92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1142 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1142  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 310 aa  621  1e-177  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11060  Radical SAM domain protein  59.24 
 
 		 239 aa  310  2e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00221485  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2156  radical SAM family protein  45.57 
 
 		 313 aa  310  2e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2341  Radical SAM domain protein  46.77 
 
 		 330 aa  296  3e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.109673 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2049  radical SAM domain-containing protein  51.78 
 
 		 319 aa  293  2e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0336  hypothetical protein  46.77 
 
 		 319 aa  285  9e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.300886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1638  radical SAM domain-containing protein  42.11 
 
 		 313 aa  231  9e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00824164  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0808  radical SAM domain-containing protein  45.57 
 
 		 320 aa  228  8e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0322  radical SAM domain-containing protein  40.82 
 
 		 364 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.44863  normal  0.156857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1179  radical SAM domain-containing protein  43.93 
 
 		 331 aa  223  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2416  Radical SAM domain protein  37.65 
 
 		 328 aa  219  6e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0458  Radical SAM domain protein  38.87 
 
 		 332 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0454  radical SAM domain-containing protein  39.79 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.383393  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0108  radical SAM domain-containing protein  43 
 
 		 295 aa  217  2e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0688  MoaA/NifB/PqqE family protein  39.86 
 
 		 312 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110468  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1460  Elongator protein 3/MiaB/NifB  39.4 
 
 		 312 aa  212  5.999999999999999e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1848  radical SAM domain-containing protein  37.94 
 
 		 310 aa  212  7e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0361  radical SAM domain-containing protein  40.21 
 
 		 313 aa  209  5e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.763423 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0912  Radical SAM domain protein  37.34 
 
 		 314 aa  208  9e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.883819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2377  Radical SAM domain protein  39.53 
 
 		 365 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0538  radical SAM domain-containing protein  39.94 
 
 		 329 aa  203  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1667  Radical SAM domain protein  38.41 
 
 		 321 aa  202  6e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.332302  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1223  Radical SAM domain protein  47.39 
 
 		 237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674183 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1559  Radical SAM domain protein  33.76 
 
 		 316 aa  199  5e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0969548  hitchhiker  0.000892375 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0991  Radical SAM domain protein  39.78 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1531  radical SAM domain-containing protein  37.5 
 
 		 308 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  36.48 
 
 		 680 aa  183  3e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  34.77 
 
 		 303 aa  177  3e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3606  radical SAM domain-containing protein  54.37 
 
 		 244 aa  171  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0562  radical SAM domain-containing protein  34.69 
 
 		 311 aa  169  6e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1404  radical SAM domain-containing protein  38.03 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.937371  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04120  Radical SAM domain protein  32.69 
 
 		 311 aa  166  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3462  radical SAM domain-containing protein  39.13 
 
 		 313 aa  163  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0828  Fe-S oxidoreductase  32.52 
 
 		 326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.389597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1149  radical SAM family Fe-S protein  31.91 
 
 		 326 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1962  radical SAM domain-containing protein  35.96 
 
 		 323 aa  162  7e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1760  radical SAM domain-containing protein  38.29 
 
 		 323 aa  159  4e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.265975  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  32.62 
 
 		 300 aa  159  6e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0316  Radical SAM domain protein  34.32 
 
 		 303 aa  158  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1155  Radical SAM domain protein  32.13 
 
 		 319 aa  156  3e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  34.2 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2043  Radical SAM domain protein  38.66 
 
 		 267 aa  152  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  32.81 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  33.57 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1380  radical SAM domain-containing protein  33.2 
 
 		 300 aa  149  8e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1472  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 300 aa  149  9e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1586  hypothetical protein  35.48 
 
 		 326 aa  146  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  32.81 
 
 		 300 aa  146  5e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  35.35 
 
 		 308 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3775  Radical SAM domain protein  37.2 
 
 		 266 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0530  conserved hypothetical protein, putative radical SAM domain protein  29.11 
 
 		 302 aa  132  9e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4632  radical SAM family protein  37.02 
 
 		 270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453222  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1039  radical SAM domain-containing protein  29.69 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0813206  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1292  hypothetical protein  27.11 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0855  hypothetical protein  29.52 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  6.94924e-18  unclonable  0.0000000890564 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0047  Radical SAM domain protein  27.37 
 
 		 426 aa  55.8  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0843  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  28.65 
 
 		 418 aa  52  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4173  Radical SAM domain protein  26.12 
 
 		 344 aa  50.8  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0733  Radical SAM domain protein  26.7 
 
 		 423 aa  50.4  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000179291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2551  radical SAM family protein  26.15 
 
 		 344 aa  48.9  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2571  radical SAM domain-containing protein  32.2 
 
 		 365 aa  47.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0495  radical SAM domain-containing protein  25.13 
 
 		 443 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  29.8 
 
 		 437 aa  48.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1226  Radical SAM domain protein  27.72 
 
 		 200 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0729  hypothetical protein  33.93 
 
 		 293 aa  47.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2500  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.33 
 
 		 335 aa  47.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818092  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  27.74 
 
 		 340 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2556  radical SAM family protein  25.19 
 
 		 337 aa  46.6  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  25.19 
 
 		 359 aa  46.6  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  24.66 
 
 		 329 aa  45.8  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23160  pyruvate formate-lyase activating enzyme  26.21 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0121  Radical SAM domain protein  22.92 
 
 		 461 aa  45.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000759639  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  28.68 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2999  radical SAM family protein  24.62 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4236  radical SAM family protein  30.25 
 
 		 514 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767249  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4615  radical SAM domain-containing protein  30.25 
 
 		 514 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4322  radical SAM domain-containing protein  30.25 
 
 		 514 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1830  Radical SAM domain protein  27.11 
 
 		 292 aa  44.3  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2859  hypothetical protein  23.08 
 
 		 359 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44970  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.92 
 
 		 331 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0506  pyruvate formate-lyase activating enzyme  22.41 
 
 		 238 aa  43.5  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0339577  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  28.41 
 
 		 332 aa  43.1  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0169  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.35 
 
 		 375 aa  43.1  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280654  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0932  radical SAM domain-containing protein  29.2 
 
 		 362 aa  42.7  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1953  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  22.91 
 
 		 245 aa  42.7  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2552  radical SAM family protein  26.21 
 
 		 340 aa  42.7  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1943  radical SAM family protein  26.47 
 
 		 267 aa  42.7  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.545667  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3496  radical SAM family Fe-S protein  21.86 
 
 		 437 aa  42.7  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.256122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3054  Radical SAM domain protein  29.44 
 
 		 325 aa  42.7  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.164409 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2559  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.37 
 
 		 342 aa  42.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2189  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.37 
 
 		 342 aa  42.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28518  hitchhiker  0.000000328904 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1354  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.14 
 
 		 326 aa  42.4  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.935737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>