77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1223 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1223  Radical SAM domain protein  100 
 
 
237 aa  481  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674183 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11060  Radical SAM domain protein  45.34 
 
 
239 aa  215  5e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00221485  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1142  radical SAM domain-containing protein  47.39 
 
 
310 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0108  radical SAM domain-containing protein  43.67 
 
 
295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2049  radical SAM domain-containing protein  40.27 
 
 
319 aa  188  8e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0538  radical SAM domain-containing protein  43.81 
 
 
329 aa  187  8e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0322  radical SAM domain-containing protein  42.34 
 
 
364 aa  187  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.44863  normal  0.156857 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2416  Radical SAM domain protein  45.67 
 
 
328 aa  186  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0361  radical SAM domain-containing protein  38.53 
 
 
313 aa  185  5e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.763423 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.66 
 
 
680 aa  181  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0336  hypothetical protein  40.25 
 
 
319 aa  178  5.999999999999999e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.300886  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1460  Elongator protein 3/MiaB/NifB  39.91 
 
 
312 aa  178  7e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0688  MoaA/NifB/PqqE family protein  36.29 
 
 
312 aa  177  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110468  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1638  radical SAM domain-containing protein  39.52 
 
 
313 aa  176  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00824164  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2377  Radical SAM domain protein  37.3 
 
 
365 aa  176  4e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0458  Radical SAM domain protein  40.36 
 
 
332 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1559  Radical SAM domain protein  40 
 
 
316 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0969548  hitchhiker  0.000892375 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0808  radical SAM domain-containing protein  40.19 
 
 
320 aa  171  6.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2156  radical SAM family protein  43.06 
 
 
313 aa  169  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2341  Radical SAM domain protein  36.24 
 
 
330 aa  169  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.109673 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1179  radical SAM domain-containing protein  38.79 
 
 
331 aa  167  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0991  Radical SAM domain protein  36.13 
 
 
311 aa  162  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0454  radical SAM domain-containing protein  37.1 
 
 
312 aa  162  6e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.383393  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1848  radical SAM domain-containing protein  35.22 
 
 
310 aa  159  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0912  Radical SAM domain protein  36.74 
 
 
314 aa  159  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.883819  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1667  Radical SAM domain protein  37.95 
 
 
321 aa  159  4e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.332302  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0562  radical SAM domain-containing protein  37.91 
 
 
311 aa  154  9e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1586  hypothetical protein  37.13 
 
 
326 aa  154  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  38.49 
 
 
310 aa  153  2e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1760  radical SAM domain-containing protein  36.52 
 
 
323 aa  151  8.999999999999999e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.265975  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3606  radical SAM domain-containing protein  45.57 
 
 
244 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1404  radical SAM domain-containing protein  35.71 
 
 
320 aa  149  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.937371  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1531  radical SAM domain-containing protein  34.75 
 
 
308 aa  145  6e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1155  Radical SAM domain protein  37.14 
 
 
319 aa  143  2e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04120  Radical SAM domain protein  35.93 
 
 
311 aa  142  6e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1149  radical SAM family Fe-S protein  38.17 
 
 
326 aa  142  6e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0316  Radical SAM domain protein  32.47 
 
 
303 aa  138  6e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1962  radical SAM domain-containing protein  33.63 
 
 
323 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0828  Fe-S oxidoreductase  36.78 
 
 
326 aa  136  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.389597  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3462  radical SAM domain-containing protein  35.85 
 
 
313 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  35.32 
 
 
303 aa  134  8e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3775  Radical SAM domain protein  38.05 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  33.19 
 
 
300 aa  128  7.000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1472  radical SAM domain-containing protein  31.6 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1380  radical SAM domain-containing protein  31.1 
 
 
300 aa  122  7e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4632  radical SAM family protein  37.68 
 
 
270 aa  122  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453222  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  31.1 
 
 
300 aa  121  8e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2043  Radical SAM domain protein  35.92 
 
 
267 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  31.1 
 
 
300 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0530  conserved hypothetical protein, putative radical SAM domain protein  30.36 
 
 
302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  30.63 
 
 
304 aa  118  7e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  28.11 
 
 
308 aa  102  4e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1039  radical SAM domain-containing protein  27.23 
 
 
231 aa  77  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0813206  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1292  hypothetical protein  28.31 
 
 
291 aa  65.1  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0855  hypothetical protein  24.4 
 
 
278 aa  58.9  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  6.94924e-18  unclonable  0.0000000890564 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2571  radical SAM domain-containing protein  28.82 
 
 
365 aa  56.2  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0538  tRNA-modifying enzyme  28.42 
 
 
311 aa  53.9  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.412175  normal  0.423488 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0729  hypothetical protein  29.05 
 
 
293 aa  51.6  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1943  radical SAM family protein  27.27 
 
 
267 aa  50.1  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.545667  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  28.47 
 
 
454 aa  49.3  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2225  Radical SAM domain protein  27.69 
 
 
286 aa  48.9  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  26.63 
 
 
372 aa  48.1  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2551  radical SAM family protein  24.26 
 
 
344 aa  46.2  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4172  Radical SAM domain protein  27 
 
 
338 aa  45.4  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  26.19 
 
 
329 aa  45.4  0.0009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1592  radical SAM domain-containing protein  25.93 
 
 
354 aa  45.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2556  radical SAM family protein  24.39 
 
 
337 aa  43.9  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1049  pyruvate formate lyase activating enzyme  24.44 
 
 
246 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1126  Fe-S oxidoreductase  23.21 
 
 
347 aa  43.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1593  radical SAM domain-containing protein  29.37 
 
 
354 aa  43.1  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4175  Radical SAM domain protein  21.48 
 
 
342 aa  43.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  23.64 
 
 
359 aa  42.7  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1609  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  22.7 
 
 
317 aa  42  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  25.58 
 
 
455 aa  42  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2743  radical SAM family protein  23.44 
 
 
335 aa  42  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0169  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.78 
 
 
375 aa  42  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280654  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1445  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.81 
 
 
297 aa  42  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>