 		 285 aa  575  1.0000000000000001e-163  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0643  hydrolase, TatD family  68.38 
 
 		 256 aa  330  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4644  TatD family hydrolase  62.09 
 
 		 283 aa  326  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4351  TatD family hydrolase  62.09 
 
 		 283 aa  326  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0254021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1931  TatD family hydrolase  64.34 
 
 		 285 aa  326  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4265  TatD-related deoxyribonuclease  62.69 
 
 		 265 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1511  hydrolase, TatD family  61.24 
 
 		 293 aa  309  4e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234409  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3234  hydrolase, TatD family  61.87 
 
 		 281 aa  306  3e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4802  TatD family hydrolase  62.02 
 
 		 283 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11027  deoxyribonuclease tatD (yjjV protein)  63.18 
 
 		 264 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.789199 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4560  hydrolase, TatD family  61.39 
 
 		 280 aa  297  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0980  hydrolase, TatD family  50.76 
 
 		 276 aa  260  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3167  TatD family hydrolase  47.67 
 
 		 285 aa  240  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8621  Mg-dependent DNase  45.58 
 
 		 286 aa  238  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0766  TatD family hydrolase  52.55 
 
 		 274 aa  230  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3965  TatD-related deoxyribonuclease  50.39 
 
 		 274 aa  221  8e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.659781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1005  hydrolase TatD family  50 
 
 		 272 aa  217  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1043  hydrolase, TatD family  47.46 
 
 		 274 aa  216  5e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.322597  normal  0.991725 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03330  hydrolase, TatD family  46.21 
 
 		 287 aa  214  9.999999999999999e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.849452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0176  TatD family hydrolase  47.19 
 
 		 274 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.487487 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0725  TatD family hydrolase  47.1 
 
 		 309 aa  210  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075899 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4069  hydrolase, TatD family  44.56 
 
 		 307 aa  210  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.344791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05370  hydrolase, TatD family  48.29 
 
 		 317 aa  210  2e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0586524  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0398  TatD-related deoxyribonuclease  43.88 
 
 		 306 aa  210  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  43.14 
 
 		 256 aa  209  4e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1211  TatD family hydrolase  45.53 
 
 		 295 aa  205  7e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.515901  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  42.63 
 
 		 255 aa  201  8e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  42.63 
 
 		 255 aa  201  8e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  42.63 
 
 		 255 aa  201  8e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  43.03 
 
 		 255 aa  201  8e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  42.63 
 
 		 255 aa  201  8e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  42.63 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  41.83 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  42.63 
 
 		 255 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0903  hydrolase, TatD family  47.67 
 
 		 287 aa  200  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153201  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  42.97 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  41.04 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  41.67 
 
 		 255 aa  199  6e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  43.03 
 
 		 255 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2730  TatD-related deoxyribonuclease  40.73 
 
 		 305 aa  196  3e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0972  hydrolase, TatD family  43.06 
 
 		 303 aa  195  5.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.571283  normal  0.0123708 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  41.43 
 
 		 255 aa  195  6e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1281  hydrolase, TatD family  45.14 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000534361 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0781  TatD family hydrolase  43.06 
 
 		 322 aa  193  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.063357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0587  hydrolase, TatD family  42.7 
 
 		 328 aa  192  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  42.06 
 
 		 259 aa  192  5e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  41.96 
 
 		 256 aa  192  7e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30330  Mg-dependent DNase  40.21 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0666529  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3858  TatD family hydrolase  47.76 
 
 		 275 aa  191  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13290  hydrolase, TatD family  42.07 
 
 		 374 aa  189  5e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  39.45 
 
 		 464 aa  188  7e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  38.82 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  35.77 
 
 		 256 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  39.53 
 
 		 257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  41.11 
 
 		 253 aa  182  7e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl047  Mg2+ dependent DNAse  35.91 
 
 		 266 aa  182  7e-45  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  35.77 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  37.88 
 
 		 265 aa  178  7e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  38.65 
 
 		 256 aa  178  8e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  38.1 
 
 		 258 aa  178  9e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  39 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  40.16 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  38.22 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  40.77 
 
 		 457 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  36.47 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  38.74 
 
 		 606 aa  176  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  42.64 
 
 		 261 aa  176  4e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  39.22 
 
 		 462 aa  175  6e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  36.58 
 
 		 260 aa  176  6e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  40.32 
 
 		 259 aa  175  8e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0768  TatD family deoxyribonuclease  33.46 
 
 		 266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.465027  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  38.13 
 
 		 258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2547  hydrolase, TatD family  38.49 
 
 		 265 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234305  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01096  predicted metallodependent hydrolase  37.93 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0276018  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0851  TatD-related deoxyribonuclease  37.66 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.581553  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  40.81 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  35.06 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  36.72 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  41.29 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2501  putative metallodependent hydrolase  37.93 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0673622  unclonable  0.0000000127791 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1222  putative metallodependent hydrolase  37.93 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128858  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1956  TatD-related deoxyribonuclease  37.5 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.942839 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01104  hypothetical protein  37.93 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0293758  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  36.47 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2224  putative metallodependent hydrolase  38.11 
 
 		 265 aa  171  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000510394  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  36.72 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1479  putative metallodependent hydrolase  38.11 
 
 		 265 aa  170  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000171284  hitchhiker  0.0000000124971 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  37.5 
 
 		 257 aa  170  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2027  putative metallodependent hydrolase  38.11 
 
 		 265 aa  170  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  hitchhiker  0.00000164226 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1221  putative metallodependent hydrolase  38.11 
 
 		 265 aa  170  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193485  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1938  TatD-related deoxyribonuclease  35.97 
 
 		 259 aa  169  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  37.5 
 
 		 257 aa  170  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1993  TatD family deoxyribonuclease  39.11 
 
 		 282 aa  169  5e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.776931  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  41.18 
 
 		 264 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  31.76 
 
 		 256 aa  169  6e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0715  Mg-dependent DNase  36.54 
 
 		 258 aa  169  6e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  37.01 
 
 		 258 aa  168  8e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0819  TatD family hydrolase  36.96 
 
 		 257 aa  168  9e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.193936  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  39.92 
 
 		 258 aa  168  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  36.05 
 
 		 462 aa  168  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>