104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_04120 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_04120  Radical SAM domain protein  100 
 
 
311 aa  634    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3462  radical SAM domain-containing protein  50 
 
 
313 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1404  radical SAM domain-containing protein  49.35 
 
 
320 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.937371  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1155  Radical SAM domain protein  47.57 
 
 
319 aa  303  2.0000000000000002e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1586  hypothetical protein  45.75 
 
 
326 aa  291  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1962  radical SAM domain-containing protein  43.55 
 
 
323 aa  289  4e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0562  radical SAM domain-containing protein  43.73 
 
 
311 aa  279  6e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1760  radical SAM domain-containing protein  44.69 
 
 
323 aa  278  7e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.265975  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0454  radical SAM domain-containing protein  36.45 
 
 
312 aa  195  7e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.383393  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1460  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.48 
 
 
312 aa  190  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1559  Radical SAM domain protein  35.4 
 
 
316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0969548  hitchhiker  0.000892375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1179  radical SAM domain-containing protein  35.56 
 
 
331 aa  183  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1667  Radical SAM domain protein  32.38 
 
 
321 aa  181  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.332302  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1848  radical SAM domain-containing protein  32.37 
 
 
310 aa  179  5.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0808  radical SAM domain-containing protein  33.23 
 
 
320 aa  178  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1638  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 
313 aa  176  6e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00824164  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0912  Radical SAM domain protein  34.46 
 
 
314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.883819  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0688  MoaA/NifB/PqqE family protein  32.48 
 
 
312 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110468  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0991  Radical SAM domain protein  33.44 
 
 
311 aa  172  5.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1142  radical SAM domain-containing protein  32.69 
 
 
310 aa  166  5e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0361  radical SAM domain-containing protein  33.01 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.763423 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1531  radical SAM domain-containing protein  32.49 
 
 
308 aa  159  8e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2416  Radical SAM domain protein  39.52 
 
 
328 aa  155  8e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  33.12 
 
 
680 aa  154  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0458  Radical SAM domain protein  38.16 
 
 
332 aa  150  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11060  Radical SAM domain protein  38.46 
 
 
239 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00221485  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2049  radical SAM domain-containing protein  34.91 
 
 
319 aa  142  5e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1223  Radical SAM domain protein  35.93 
 
 
237 aa  142  9e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674183 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2156  radical SAM family protein  34.01 
 
 
313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  34.12 
 
 
303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2341  Radical SAM domain protein  29.58 
 
 
330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.109673 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0108  radical SAM domain-containing protein  37.39 
 
 
295 aa  140  3e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0322  radical SAM domain-containing protein  33.01 
 
 
364 aa  139  7e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.44863  normal  0.156857 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0336  hypothetical protein  28.94 
 
 
319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.300886  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0316  Radical SAM domain protein  30.67 
 
 
303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  28.44 
 
 
304 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  30.03 
 
 
300 aa  130  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0538  radical SAM domain-containing protein  31.28 
 
 
329 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  29.39 
 
 
300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1380  radical SAM domain-containing protein  29.39 
 
 
300 aa  125  1e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0828  Fe-S oxidoreductase  34.76 
 
 
326 aa  124  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.389597  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2377  Radical SAM domain protein  29.74 
 
 
365 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  34.42 
 
 
310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 
300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1472  radical SAM domain-containing protein  32.56 
 
 
300 aa  120  3e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2043  Radical SAM domain protein  33.02 
 
 
267 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1149  radical SAM family Fe-S protein  34.36 
 
 
326 aa  117  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  32.41 
 
 
308 aa  112  9e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3775  Radical SAM domain protein  32.23 
 
 
266 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0530  conserved hypothetical protein, putative radical SAM domain protein  31.16 
 
 
302 aa  109  7.000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3606  radical SAM domain-containing protein  35.19 
 
 
244 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4632  radical SAM family protein  28.44 
 
 
270 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453222  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1292  hypothetical protein  29.93 
 
 
291 aa  81.3  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1039  radical SAM domain-containing protein  24.47 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0813206  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2571  radical SAM domain-containing protein  27.31 
 
 
365 aa  67.8  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0855  hypothetical protein  27.74 
 
 
278 aa  65.1  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  6.94924e-18  unclonable  0.0000000890564 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0729  hypothetical protein  27.65 
 
 
293 aa  63.5  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1385  radical SAM protein  28.29 
 
 
351 aa  62  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0219  Radical SAM domain protein  24.88 
 
 
337 aa  58.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0211251  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1943  radical SAM family protein  26.85 
 
 
267 aa  52.8  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.545667  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2919  Fe-S oxidoreductases  27.34 
 
 
293 aa  49.7  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.28 
 
 
334 aa  49.7  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155054 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04411  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  21.37 
 
 
356 aa  49.3  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1758  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  23.97 
 
 
361 aa  48.5  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0210  radical SAM enzyme, Cfr family  25.12 
 
 
367 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  25.23 
 
 
349 aa  48.5  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  23.12 
 
 
282 aa  48.1  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0164  radical SAM enzyme, Cfr family  23.67 
 
 
353 aa  47.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1468  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  24.88 
 
 
340 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2016  Radical SAM domain protein  25 
 
 
315 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0248343  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1708  radical SAM protein  24.19 
 
 
350 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49687  predicted protein  24.08 
 
 
369 aa  47.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.622489 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1442  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  24.88 
 
 
340 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0121  Radical SAM domain protein  25.77 
 
 
461 aa  47.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000759639  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4120  radical SAM domain-containing protein  28.03 
 
 
372 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.424935 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0354  radical SAM domain-containing protein  36.05 
 
 
337 aa  46.2  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.898506 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0932  radical SAM domain-containing protein  22.22 
 
 
362 aa  46.2  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1325  radical SAM domain-containing protein  22.54 
 
 
365 aa  46.2  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.322233  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1593  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 
354 aa  46.2  0.0008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  27.74 
 
 
329 aa  45.8  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  27.74 
 
 
329 aa  45.8  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0564  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  24.47 
 
 
243 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0566  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  24.47 
 
 
243 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4810  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  23.81 
 
 
243 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0482  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  23.53 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0425  formate acetyltransferase activating enzyme (pyruvate formate-lyase activating enzyme)  23.94 
 
 
243 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0421  formate acetyltransferase activating enzyme (pyruvate formate-lyase activating enzyme)  23.94 
 
 
243 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0510  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  23.53 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0449  radical SAM family protein  22.22 
 
 
370 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355453  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2293  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  26.09 
 
 
336 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.388191  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1064  radical SAM domain-containing protein  20.47 
 
 
365 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.468822  normal  0.968223 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12087  predicted protein  26.32 
 
 
340 aa  44.3  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0491  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  23.53 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2766  radical SAM family Fe-S protein  32.65 
 
 
340 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2970  Wyosine base formation domain protein  26.73 
 
 
345 aa  44.3  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0182  radical SAM family protein  22.83 
 
 
369 aa  43.9  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1066  radical SAM domain-containing protein  28.32 
 
 
238 aa  43.5  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0409  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  23.31 
 
 
389 aa  43.5  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.112692  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0906  radical SAM enzyme, Cfr family  22.87 
 
 
356 aa  43.5  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0513  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  23.81 
 
 
243 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>