76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0912 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0912  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 314 aa  637    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.883819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1559  Radical SAM domain protein  77.32 
 
 		 316 aa  520  1e-146  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0969548  hitchhiker  0.000892375 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1460  Elongator protein 3/MiaB/NifB  64.61 
 
 		 312 aa  411  1e-114  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1848  radical SAM domain-containing protein  62.06 
 
 		 310 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0991  Radical SAM domain protein  62.5 
 
 		 311 aa  392  1e-108  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1667  Radical SAM domain protein  59.81 
 
 		 321 aa  390  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.332302  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0688  MoaA/NifB/PqqE family protein  57.69 
 
 		 312 aa  389  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110468  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0808  radical SAM domain-containing protein  48.39 
 
 		 320 aa  288  7e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1179  radical SAM domain-containing protein  48.1 
 
 		 331 aa  286  4e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  38.94 
 
 		 680 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0454  radical SAM domain-containing protein  38.18 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.383393  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1142  radical SAM domain-containing protein  37.34 
 
 		 310 aa  208  9e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2341  Radical SAM domain protein  38.13 
 
 		 330 aa  190  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.109673 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11060  Radical SAM domain protein  38.56 
 
 		 239 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00221485  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2416  Radical SAM domain protein  37.01 
 
 		 328 aa  190  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1962  radical SAM domain-containing protein  38.18 
 
 		 323 aa  185  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0108  radical SAM domain-containing protein  43.36 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2156  radical SAM family protein  31.95 
 
 		 313 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1531  radical SAM domain-containing protein  35.56 
 
 		 308 aa  182  6e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1638  radical SAM domain-containing protein  34.29 
 
 		 313 aa  181  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00824164  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2049  radical SAM domain-containing protein  42.06 
 
 		 319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0361  radical SAM domain-containing protein  42.92 
 
 		 313 aa  179  4.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.763423 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0562  radical SAM domain-containing protein  38.59 
 
 		 311 aa  179  7e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0458  Radical SAM domain protein  41.4 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0336  hypothetical protein  38.2 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.300886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1155  Radical SAM domain protein  35.53 
 
 		 319 aa  177  3e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1586  hypothetical protein  33.23 
 
 		 326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04120  Radical SAM domain protein  34.46 
 
 		 311 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1404  radical SAM domain-containing protein  36.61 
 
 		 320 aa  172  9e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.937371  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0322  radical SAM domain-containing protein  40.34 
 
 		 364 aa  168  9e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.44863  normal  0.156857 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3462  radical SAM domain-containing protein  36.73 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1223  Radical SAM domain protein  36.74 
 
 		 237 aa  159  6e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674183 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1760  radical SAM domain-containing protein  36.88 
 
 		 323 aa  155  6e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.265975  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  32.27 
 
 		 300 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0828  Fe-S oxidoreductase  32.1 
 
 		 326 aa  150  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.389597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3606  radical SAM domain-containing protein  48.45 
 
 		 244 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0538  radical SAM domain-containing protein  39.25 
 
 		 329 aa  146  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  29.97 
 
 		 303 aa  146  6e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2377  Radical SAM domain protein  35.65 
 
 		 365 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2043  Radical SAM domain protein  40 
 
 		 267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0316  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3775  Radical SAM domain protein  35.61 
 
 		 266 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  31.6 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1149  radical SAM family Fe-S protein  30.83 
 
 		 326 aa  134  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  31.6 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1380  radical SAM domain-containing protein  31.17 
 
 		 300 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  33.81 
 
 		 310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4632  radical SAM family protein  32.31 
 
 		 270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453222  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  30.51 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0530  conserved hypothetical protein, putative radical SAM domain protein  31.58 
 
 		 302 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  31.07 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1472  radical SAM domain-containing protein  32.21 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1039  radical SAM domain-containing protein  25.68 
 
 		 231 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0813206  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1292  hypothetical protein  25.91 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1830  Radical SAM domain protein  31.52 
 
 		 292 aa  57  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0121  Radical SAM domain protein  24.79 
 
 		 461 aa  52.8  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000759639  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4316  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.81 
 
 		 338 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0855  hypothetical protein  29.32 
 
 		 278 aa  50.8  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  6.94924e-18  unclonable  0.0000000890564 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1943  radical SAM family protein  26.28 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.545667  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0309  Radical SAM domain protein  28.39 
 
 		 197 aa  48.5  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  25 
 
 		 464 aa  47.4  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2402  radical SAM domain-containing protein  24.88 
 
 		 297 aa  46.2  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01021  hypothetical protein  22.64 
 
 		 373 aa  46.2  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.816192 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  23.61 
 
 		 329 aa  46.2  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1226  Radical SAM domain protein  26.25 
 
 		 200 aa  45.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2204  radical SAM domain protein  24.06 
 
 		 383 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  26.6 
 
 		 344 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0644  Radical SAM domain protein  23.67 
 
 		 390 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.14053  normal  0.0928811 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0729  hypothetical protein  44.44 
 
 		 293 aa  44.3  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0911  radical SAM domain-containing protein  28.68 
 
 		 497 aa  43.5  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2225  Radical SAM domain protein  22.16 
 
 		 286 aa  43.9  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2571  radical SAM domain-containing protein  48.65 
 
 		 365 aa  43.5  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 359 aa  43.5  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1203  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.07 
 
 		 308 aa  43.1  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1392  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.78 
 
 		 317 aa  42.7  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0892  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.65 
 
 		 326 aa  42.7  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>