62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0458 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0458  Radical SAM domain protein  100 
 
 
332 aa  682    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0538  radical SAM domain-containing protein  47.85 
 
 
329 aa  291  7e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2377  Radical SAM domain protein  44.48 
 
 
365 aa  280  3e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0322  radical SAM domain-containing protein  44.21 
 
 
364 aa  279  4e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.44863  normal  0.156857 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1142  radical SAM domain-containing protein  38.87 
 
 
310 aa  218  1e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2049  radical SAM domain-containing protein  36.98 
 
 
319 aa  187  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11060  Radical SAM domain protein  37.66 
 
 
239 aa  186  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00221485  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1638  radical SAM domain-containing protein  32.9 
 
 
313 aa  178  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00824164  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0912  Radical SAM domain protein  41.4 
 
 
314 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.883819  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0336  hypothetical protein  35.05 
 
 
319 aa  177  2e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.300886  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1223  Radical SAM domain protein  40.36 
 
 
237 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674183 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0361  radical SAM domain-containing protein  34.58 
 
 
313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.763423 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1559  Radical SAM domain protein  34.06 
 
 
316 aa  170  3e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0969548  hitchhiker  0.000892375 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0108  radical SAM domain-containing protein  36.12 
 
 
295 aa  169  6e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  31.8 
 
 
680 aa  168  1e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1667  Radical SAM domain protein  37.67 
 
 
321 aa  167  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.332302  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2416  Radical SAM domain protein  30.82 
 
 
328 aa  167  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2156  radical SAM family protein  33.12 
 
 
313 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0454  radical SAM domain-containing protein  37.26 
 
 
312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.383393  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2341  Radical SAM domain protein  30.38 
 
 
330 aa  163  3e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.109673 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0808  radical SAM domain-containing protein  35.12 
 
 
320 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1848  radical SAM domain-containing protein  39.72 
 
 
310 aa  159  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1179  radical SAM domain-containing protein  34.87 
 
 
331 aa  158  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0688  MoaA/NifB/PqqE family protein  39.71 
 
 
312 aa  157  3e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110468  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1460  Elongator protein 3/MiaB/NifB  37.02 
 
 
312 aa  152  7e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0991  Radical SAM domain protein  38.76 
 
 
311 aa  151  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1149  radical SAM family Fe-S protein  28.66 
 
 
326 aa  150  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04120  Radical SAM domain protein  38.16 
 
 
311 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1586  hypothetical protein  37.18 
 
 
326 aa  147  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  30.53 
 
 
310 aa  147  3e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1531  radical SAM domain-containing protein  29.3 
 
 
308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0828  Fe-S oxidoreductase  29.57 
 
 
326 aa  144  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.389597  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  30.82 
 
 
303 aa  143  5e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3606  radical SAM domain-containing protein  46.63 
 
 
244 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0316  Radical SAM domain protein  30.82 
 
 
303 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  31.41 
 
 
304 aa  138  1e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2043  Radical SAM domain protein  37.9 
 
 
267 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  32.29 
 
 
308 aa  135  9e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1404  radical SAM domain-containing protein  37.91 
 
 
320 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.937371  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0562  radical SAM domain-containing protein  37.02 
 
 
311 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1962  radical SAM domain-containing protein  36.57 
 
 
323 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 
300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1380  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 
300 aa  133  5e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3462  radical SAM domain-containing protein  35.02 
 
 
313 aa  133  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1472  radical SAM domain-containing protein  31.73 
 
 
300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1155  Radical SAM domain protein  34.6 
 
 
319 aa  130  3e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  28.83 
 
 
300 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1760  radical SAM domain-containing protein  36.27 
 
 
323 aa  127  3e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.265975  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3775  Radical SAM domain protein  32.64 
 
 
266 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4632  radical SAM family protein  33.49 
 
 
270 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453222  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0530  conserved hypothetical protein, putative radical SAM domain protein  29.72 
 
 
302 aa  107  4e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1039  radical SAM domain-containing protein  26.2 
 
 
231 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0813206  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1292  hypothetical protein  27.71 
 
 
291 aa  63.2  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14130  radical SAM enzyme, Cfr family  23.79 
 
 
351 aa  49.7  0.00006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0855  hypothetical protein  29.94 
 
 
278 aa  49.7  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  6.94924e-18  unclonable  0.0000000890564 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1124  Fe-S oxidoreductases  29.34 
 
 
338 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1830  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  25.63 
 
 
334 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2100  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.21 
 
 
334 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2030  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.21 
 
 
334 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1990  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.88 
 
 
335 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1440  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.54 
 
 
347 aa  43.1  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>