43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1052 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1052  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 366 aa  740    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2543  radical SAM domain protein  36.47 
 
 		 378 aa  229  6e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2171  Radical SAM domain protein  36.47 
 
 		 378 aa  229  6e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00159358  decreased coverage  0.000000000651126 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2204  radical SAM domain protein  34.75 
 
 		 383 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0644  Radical SAM domain protein  36.1 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.14053  normal  0.0928811 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0445  radical SAM family protein  36.07 
 
 		 349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0592  Radical SAM domain protein  31.4 
 
 		 371 aa  211  2e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000649486  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2088  Radical SAM domain protein  36.1 
 
 		 351 aa  203  3e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1558  radical SAM domain-containing protein  34.33 
 
 		 355 aa  196  4.0000000000000005e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0417812 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0912  radical SAM domain-containing protein  26.18 
 
 		 295 aa  120  3.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0919  Radical SAM domain protein  27.33 
 
 		 308 aa  116  6.9999999999999995e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000116556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0705  radical SAM domain-containing protein  28.23 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0681  radical SAM domain-containing protein  28.52 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0033  radical SAM domain-containing protein  26.76 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.531209  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0962  radical SAM domain-containing protein  25.98 
 
 		 290 aa  100  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1520  Radical SAM domain protein  23.56 
 
 		 310 aa  97.8  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1508  radical SAM domain-containing protein  30.6 
 
 		 266 aa  85.5  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0596  radical SAM domain-containing protein  24.47 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.351823  normal  0.189258 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0057  Radical SAM domain protein  27.21 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615692  normal  0.0888986 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5394  Radical SAM domain protein  26.83 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2103  radical SAM domain-containing protein  28.46 
 
 		 362 aa  55.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.938739  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0246  radical SAM domain-containing protein  28.46 
 
 		 367 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2620  Radical SAM domain protein  28.46 
 
 		 371 aa  55.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1109  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.87 
 
 		 362 aa  54.7  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1409  hypothetical protein  24.68 
 
 		 356 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2714  Radical SAM domain protein  24.68 
 
 		 356 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4750  Radical SAM domain protein  31.15 
 
 		 379 aa  53.9  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0394  radical SAM domain-containing protein  24.77 
 
 		 322 aa  53.1  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4562  radical SAM domain-containing protein  24.03 
 
 		 360 aa  52.8  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343645  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0560  Radical SAM domain protein  26.02 
 
 		 360 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1993  Radical SAM domain protein  27.43 
 
 		 370 aa  51.6  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0631  radical SAM domain-containing protein  29.36 
 
 		 314 aa  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0187035  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3477  hypothetical protein  24.68 
 
 		 359 aa  50.4  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7577  Biotin synthase-related enzyme  27.05 
 
 		 323 aa  50.1  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0230  hypothetical protein  23.27 
 
 		 343 aa  47.8  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13141  hypothetical protein  21.64 
 
 		 362 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0838  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.68 
 
 		 365 aa  45.8  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.195743  normal  0.168484 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1962  radical SAM domain-containing protein  26.88 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4690  Radical SAM domain protein  26.13 
 
 		 351 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1221  radical SAM domain-containing protein  25.44 
 
 		 356 aa  43.5  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142364 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1738  biotin synthase  24.77 
 
 		 349 aa  43.5  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1978  biotin synthase  22.09 
 
 		 338 aa  43.1  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0464  biotin synthetase  22.34 
 
 		 330 aa  43.1  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>