More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0883 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0883  mttC protein, putative  100 
 
 
263 aa  544  1e-154  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.162924  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  42.64 
 
 
268 aa  196  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  38.19 
 
 
256 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  37.93 
 
 
263 aa  176  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  39.92 
 
 
255 aa  175  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  39.92 
 
 
255 aa  175  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  39.92 
 
 
255 aa  175  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  39.92 
 
 
255 aa  175  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  38.58 
 
 
256 aa  175  8e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  39.53 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  40.16 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  39.53 
 
 
255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  39.53 
 
 
255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  39.53 
 
 
255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  37.25 
 
 
257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  38.74 
 
 
255 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  37.31 
 
 
256 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  39.13 
 
 
255 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  37.98 
 
 
258 aa  169  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  39.13 
 
 
255 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  38.22 
 
 
257 aa  169  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  38.22 
 
 
257 aa  169  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  37.6 
 
 
251 aa  169  5e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  36.88 
 
 
256 aa  168  7e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  37.26 
 
 
259 aa  168  9e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  39.38 
 
 
260 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  37.21 
 
 
262 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  38.08 
 
 
264 aa  166  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  34.36 
 
 
255 aa  166  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  36.43 
 
 
263 aa  166  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  36.08 
 
 
270 aa  165  8e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  38.7 
 
 
459 aa  165  8e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  36.82 
 
 
263 aa  165  9e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  39 
 
 
260 aa  165  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  36.05 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  36.82 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2940  Sec-independent protein translocase TatD  37.5 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.355408  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  37.79 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  34.6 
 
 
256 aa  163  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0265  hydrolase, TatD family  34.36 
 
 
253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0321314  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  37.5 
 
 
253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  37.22 
 
 
264 aa  162  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  36.36 
 
 
265 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  34.78 
 
 
256 aa  161  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2329  TatD family hydrolase  38.22 
 
 
265 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.493356  normal  0.509317 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  36.86 
 
 
261 aa  160  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  37.17 
 
 
269 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  36.82 
 
 
263 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  36.29 
 
 
462 aa  159  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  36.43 
 
 
271 aa  159  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3593  TatD-related deoxyribonuclease  36.68 
 
 
267 aa  159  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.520657 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  38.11 
 
 
257 aa  159  3e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  38.08 
 
 
263 aa  159  5e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  34.36 
 
 
256 aa  159  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  38.08 
 
 
263 aa  158  7e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  35.25 
 
 
258 aa  158  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  37.84 
 
 
267 aa  158  7e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  36.7 
 
 
267 aa  158  7e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  35.14 
 
 
256 aa  158  8e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  36.96 
 
 
255 aa  158  8e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1984  hydrolase, TatD family  37.64 
 
 
269 aa  158  8e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902783  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2159  hypothetical protein  41.59 
 
 
228 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575191  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0675  putative TatD-related deoxyribonuclease  37.84 
 
 
265 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0191347  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  37.16 
 
 
606 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  36.88 
 
 
265 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  38.17 
 
 
256 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  37.35 
 
 
255 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  37.89 
 
 
258 aa  156  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02785  Sec-independent protein translocase protein TatD  34.75 
 
 
255 aa  156  4e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3632  hydrolase, TatD family  35.14 
 
 
262 aa  156  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.508824  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  35.25 
 
 
258 aa  155  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  33.59 
 
 
255 aa  156  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2068  TatD-related deoxyribonuclease  35.41 
 
 
262 aa  155  6e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0555  TatD family hydrolase  37.45 
 
 
265 aa  155  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0819  TatD family hydrolase  36.29 
 
 
257 aa  155  6e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.193936  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  36.15 
 
 
462 aa  155  7e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1922  hypothetical protein  36.15 
 
 
256 aa  155  7e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  33.59 
 
 
262 aa  155  7e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1720  TatD family hydrolase  36.98 
 
 
269 aa  155  8e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.149268 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  35.55 
 
 
255 aa  154  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  35.97 
 
 
273 aa  154  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  34.87 
 
 
258 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0567  hydrolase, TatD family  34.24 
 
 
256 aa  154  1e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3391  TatD family hydrolase  35.58 
 
 
290 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650196 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1278  TatD family hydrolase  33.2 
 
 
259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0920  hydrolase  36.15 
 
 
269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  34.6 
 
 
256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0604  hydrolase, TatD family  35.4 
 
 
269 aa  153  4e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.598066  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  34.75 
 
 
271 aa  152  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0706  TatD family hydrolase  34.5 
 
 
255 aa  152  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  33.2 
 
 
265 aa  152  7e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  34.75 
 
 
457 aa  152  8e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1779  hydrolase, TatD family  35.16 
 
 
265 aa  151  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1752  hydrolase, TatD family  35.16 
 
 
265 aa  151  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1799  hydrolase, TatD family  34.88 
 
 
257 aa  151  8.999999999999999e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.339563  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04351  putative deoxyribonuclease, TatD family  36.82 
 
 
277 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  35.71 
 
 
254 aa  151  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2258  TatD-related deoxyribonuclease  34.6 
 
 
264 aa  150  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  35.88 
 
 
258 aa  151  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  35.36 
 
 
458 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>