160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0943 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0943  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
287 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0911  radical SAM domain-containing protein  80.14 
 
 
287 aa  473  1e-132  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.833054 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1033  radical SAM domain-containing protein  79.44 
 
 
287 aa  471  1e-132  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1770  radical SAM domain-containing protein  78.75 
 
 
287 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.201175  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0512  radical SAM domain-containing protein  60.07 
 
 
491 aa  345  6e-94  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.158097  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3389  hypothetical protein  24.84 
 
 
215 aa  59.3  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000102267  normal  0.0705776 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  25.56 
 
 
355 aa  58.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0301  radical SAM family Fe-S protein  24.86 
 
 
206 aa  58.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.239452  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  24.81 
 
 
331 aa  56.6  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0853  radical SAM domain-containing protein  23.01 
 
 
332 aa  56.2  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.796243 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  29.31 
 
 
395 aa  56.2  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  25.73 
 
 
393 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.92 
 
 
394 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  32.38 
 
 
397 aa  54.3  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  21.97 
 
 
335 aa  54.7  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0151075 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  26.74 
 
 
394 aa  54.3  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  26.47 
 
 
355 aa  53.9  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3080  Radical SAM domain protein  23.08 
 
 
351 aa  53.9  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  24.71 
 
 
399 aa  53.1  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  30.84 
 
 
372 aa  53.1  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1766  radical SAM domain-containing protein  27.22 
 
 
443 aa  53.1  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  23.35 
 
 
393 aa  52.8  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  30.94 
 
 
359 aa  52.4  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  22.78 
 
 
351 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  25.88 
 
 
391 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4316  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  24.75 
 
 
338 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904735  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  23.97 
 
 
367 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  22.78 
 
 
351 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0231  radical SAM family protein  34.48 
 
 
445 aa  51.6  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0106929  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  25.86 
 
 
394 aa  52  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  22.55 
 
 
390 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2110  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  21.03 
 
 
356 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163596  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1371  radical SAM domain-containing protein  30.25 
 
 
457 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145601 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  26.59 
 
 
396 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  33.04 
 
 
378 aa  51.2  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  26.92 
 
 
363 aa  50.8  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  31.73 
 
 
393 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2552  radical SAM family protein  27.43 
 
 
340 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  23.35 
 
 
394 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  24.85 
 
 
397 aa  50.8  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  25.38 
 
 
415 aa  50.4  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0938  radical SAM family Fe-S protein  27.75 
 
 
381 aa  50.8  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000426541  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1217  Radical SAM domain protein  25 
 
 
343 aa  50.4  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0163769  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 
384 aa  50.8  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  28.79 
 
 
349 aa  50.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0458  radical SAM domain-containing protein  26.77 
 
 
359 aa  49.7  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2248  radical SAM domain-containing protein  29.01 
 
 
332 aa  49.7  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000187282  normal  0.0755271 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  29.1 
 
 
317 aa  49.7  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  26.98 
 
 
394 aa  49.7  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  26.83 
 
 
379 aa  49.3  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  30.07 
 
 
335 aa  49.3  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  26.61 
 
 
422 aa  49.3  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  23.5 
 
 
393 aa  49.3  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1559  Radical SAM domain protein  27.73 
 
 
327 aa  49.3  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0438  radical SAM domain-containing protein  25.37 
 
 
390 aa  48.9  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.777378  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0173  cofactor modifying protein (cmo)  26.09 
 
 
301 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  27.27 
 
 
330 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1226  Radical SAM domain protein  25.95 
 
 
200 aa  48.9  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  30.63 
 
 
496 aa  48.5  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  21.84 
 
 
351 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.136733 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1930  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.82 
 
 
319 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  24.81 
 
 
407 aa  48.5  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  27.14 
 
 
409 aa  48.9  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2660  Fe-S oxidoreductase, putative coenzyme synthesis protein  24.04 
 
 
344 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2377  radical SAM family protein  22.49 
 
 
446 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.208392  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  24 
 
 
325 aa  47.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  24.61 
 
 
491 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1487  Radical SAM domain protein  22.49 
 
 
446 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2056  Radical SAM domain protein  23.98 
 
 
340 aa  48.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  33.01 
 
 
290 aa  47.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1358  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  22.41 
 
 
479 aa  48.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  21.93 
 
 
330 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00116324  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  23.81 
 
 
399 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  24.43 
 
 
480 aa  47  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2361  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  21.76 
 
 
495 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.968196  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  31.86 
 
 
330 aa  47  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  24.24 
 
 
873 aa  47  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3912  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  22.12 
 
 
475 aa  47  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  25 
 
 
338 aa  47  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  22.81 
 
 
449 aa  46.6  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2402  radical SAM domain-containing protein  25.68 
 
 
297 aa  46.2  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4244  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  21.55 
 
 
484 aa  46.6  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  27.43 
 
 
346 aa  46.6  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1586  radical SAM family protein  23.28 
 
 
356 aa  46.2  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4173  Radical SAM domain protein  34.04 
 
 
344 aa  46.6  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1019  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.63 
 
 
328 aa  46.2  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.33881  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1327  Radical SAM domain protein  25.38 
 
 
375 aa  46.2  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000215386  hitchhiker  0.00000524996 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  23.74 
 
 
428 aa  46.2  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  28.95 
 
 
384 aa  46.2  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  25.76 
 
 
399 aa  45.8  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1582  Radical SAM domain protein  21.89 
 
 
446 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3724  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 
355 aa  45.8  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  30.09 
 
 
413 aa  45.8  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0597  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.39 
 
 
348 aa  45.8  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0739  radical SAM domain-containing protein  27.47 
 
 
347 aa  45.8  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  22.67 
 
 
382 aa  45.8  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  27.63 
 
 
439 aa  45.8  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3016  radical SAM domain-containing protein  25.69 
 
 
513 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1242  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.29 
 
 
353 aa  45.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00350809  normal  0.534968 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0734  Radical SAM domain protein  25 
 
 
401 aa  45.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>