56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0243 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0243  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 246 aa  512  1e-144  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0453811  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_75  radical SAM domain protein  97.97 
 
 		 246 aa  501  1e-141  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0595  radical SAM domain-containing protein  42.17 
 
 		 249 aa  209  4e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_563  radical SAM domain protein  42.57 
 
 		 249 aa  208  5e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0622  radical SAM domain-containing protein  41.37 
 
 		 249 aa  205  5e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165455  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0109  radical SAM domain-containing protein  40.32 
 
 		 249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_100  radical SAM domain protein  40.73 
 
 		 249 aa  195  6e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1337  radical SAM domain protein  40.32 
 
 		 249 aa  194  1e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0280  radical SAM domain-containing protein  39.92 
 
 		 249 aa  193  2e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_955  radical SAM domain protein  34.68 
 
 		 273 aa  159  3e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1137  radical SAM domain-containing protein  34.41 
 
 		 273 aa  156  3e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.558403  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0966  radical SAM domain-containing protein  33.2 
 
 		 273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0089  radical SAM domain-containing protein  34.47 
 
 		 283 aa  152  4e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.110563  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0090  radical SAM domain-containing protein  35.56 
 
 		 271 aa  152  5e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_79  radical SAM domain protein  35.24 
 
 		 248 aa  135  8e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0241  radical SAM domain-containing protein  31.45 
 
 		 256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_77  radical SAM domain protein  31.45 
 
 		 274 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0239  radical SAM domain-containing protein  33.17 
 
 		 223 aa  105  7e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0519  radical SAM domain-containing protein  29.24 
 
 		 266 aa  89.7  3e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.149546  normal  0.440492 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1463  radical SAM domain-containing protein  30.08 
 
 		 266 aa  86.7  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2363  radical SAM domain-containing protein  24.39 
 
 		 566 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.607234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0540  radical SAM domain-containing protein  24.23 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  26.52 
 
 		 282 aa  51.2  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3944  radical SAM domain-containing protein  22.55 
 
 		 292 aa  50.1  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2061  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 298 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000288905 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1215  radical SAM domain-containing protein  20.7 
 
 		 331 aa  46.2  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2284  radical SAM domain-containing protein  24.44 
 
 		 298 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00260507  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  26.07 
 
 		 294 aa  45.8  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1240  radical SAM domain-containing protein  20.7 
 
 		 331 aa  45.8  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  20.81 
 
 		 339 aa  45.4  0.0009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2401  radical SAM domain-containing protein  24.81 
 
 		 298 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312992  unclonable  0.00000836266 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5892  radical SAM domain protein  23.64 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2065  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 		 300 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3677  radical SAM domain-containing protein  23.62 
 
 		 287 aa  43.5  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.005025 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1841  Radical SAM domain protein  23.32 
 
 		 340 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4980  pyruvate formate lyase activating enzyme  24.42 
 
 		 287 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.902486  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3619  Radical SAM domain protein  23.62 
 
 		 287 aa  43.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04221  hypothetical protein  23.62 
 
 		 287 aa  43.1  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  22.63 
 
 		 329 aa  43.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  22.63 
 
 		 329 aa  43.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04255  predicted pyruvate formate lyase activating enzyme  23.62 
 
 		 287 aa  43.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.542782  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4886  pyruvate formate lyase activating enzyme  24.42 
 
 		 287 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0614153  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4973  pyruvate formate lyase activating enzyme  24.42 
 
 		 287 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.577557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0917  Radical SAM domain protein  22.27 
 
 		 324 aa  42.7  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4819  pyruvate formate lyase activating enzyme  24.42 
 
 		 287 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  22.99 
 
 		 362 aa  42.4  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1490  radical SAM domain-containing protein  24.29 
 
 		 377 aa  42.7  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.343112  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0158  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  23.48 
 
 		 589 aa  42.7  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4921  pyruvate formate lyase activating enzyme  24.42 
 
 		 287 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4977  radical SAM domain-containing protein  23.23 
 
 		 287 aa  42.4  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.258865  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1469  radical SAM domain-containing protein  24.02 
 
 		 609 aa  42.4  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.447014  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2000  radical SAM family protein  27.59 
 
 		 565 aa  42.4  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.345237  normal  0.435892 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4923  radical SAM domain protein  23.32 
 
 		 287 aa  42  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1601  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  23.71 
 
 		 236 aa  42  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0403  Radical SAM domain protein  22.28 
 
 		 351 aa  42  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00459412  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4614  radical SAM domain-containing protein  23.23 
 
 		 287 aa  42  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>