88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1962 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1962  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 323 aa  656    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3462  radical SAM domain-containing protein  59.81 
 
 		 313 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0562  radical SAM domain-containing protein  56.59 
 
 		 311 aa  363  2e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1586  hypothetical protein  54.87 
 
 		 326 aa  358  6e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1404  radical SAM domain-containing protein  55.84 
 
 		 320 aa  348  7e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.937371  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1760  radical SAM domain-containing protein  54.34 
 
 		 323 aa  345  7e-94  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.265975  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1155  Radical SAM domain protein  48.56 
 
 		 319 aa  323  3e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04120  Radical SAM domain protein  43.55 
 
 		 311 aa  289  4e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0454  radical SAM domain-containing protein  34.97 
 
 		 312 aa  204  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.383393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1531  radical SAM domain-containing protein  37.13 
 
 		 308 aa  199  5e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1179  radical SAM domain-containing protein  37.31 
 
 		 331 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0808  radical SAM domain-containing protein  37.79 
 
 		 320 aa  192  6e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1667  Radical SAM domain protein  42.79 
 
 		 321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.332302  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1848  radical SAM domain-containing protein  36.77 
 
 		 310 aa  185  7e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0912  Radical SAM domain protein  38.18 
 
 		 314 aa  185  7e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.883819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1559  Radical SAM domain protein  37.63 
 
 		 316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0969548  hitchhiker  0.000892375 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0361  radical SAM domain-containing protein  42.52 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.763423 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1460  Elongator protein 3/MiaB/NifB  37.22 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0991  Radical SAM domain protein  35.16 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0688  MoaA/NifB/PqqE family protein  33.01 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110468  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1142  radical SAM domain-containing protein  35.96 
 
 		 310 aa  162  7e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.07 
 
 		 680 aa  160  3e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1638  radical SAM domain-containing protein  32.25 
 
 		 313 aa  155  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00824164  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0336  hypothetical protein  36.09 
 
 		 319 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.300886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2416  Radical SAM domain protein  35.81 
 
 		 328 aa  152  8.999999999999999e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2156  radical SAM family protein  35.81 
 
 		 313 aa  145  9e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0322  radical SAM domain-containing protein  38.74 
 
 		 364 aa  143  4e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.44863  normal  0.156857 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11060  Radical SAM domain protein  32.91 
 
 		 239 aa  142  8e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00221485  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0108  radical SAM domain-containing protein  39.74 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1223  Radical SAM domain protein  33.63 
 
 		 237 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674183 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0458  Radical SAM domain protein  36.57 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0538  radical SAM domain-containing protein  35 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2049  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2341  Radical SAM domain protein  34.35 
 
 		 330 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.109673 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2377  Radical SAM domain protein  32.64 
 
 		 365 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0828  Fe-S oxidoreductase  34.02 
 
 		 326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.389597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3606  radical SAM domain-containing protein  40.49 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1149  radical SAM family Fe-S protein  32.24 
 
 		 326 aa  119  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  29.03 
 
 		 300 aa  119  7e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  29.17 
 
 		 300 aa  119  9e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  25.82 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3775  Radical SAM domain protein  34.6 
 
 		 266 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1380  radical SAM domain-containing protein  28.71 
 
 		 300 aa  116  5e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0316  Radical SAM domain protein  29.86 
 
 		 303 aa  115  7.999999999999999e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1472  radical SAM domain-containing protein  26.92 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  26.21 
 
 		 310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0530  conserved hypothetical protein, putative radical SAM domain protein  26.28 
 
 		 302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2043  Radical SAM domain protein  34.12 
 
 		 267 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  24.6 
 
 		 304 aa  108  9.000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4632  radical SAM family protein  31.73 
 
 		 270 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453222  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  27.23 
 
 		 300 aa  95.5  1e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  25.7 
 
 		 308 aa  91.7  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1039  radical SAM domain-containing protein  20.42 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0813206  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1292  hypothetical protein  26.29 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0855  hypothetical protein  30.77 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  6.94924e-18  unclonable  0.0000000890564 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1943  radical SAM family protein  32.69 
 
 		 267 aa  50.1  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.545667  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0779  radical SAM domain-containing protein  27.6 
 
 		 336 aa  50.1  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  30.06 
 
 		 474 aa  49.3  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1057  radical SAM domain-containing protein  31.25 
 
 		 354 aa  48.5  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828068 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  27.78 
 
 		 337 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2456  Radical SAM domain protein  27.78 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3391  pyruvate formate-lyase activating enzyme  25.85 
 
 		 249 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4172  Radical SAM domain protein  32.41 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 282 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2450  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.11 
 
 		 359 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2571  radical SAM domain-containing protein  28.82 
 
 		 365 aa  45.4  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0022  radical SAM domain-containing protein  27.54 
 
 		 360 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1463  radical SAM domain-containing protein  28.51 
 
 		 266 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1052  Radical SAM domain protein  26.88 
 
 		 366 aa  44.7  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  26.17 
 
 		 361 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  32.41 
 
 		 427 aa  44.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1490  radical SAM domain-containing protein  24.35 
 
 		 377 aa  44.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.343112  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0519  radical SAM domain-containing protein  28.77 
 
 		 266 aa  44.3  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.149546  normal  0.440492 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  23.11 
 
 		 342 aa  44.3  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2552  radical SAM family protein  23.72 
 
 		 340 aa  43.9  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  26.83 
 
 		 340 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0354  radical SAM domain-containing protein  25.23 
 
 		 337 aa  44.3  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.898506 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4990  radical SAM family protein  32.48 
 
 		 386 aa  43.9  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.396764  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  22.88 
 
 		 332 aa  43.5  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2016  Radical SAM domain protein  26.91 
 
 		 315 aa  43.5  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0248343  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1006  radical SAM family protein  26.18 
 
 		 336 aa  43.1  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1943  Radical SAM domain protein  26.24 
 
 		 315 aa  43.1  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.227047  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0483  radical SAM enzyme, Cfr family  23.53 
 
 		 350 aa  43.1  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0926837  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0297  pyruvate formate-lyase activating enzyme  22.67 
 
 		 247 aa  42.7  0.007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2919  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.49 
 
 		 370 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00151708  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  22.55 
 
 		 371 aa  42.7  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2225  Radical SAM domain protein  25.4 
 
 		 286 aa  42.7  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1830  Radical SAM domain protein  30.53 
 
 		 292 aa  42.7  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>