166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2225 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2225  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 286 aa  585  1e-166  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.19 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2884  Fe-S oxidoreductase  27.27 
 
 		 447 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00154845  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  26.55 
 
 		 367 aa  63.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0838  radical SAM domain-containing protein  25.57 
 
 		 465 aa  59.3  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0155744  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  22.75 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2515  radical SAM domain-containing protein  24.14 
 
 		 471 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0853  radical SAM domain-containing protein  30.83 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.796243 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  24.29 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2507  radical SAM domain-containing protein  23.01 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8972  Radical SAM domain protein  26.04 
 
 		 364 aa  56.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04330  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 336 aa  55.8  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1394  radical SAM domain-containing protein  25.14 
 
 		 451 aa  55.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  23.93 
 
 		 401 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  21.47 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  23.93 
 
 		 401 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  23.93 
 
 		 401 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  23.84 
 
 		 1002 aa  55.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1601  heme biosynthesis protein, putative  27.18 
 
 		 354 aa  54.7  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.196015  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3051  Radical SAM domain protein  24.09 
 
 		 461 aa  54.7  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.684834  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  24.59 
 
 		 396 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  27.33 
 
 		 380 aa  53.9  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1385  Radical SAM domain protein  24.35 
 
 		 417 aa  53.9  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0362532  unclonable  0.0000106904 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  24.14 
 
 		 412 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1794  cofactor modifying protein (cmo)  28.15 
 
 		 311 aa  53.9  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.420776 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  26.59 
 
 		 501 aa  53.1  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.56 
 
 		 321 aa  52.8  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000001817  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  22.16 
 
 		 450 aa  52.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  20.11 
 
 		 437 aa  52.4  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  24.72 
 
 		 331 aa  52.4  0.000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1835  hypothetical protein  23.56 
 
 		 344 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000690534  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  23.94 
 
 		 453 aa  52  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.86 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  26.97 
 
 		 332 aa  52  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  28.7 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  25.56 
 
 		 355 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  24.83 
 
 		 410 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  24.33 
 
 		 367 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1609  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  22.41 
 
 		 317 aa  51.2  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 402 aa  50.4  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  28.31 
 
 		 429 aa  50.8  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  30.6 
 
 		 372 aa  50.4  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0056  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  20.95 
 
 		 348 aa  50.4  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0808361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2761  radical SAM domain-containing protein  23.43 
 
 		 348 aa  50.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0874334  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1943  Radical SAM domain protein  22.86 
 
 		 315 aa  49.7  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.227047  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3588  radical SAM domain-containing protein  23.56 
 
 		 446 aa  49.3  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1223  Radical SAM domain protein  27.69 
 
 		 237 aa  48.9  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674183 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  30.3 
 
 		 351 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1951  radical SAM family Fe-S protein  31.07 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  29.2 
 
 		 384 aa  48.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0808  radical SAM domain-containing protein  24.26 
 
 		 320 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  22.95 
 
 		 391 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1445  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0454  radical SAM domain-containing protein  24.37 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.383393  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1930  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.16 
 
 		 319 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  24.51 
 
 		 379 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1348  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  21.05 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  23.45 
 
 		 395 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3724  Radical SAM domain protein  25.87 
 
 		 355 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  22.55 
 
 		 384 aa  48.1  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0322  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.4 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  24.19 
 
 		 378 aa  47.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  23.08 
 
 		 1005 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11060  Radical SAM domain protein  27.21 
 
 		 239 aa  47  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00221485  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1036  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.75 
 
 		 298 aa  47  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.643895  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.71 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  30.68 
 
 		 486 aa  47.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  23.39 
 
 		 422 aa  47  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0823  Radical SAM domain protein  26.19 
 
 		 463 aa  46.6  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0368  radical SAM domain-containing protein  23.33 
 
 		 574 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1759  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.41 
 
 		 356 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.103881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  26.19 
 
 		 387 aa  46.6  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2095  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  22.29 
 
 		 326 aa  46.6  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  26.92 
 
 		 434 aa  46.6  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2651  Radical SAM domain protein  20.14 
 
 		 415 aa  46.2  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.135076 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0281  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  24.63 
 
 		 351 aa  46.2  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.144373  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1702  hypothetical protein  27.97 
 
 		 292 aa  45.8  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0534868  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1785  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.35 
 
 		 351 aa  46.2  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2549  radical SAM domain-containing protein  26.14 
 
 		 216 aa  46.2  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470829  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0911  radical SAM domain-containing protein  25.95 
 
 		 497 aa  45.8  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  25.58 
 
 		 389 aa  45.8  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  24.42 
 
 		 418 aa  45.8  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1734  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  21.3 
 
 		 329 aa  45.8  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1683  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  21.24 
 
 		 327 aa  45.8  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2134  radical SAM family Fe-S protein  31.11 
 
 		 479 aa  45.8  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.71 
 
 		 298 aa  45.8  0.0009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.370128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0411  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 356 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2394  radical SAM domain protein  26.52 
 
 		 306 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0630696  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  31.82 
 
 		 474 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.44 
 
 		 399 aa  45.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  27.72 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  23.08 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  26.21 
 
 		 359 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  25.7 
 
 		 380 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  24.31 
 
 		 347 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34160  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  21.98 
 
 		 339 aa  45.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.142269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  22.27 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0506  radical SAM domain-containing protein  21.25 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00221713  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0999  Radical SAM domain protein  23.08 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1565  radical SAM domain-containing protein  24.9 
 
 		 296 aa  45.8  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>