69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1952 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1952  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 481 aa  980    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000720024  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1667  radical SAM domain-containing protein  64.14 
 
 		 491 aa  587  1e-166  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0738152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0203  Radical SAM domain protein  61.78 
 
 		 511 aa  560  1e-158  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.092669 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1676  Elongator protein 3/MiaB/NifB  61.11 
 
 		 426 aa  534  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.560297  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0733  Radical SAM domain protein  55.17 
 
 		 423 aa  475  1e-133  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000179291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0047  Radical SAM domain protein  53.7 
 
 		 426 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1890  radical SAM domain-containing protein  47.21 
 
 		 440 aa  360  4e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.835954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3074  Radical SAM domain protein  42.45 
 
 		 431 aa  350  4e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1766  radical SAM domain-containing protein  46.39 
 
 		 443 aa  348  1e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1302  radical SAM domain-containing protein  40.6 
 
 		 445 aa  306  7e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110217  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0495  radical SAM domain-containing protein  41.49 
 
 		 443 aa  302  1e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0886  radical SAM domain-containing protein  41.3 
 
 		 441 aa  300  4e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73593  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3386  Radical SAM domain protein  39.44 
 
 		 443 aa  296  5e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0663552  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0860  Radical SAM domain protein  38.98 
 
 		 441 aa  295  9e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2730  radical SAM family protein  40.37 
 
 		 441 aa  295  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2996  radical SAM domain-containing protein  39.72 
 
 		 444 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2405  radical SAM domain-containing protein  38.97 
 
 		 418 aa  278  1e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000316663  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0061  Radical SAM domain protein  40 
 
 		 421 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000135006  hitchhiker  0.00291545 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1234  Radical SAM domain protein  38.37 
 
 		 440 aa  268  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2377  radical SAM family protein  38.78 
 
 		 446 aa  253  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.208392  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1487  Radical SAM domain protein  38.31 
 
 		 446 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1582  Radical SAM domain protein  38.3 
 
 		 446 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1490  radical SAM domain-containing protein  38 
 
 		 444 aa  222  9e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.221891 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2171  radical SAM domain-containing protein  40.18 
 
 		 427 aa  221  3e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0654  radical SAM domain-containing protein  26.35 
 
 		 303 aa  52.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00641861  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0022  radical SAM domain-containing protein  29.73 
 
 		 360 aa  53.1  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2622  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  27.27 
 
 		 427 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1064  radical SAM domain-containing protein  29.84 
 
 		 364 aa  52.8  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2799  radical SAM domain-containing protein  28.21 
 
 		 290 aa  51.2  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0407  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.57 
 
 		 466 aa  50.1  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0911  radical SAM domain-containing protein  23.21 
 
 		 287 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.833054 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0989  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.51 
 
 		 370 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.197702  normal  0.914992 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0679  hypothetical protein  24.83 
 
 		 310 aa  50.1  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0843  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  27.22 
 
 		 418 aa  49.7  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0985  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.51 
 
 		 370 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.637479  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2248  radical SAM domain-containing protein  30.82 
 
 		 332 aa  48.9  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000187282  normal  0.0755271 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0813  radical SAM family protein  24.15 
 
 		 298 aa  48.9  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.152673  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.54 
 
 		 317 aa  48.9  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2194  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.74 
 
 		 370 aa  48.5  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0734508  normal  0.0502298 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1068  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.98 
 
 		 370 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194583  normal  0.0439082 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2923  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.54 
 
 		 369 aa  48.5  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273757  normal  0.545573 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1109  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.98 
 
 		 370 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.038115  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4222  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.98 
 
 		 370 aa  47.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.987701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0630  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.98 
 
 		 370 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1061  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.76 
 
 		 369 aa  47.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0681  radical SAM family protein  26.42 
 
 		 290 aa  47.8  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.414867 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2441  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.3 
 
 		 395 aa  47.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0164465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1689  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.1 
 
 		 376 aa  47.4  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0779  radical SAM domain-containing protein  34.25 
 
 		 336 aa  47  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1148  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB, putative  29.93 
 
 		 276 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0665  radical SAM domain-containing protein  24.24 
 
 		 297 aa  46.2  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.513594 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0055  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.69 
 
 		 325 aa  45.4  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0195901 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1956  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  23.27 
 
 		 423 aa  45.8  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1033  radical SAM domain-containing protein  23.21 
 
 		 287 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  23.15 
 
 		 377 aa  45.8  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2450  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.56 
 
 		 359 aa  44.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1468  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.76 
 
 		 388 aa  45.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.724446  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1006  radical SAM family protein  24.89 
 
 		 336 aa  45.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  27.48 
 
 		 351 aa  45.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1706  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26 
 
 		 370 aa  44.3  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0251054  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1648  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.44 
 
 		 362 aa  44.3  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.918642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2757  Radical SAM domain protein  24.02 
 
 		 462 aa  43.9  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1486  radical SAM family protein  27.78 
 
 		 292 aa  43.5  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2288  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.35 
 
 		 375 aa  43.5  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1770  radical SAM domain-containing protein  22.02 
 
 		 287 aa  43.5  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.201175  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0116  Elongator protein 3/MiaB/NifB  22.57 
 
 		 461 aa  43.5  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1030  Radical SAM domain protein  23.23 
 
 		 304 aa  43.5  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.78 
 
 		 296 aa  43.5  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2854  radical SAM domain-containing protein  24.39 
 
 		 337 aa  43.1  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>