31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1830 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1830  Radical SAM domain protein  100 
 
 
292 aa  586  1e-166  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0729  hypothetical protein  56.4 
 
 
293 aa  316  3e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2571  radical SAM domain-containing protein  53.74 
 
 
365 aa  292  5e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1943  radical SAM family protein  51.87 
 
 
267 aa  287  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.545667  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0855  hypothetical protein  55.2 
 
 
278 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  6.94924e-18  unclonable  0.0000000890564 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1292  hypothetical protein  33.7 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2341  Radical SAM domain protein  28.98 
 
 
330 aa  63.2  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.109673 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0912  Radical SAM domain protein  31.52 
 
 
314 aa  57  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.883819  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2416  Radical SAM domain protein  24.68 
 
 
328 aa  56.2  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1667  Radical SAM domain protein  29.21 
 
 
321 aa  53.9  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.332302  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1559  Radical SAM domain protein  28.48 
 
 
316 aa  53.5  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0969548  hitchhiker  0.000892375 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0991  Radical SAM domain protein  31.91 
 
 
311 aa  52.8  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0108  radical SAM domain-containing protein  28.11 
 
 
295 aa  51.6  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1848  radical SAM domain-containing protein  31.74 
 
 
310 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  23.7 
 
 
303 aa  51.6  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11060  Radical SAM domain protein  28.74 
 
 
239 aa  50.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00221485  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1586  hypothetical protein  31.25 
 
 
326 aa  49.3  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  25.56 
 
 
680 aa  48.5  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1460  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.81 
 
 
312 aa  47.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1638  radical SAM domain-containing protein  31.11 
 
 
313 aa  46.6  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00824164  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1142  radical SAM domain-containing protein  27.11 
 
 
310 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2049  radical SAM domain-containing protein  26.03 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0688  MoaA/NifB/PqqE family protein  30.4 
 
 
312 aa  44.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110468  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0454  radical SAM domain-containing protein  26.81 
 
 
312 aa  43.9  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.383393  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  31.76 
 
 
434 aa  43.9  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  29.25 
 
 
300 aa  43.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  29.25 
 
 
300 aa  43.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  25.93 
 
 
310 aa  43.1  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1962  radical SAM domain-containing protein  30.53 
 
 
323 aa  42.7  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0316  Radical SAM domain protein  25.55 
 
 
303 aa  42.4  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0361  radical SAM domain-containing protein  29.52 
 
 
313 aa  42.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.763423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>