More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1521 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1521  Sec-independent protein translocase TatD  100 
 
 		 265 aa  539  9.999999999999999e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0926881 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4206  Sec-independent protein translocase TatD  64.09 
 
 		 261 aa  347  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1779  hydrolase, TatD family  60.77 
 
 		 265 aa  339  4e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1752  hydrolase, TatD family  60.77 
 
 		 265 aa  339  4e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1018  TatD family hydrolase  61 
 
 		 261 aa  330  1e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.195274  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2940  Sec-independent protein translocase TatD  58.43 
 
 		 273 aa  329  3e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.355408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0740  hydrolase, TatD family  57.98 
 
 		 270 aa  318  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0489  hydrolase, TatD family  60.23 
 
 		 281 aa  319  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.868901 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2068  TatD-related deoxyribonuclease  55.86 
 
 		 262 aa  298  8e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04351  putative deoxyribonuclease, TatD family  54.3 
 
 		 277 aa  286  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0604  TatD-related deoxyribonuclease  54.3 
 
 		 262 aa  283  2.0000000000000002e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16661  TatD family deoxyribonuclease  50.58 
 
 		 264 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1579  putative deoxyribonuclease, TatD family  48.64 
 
 		 264 aa  272  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16771  TatD family deoxyribonuclease  47.86 
 
 		 264 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16901  TatD family deoxyribonuclease  48.25 
 
 		 264 aa  268  8e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16081  TatD family deoxyribonuclease  50.2 
 
 		 261 aa  266  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1017  putative deoxyribonuclease, TatD family  48.02 
 
 		 263 aa  257  2e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18871  TatD family deoxyribonuclease  48.02 
 
 		 263 aa  257  2e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  44.75 
 
 		 259 aa  205  8e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  43.58 
 
 		 270 aa  204  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  43.46 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  41.86 
 
 		 268 aa  203  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  37.45 
 
 		 256 aa  202  4e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  44.83 
 
 		 273 aa  202  6e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  45.98 
 
 		 258 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  45.59 
 
 		 258 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  38.76 
 
 		 255 aa  192  6e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  45.04 
 
 		 258 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  41.73 
 
 		 267 aa  191  9e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  43.19 
 
 		 257 aa  189  5e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  43.19 
 
 		 257 aa  189  5e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  39.85 
 
 		 260 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  44.57 
 
 		 256 aa  188  9e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  41.18 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  44.23 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  39.47 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0030  hydrolase, TatD family  44.23 
 
 		 263 aa  185  6e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.572785  normal  0.0962999 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  39.85 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  40.16 
 
 		 262 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  39.61 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  39.56 
 
 		 267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  39 
 
 		 271 aa  182  5.0000000000000004e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  38.08 
 
 		 457 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  40.62 
 
 		 265 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  40.23 
 
 		 263 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  40.3 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  40.62 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  38.61 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  37.31 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  41.15 
 
 		 258 aa  179  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  39.84 
 
 		 263 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  40.31 
 
 		 263 aa  179  4.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  40.15 
 
 		 263 aa  179  5.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  38.22 
 
 		 257 aa  178  5.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  40.34 
 
 		 261 aa  178  7e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  37.93 
 
 		 459 aa  178  7e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0793  TatD family hydrolase  36.86 
 
 		 260 aa  178  8e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  40.16 
 
 		 263 aa  178  9e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  39.19 
 
 		 267 aa  178  9e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1693  putative metallodependent hydrolase  39.47 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0223862  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  39.7 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3491  putative metallodependent hydrolase  39.47 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  0.0349317 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1585  putative metallodependent hydrolase  39.47 
 
 		 269 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000288307  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  37.31 
 
 		 262 aa  176  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2258  TatD-related deoxyribonuclease  41.06 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  38.85 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1926  TatD family hydrolase  40.93 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  39.08 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  40.31 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  36.82 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  37.21 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  36.4 
 
 		 258 aa  176  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  39.85 
 
 		 258 aa  176  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  43.19 
 
 		 259 aa  175  6e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2048  TatD-related deoxyribonuclease  40.31 
 
 		 262 aa  175  6e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  41.04 
 
 		 259 aa  175  8e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  39.85 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1594  putative metallodependent hydrolase  40.15 
 
 		 265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.118654  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  39.92 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2329  TatD family hydrolase  40.78 
 
 		 265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.493356  normal  0.509317 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0819  TatD family hydrolase  36.61 
 
 		 257 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.193936  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  40.93 
 
 		 262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1914  TatD family hydrolase  37.79 
 
 		 262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000354209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  40.78 
 
 		 262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  37.74 
 
 		 454 aa  172  3.9999999999999995e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  39.69 
 
 		 264 aa  172  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1452  Sec-independent protein translocase TatD  40.16 
 
 		 260 aa  172  5e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.350253  hitchhiker  0.000933901 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2167  putative metallodependent hydrolase  40.84 
 
 		 265 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  hitchhiker  0.000000000251924 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1984  putative metallodependent hydrolase  40.84 
 
 		 265 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000140367  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1316  putative metallodependent hydrolase  40.84 
 
 		 265 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.211046  hitchhiker  0.00000000025238 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2706  TatD-related deoxyribonuclease  39.61 
 
 		 263 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1301  putative metallodependent hydrolase  40.84 
 
 		 265 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0214431  hitchhiker  0.0000000000156726 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1278  putative metallodependent hydrolase  40.84 
 
 		 265 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.558923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  38.85 
 
 		 257 aa  171  9e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  36.72 
 
 		 464 aa  171  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  35.5 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  38.31 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  37.4 
 
 		 462 aa  170  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0675  putative TatD-related deoxyribonuclease  40.39 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0191347  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1720  TatD family hydrolase  38.64 
 
 		 269 aa  170  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>