68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1337 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_100  radical SAM domain protein  99.6 
 
 		 249 aa  511  1e-144  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1337  radical SAM domain protein  100 
 
 		 249 aa  513  1e-144  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0280  radical SAM domain-containing protein  83.13 
 
 		 249 aa  434  1e-121  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0109  radical SAM domain-containing protein  83.53 
 
 		 249 aa  437  1e-121  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0595  radical SAM domain-containing protein  54 
 
 		 249 aa  271  5.000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_563  radical SAM domain protein  53.6 
 
 		 249 aa  268  7e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0622  radical SAM domain-containing protein  53.2 
 
 		 249 aa  267  1e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165455  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_75  radical SAM domain protein  41.13 
 
 		 246 aa  198  5e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0243  radical SAM domain-containing protein  40.32 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0453811  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1137  radical SAM domain-containing protein  41.56 
 
 		 273 aa  169  4e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.558403  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_955  radical SAM domain protein  41.56 
 
 		 273 aa  167  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0966  radical SAM domain-containing protein  40.69 
 
 		 273 aa  166  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0090  radical SAM domain-containing protein  37.5 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0241  radical SAM domain-containing protein  41.03 
 
 		 256 aa  162  7e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_77  radical SAM domain protein  41.45 
 
 		 274 aa  160  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0089  radical SAM domain-containing protein  38.1 
 
 		 283 aa  160  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.110563  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_79  radical SAM domain protein  36.96 
 
 		 248 aa  156  4e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0239  radical SAM domain-containing protein  37.2 
 
 		 223 aa  139  6e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0519  radical SAM domain-containing protein  34.85 
 
 		 266 aa  105  5e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.149546  normal  0.440492 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1463  radical SAM domain-containing protein  34.44 
 
 		 266 aa  102  5e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0403  Radical SAM domain protein  30.69 
 
 		 351 aa  62  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00459412  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  26.46 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  27.23 
 
 		 342 aa  54.3  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0355  Radical SAM domain protein  24.16 
 
 		 365 aa  54.3  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1490  radical SAM domain-containing protein  26.57 
 
 		 377 aa  53.9  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.343112  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1469  radical SAM domain-containing protein  25.68 
 
 		 609 aa  53.5  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.447014  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  28.99 
 
 		 329 aa  50.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1722  radical SAM domain-containing protein  34.94 
 
 		 371 aa  50.4  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  28.99 
 
 		 329 aa  50.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2402  radical SAM domain-containing protein  24.19 
 
 		 297 aa  49.3  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  24.6 
 
 		 342 aa  49.3  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2761  radical SAM domain-containing protein  32.26 
 
 		 348 aa  48.9  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0874334  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1254  radical SAM domain-containing protein  30.85 
 
 		 384 aa  48.5  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1841  Radical SAM domain protein  28.24 
 
 		 340 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1874  radical SAM domain-containing protein  26.92 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 427 aa  48.5  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1318  glycyl-radical activating family protein  31.03 
 
 		 299 aa  46.6  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0352967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0540  radical SAM domain-containing protein  24.27 
 
 		 326 aa  46.2  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1580  Radical SAM domain protein  27.88 
 
 		 429 aa  45.8  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0629  Radical SAM domain protein  23.12 
 
 		 343 aa  45.8  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000217214  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4120  radical SAM domain-containing protein  24.07 
 
 		 372 aa  45.4  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.424935 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  21.92 
 
 		 333 aa  45.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2070  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 593 aa  45.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0885  pyruvate formate-lyase 1-activating enzyme  26.61 
 
 		 293 aa  45.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0761  Radical SAM domain protein  23.28 
 
 		 340 aa  45.4  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00535967  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1215  radical SAM domain-containing protein  26.06 
 
 		 331 aa  44.7  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1240  radical SAM domain-containing protein  27.5 
 
 		 331 aa  44.7  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4016  radical SAM domain-containing protein  26.54 
 
 		 379 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.643398  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0158  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  26.55 
 
 		 589 aa  43.5  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1670  radical SAM domain-containing protein  25.85 
 
 		 362 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0537367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  27.45 
 
 		 337 aa  43.5  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0270  radical SAM domain-containing protein  24.89 
 
 		 286 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1006  radical SAM family protein  27.2 
 
 		 336 aa  43.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3258  glycyl-radical enzyme activating protein family  33.33 
 
 		 303 aa  43.1  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.807185  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1524  radical SAM domain-containing protein  24.56 
 
 		 337 aa  43.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2362  Radical SAM domain protein  25.12 
 
 		 512 aa  43.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2456  Radical SAM domain protein  26.95 
 
 		 337 aa  42.7  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1578  radical SAM family protein  25 
 
 		 280 aa  42.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2999  radical SAM family protein  27.93 
 
 		 265 aa  43.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1953  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  24.81 
 
 		 245 aa  42.7  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  24.59 
 
 		 608 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1430  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 302 aa  42.7  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.698676  hitchhiker  0.00476012 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0692  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  24.77 
 
 		 293 aa  42.7  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.104164  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1903  radical SAM domain-containing protein  30.86 
 
 		 364 aa  42.4  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.378187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2000  radical SAM family protein  24.87 
 
 		 565 aa  42.4  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.345237  normal  0.435892 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0297  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 363 aa  42.4  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3515  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic-like  28.81 
 
 		 219 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.215518 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  28.35 
 
 		 282 aa  42  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>