More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1463 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1463  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
266 aa  531  1e-150  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0519  radical SAM domain-containing protein  96.62 
 
 
266 aa  494  1e-139  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.149546  normal  0.440492 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_79  radical SAM domain protein  31.78 
 
 
248 aa  108  9.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0280  radical SAM domain-containing protein  34.45 
 
 
249 aa  105  8e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0109  radical SAM domain-containing protein  34.45 
 
 
249 aa  104  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1337  radical SAM domain protein  34.44 
 
 
249 aa  103  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_100  radical SAM domain protein  34.44 
 
 
249 aa  102  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0090  radical SAM domain-containing protein  29.81 
 
 
271 aa  98.2  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0241  radical SAM domain-containing protein  28.45 
 
 
256 aa  95.1  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1137  radical SAM domain-containing protein  29.63 
 
 
273 aa  94.7  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.558403  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0966  radical SAM domain-containing protein  29.22 
 
 
273 aa  94.7  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_77  radical SAM domain protein  27.62 
 
 
274 aa  94.4  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_955  radical SAM domain protein  28.57 
 
 
273 aa  92.4  7e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_75  radical SAM domain protein  29.02 
 
 
246 aa  92  9e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0089  radical SAM domain-containing protein  29.96 
 
 
283 aa  90.5  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.110563  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0243  radical SAM domain-containing protein  28.63 
 
 
246 aa  87.8  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0453811  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0239  radical SAM domain-containing protein  29.38 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0595  radical SAM domain-containing protein  26.36 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2272  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic-like protein  29.71 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.487332  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0544  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.81 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0622  radical SAM domain-containing protein  25.57 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165455  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_563  radical SAM domain protein  26.36 
 
 
249 aa  65.5  0.0000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2999  radical SAM family protein  28.49 
 
 
265 aa  63.5  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1841  Radical SAM domain protein  29.32 
 
 
340 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1101  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.16 
 
 
310 aa  62.8  0.000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3389  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.3 
 
 
345 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  29.69 
 
 
381 aa  62.4  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0821  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35 
 
 
337 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  25.49 
 
 
342 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.46 
 
 
337 aa  60.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0851  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  33.5 
 
 
265 aa  61.2  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1699  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  25.99 
 
 
228 aa  60.1  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2177  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.78 
 
 
339 aa  59.7  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.697668  normal  0.807394 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0055  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.81 
 
 
325 aa  59.3  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0195901 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1011  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  29.61 
 
 
423 aa  59.3  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0654  radical SAM domain-containing protein  29.34 
 
 
303 aa  58.9  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00641861  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0133  nitrogen fixation protein  25.93 
 
 
321 aa  58.9  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  26.96 
 
 
329 aa  58.9  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  26.96 
 
 
329 aa  58.9  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2586  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.57 
 
 
340 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4843  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.57 
 
 
337 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4622  molybdenum cofactor biosynthesis protein A, N-terminus  28.57 
 
 
252 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4457  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.57 
 
 
339 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4475  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.57 
 
 
337 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0873  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.75 
 
 
337 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114642  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1448  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic-like  33.14 
 
 
234 aa  57.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.236799 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0869  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.75 
 
 
337 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.39 
 
 
317 aa  57.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1058  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  29.73 
 
 
244 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.448399  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0284  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.75 
 
 
337 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4120  radical SAM domain-containing protein  28.18 
 
 
372 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.424935 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4402  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.12 
 
 
326 aa  57  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320325  hitchhiker  0.00467523 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1477  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.63 
 
 
343 aa  57.4  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0277  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.75 
 
 
337 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5688  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.05 
 
 
372 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.512935  normal  0.513235 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0281  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.75 
 
 
337 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13126  molybdenum cofactor biosynthesis protein A moaA1  28.25 
 
 
359 aa  57  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0851136 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16340  pyruvate formate-lyase 1-activating enzyme  26.37 
 
 
287 aa  57  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.243728  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1230  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.3 
 
 
361 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0359079 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4861  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28 
 
 
337 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2190  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.57 
 
 
318 aa  56.6  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0928  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.49 
 
 
329 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1541  glycyl-radical activating protein  32.17 
 
 
348 aa  56.2  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.883211  normal  0.703307 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0896  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.49 
 
 
329 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0951  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.49 
 
 
329 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0837  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.49 
 
 
329 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2884  Radical SAM domain protein  26.7 
 
 
370 aa  56.6  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0663943  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0389  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.75 
 
 
337 aa  56.6  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.62159  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2774  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.03 
 
 
344 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00282433  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0865  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.49 
 
 
329 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.17 
 
 
351 aa  55.8  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.136733 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0911  radical SAM domain-containing protein  28.38 
 
 
497 aa  56.2  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0285  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.75 
 
 
337 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  26.16 
 
 
468 aa  55.8  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3349  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.25 
 
 
346 aa  55.8  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366452  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1031  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.86 
 
 
338 aa  55.8  0.0000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0516  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  27.87 
 
 
245 aa  55.8  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0252566  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4867  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.85 
 
 
334 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1268  radical SAM family Fe-S protein  24.79 
 
 
312 aa  55.5  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.45793  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2650  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.3 
 
 
344 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1282  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.93 
 
 
327 aa  55.5  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.591085  normal  0.574415 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0273  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.48 
 
 
337 aa  55.5  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000395705 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3748  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.68 
 
 
337 aa  55.5  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.247867  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2877  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.3 
 
 
344 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.593908  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0274  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.05 
 
 
337 aa  55.5  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.481355  hitchhiker  0.000000283417 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0087  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.38 
 
 
337 aa  55.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0823878  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1440  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.57 
 
 
312 aa  55.5  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2804  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.65 
 
 
341 aa  55.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.933845  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1219  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.66 
 
 
343 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2025  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.07 
 
 
348 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0930422  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4793  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.95 
 
 
326 aa  55.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00113371  hitchhiker  0.00000239799 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2622  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  26.81 
 
 
427 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0024  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.43 
 
 
309 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4636  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.29 
 
 
335 aa  54.7  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.886465  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  29.09 
 
 
389 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2247  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.27 
 
 
348 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.720005 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  27.81 
 
 
356 aa  54.7  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2244  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.81 
 
 
326 aa  54.7  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.555933  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2052  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.06 
 
 
344 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3524  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.33 
 
 
340 aa  54.3  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.406525  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>