71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0336 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0336  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  656    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.300886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2156  radical SAM family protein  56.35 
 
 		 313 aa  352  5e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2341  Radical SAM domain protein  53.35 
 
 		 330 aa  323  2e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.109673 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1142  radical SAM domain-containing protein  46.77 
 
 		 310 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11060  Radical SAM domain protein  51.93 
 
 		 239 aa  267  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00221485  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2049  radical SAM domain-containing protein  39.35 
 
 		 319 aa  222  7e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  38.46 
 
 		 680 aa  215  8e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0108  radical SAM domain-containing protein  43.14 
 
 		 295 aa  209  7e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2416  Radical SAM domain protein  37.58 
 
 		 328 aa  206  6e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1638  radical SAM domain-containing protein  36.31 
 
 		 313 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00824164  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0454  radical SAM domain-containing protein  34.36 
 
 		 312 aa  192  4e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.383393  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0361  radical SAM domain-containing protein  38.31 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.763423 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0538  radical SAM domain-containing protein  35.19 
 
 		 329 aa  187  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1667  Radical SAM domain protein  41.52 
 
 		 321 aa  186  3e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.332302  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1848  radical SAM domain-containing protein  37.94 
 
 		 310 aa  185  8e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0808  radical SAM domain-containing protein  41.55 
 
 		 320 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0688  MoaA/NifB/PqqE family protein  41.96 
 
 		 312 aa  182  8.000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110468  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1559  Radical SAM domain protein  41.94 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0969548  hitchhiker  0.000892375 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0322  radical SAM domain-containing protein  38.91 
 
 		 364 aa  179  4e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.44863  normal  0.156857 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1223  Radical SAM domain protein  40.25 
 
 		 237 aa  178  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674183 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1179  radical SAM domain-containing protein  38.91 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0458  Radical SAM domain protein  35.05 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0912  Radical SAM domain protein  38.2 
 
 		 314 aa  177  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.883819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1460  Elongator protein 3/MiaB/NifB  37.66 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2377  Radical SAM domain protein  32.75 
 
 		 365 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1531  radical SAM domain-containing protein  34.4 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0991  Radical SAM domain protein  39.66 
 
 		 311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0828  Fe-S oxidoreductase  34.14 
 
 		 326 aa  157  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.389597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0562  radical SAM domain-containing protein  34.19 
 
 		 311 aa  154  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  32.79 
 
 		 304 aa  153  4e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1472  radical SAM domain-containing protein  33.89 
 
 		 300 aa  152  5e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1962  radical SAM domain-containing protein  36.09 
 
 		 323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1149  radical SAM family Fe-S protein  29.88 
 
 		 326 aa  152  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0316  Radical SAM domain protein  31.72 
 
 		 303 aa  151  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1155  Radical SAM domain protein  34.05 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  35.58 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3606  radical SAM domain-containing protein  46.3 
 
 		 244 aa  142  7e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1404  radical SAM domain-containing protein  36.89 
 
 		 320 aa  142  8e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.937371  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1380  radical SAM domain-containing protein  35.1 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  35.58 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  31.77 
 
 		 303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2043  Radical SAM domain protein  38.16 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  32.38 
 
 		 310 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3462  radical SAM domain-containing protein  35.32 
 
 		 313 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1760  radical SAM domain-containing protein  37.33 
 
 		 323 aa  138  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.265975  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3775  Radical SAM domain protein  39.42 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04120  Radical SAM domain protein  28.94 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  30.42 
 
 		 300 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1586  hypothetical protein  31.3 
 
 		 326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0530  conserved hypothetical protein, putative radical SAM domain protein  27.78 
 
 		 302 aa  129  6e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  32.08 
 
 		 308 aa  122  6e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4632  radical SAM family protein  34.95 
 
 		 270 aa  122  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453222  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1039  radical SAM domain-containing protein  27.46 
 
 		 231 aa  89.7  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0813206  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1292  hypothetical protein  23.85 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0855  hypothetical protein  28.73 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  6.94924e-18  unclonable  0.0000000890564 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  29.25 
 
 		 454 aa  51.2  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1655  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  21.97 
 
 		 351 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0167472  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1943  radical SAM family protein  28.57 
 
 		 267 aa  48.5  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.545667  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  28.24 
 
 		 359 aa  47.4  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2558  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  23.5 
 
 		 351 aa  46.6  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  8.150479999999999e-35 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1501  radical SAM domain-containing protein  27.08 
 
 		 454 aa  46.2  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1456  radical SAM domain-containing protein  27.08 
 
 		 454 aa  46.2  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0871  putative coenzyme PQQ synthesis protein  30.28 
 
 		 238 aa  45.8  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.398462  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08560  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  25.13 
 
 		 366 aa  45.4  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.209245  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0729  hypothetical protein  28.57 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3389  hypothetical protein  29.17 
 
 		 215 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000102267  normal  0.0705776 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  32.69 
 
 		 290 aa  44.3  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2551  radical SAM family protein  27.78 
 
 		 344 aa  43.5  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0301  radical SAM family Fe-S protein  31.08 
 
 		 206 aa  43.5  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.239452  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1593  radical SAM domain-containing protein  27.75 
 
 		 354 aa  43.5  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2164  radical SAM domain-containing protein  21.5 
 
 		 349 aa  43.1  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.295283  normal  0.13164 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>