210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1722 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1722  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 371 aa  751    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0355  Radical SAM domain protein  55.34 
 
 		 365 aa  399  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1490  radical SAM domain-containing protein  52.6 
 
 		 377 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.343112  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4016  radical SAM domain-containing protein  52.07 
 
 		 379 aa  349  6e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.643398  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1254  radical SAM domain-containing protein  49.59 
 
 		 384 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0297  radical SAM domain-containing protein  43.72 
 
 		 363 aa  294  2e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1903  radical SAM domain-containing protein  44.14 
 
 		 364 aa  291  2e-77  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.378187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0403  Radical SAM domain protein  39.78 
 
 		 351 aa  288  1e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00459412  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1533  radical SAM domain-containing protein  38.56 
 
 		 355 aa  265  7e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000125557  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1582  radical SAM domain-containing protein  38.56 
 
 		 355 aa  265  7e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0102098  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1430  radical SAM domain-containing protein  44.52 
 
 		 302 aa  257  2e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.698676  hitchhiker  0.00476012 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0354  radical SAM domain-containing protein  27.44 
 
 		 337 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.898506 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1841  Radical SAM domain protein  26.97 
 
 		 340 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2551  pyruvate formate-lyase activating enzyme-like protein  25.95 
 
 		 354 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592966  normal  0.73651 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0396  radical SAM family protein  26.69 
 
 		 358 aa  79  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  27.62 
 
 		 337 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0922  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0463  radical SAM domain-containing protein  32.03 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.838883  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2456  Radical SAM domain protein  27.62 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  27.3 
 
 		 353 aa  76.3  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0189  Radical SAM domain protein  28.06 
 
 		 344 aa  75.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  22.04 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1995  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0449  radical SAM family protein  30.25 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355453  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  25.4 
 
 		 342 aa  72.8  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0464  Radical SAM domain protein  27.96 
 
 		 348 aa  72  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.521225  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2854  radical SAM domain-containing protein  27.3 
 
 		 337 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0088  radical SAM domain-containing protein  29.03 
 
 		 357 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.400989  normal  0.227798 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  25.16 
 
 		 342 aa  70.1  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5878  Radical SAM domain protein  26.81 
 
 		 362 aa  69.3  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0206709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  24.84 
 
 		 282 aa  69.3  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1969  radical SAM family protein  28.39 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.327469 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0761  Radical SAM domain protein  22.01 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00535967  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0904  Radical SAM domain protein  22.51 
 
 		 395 aa  66.2  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0776722 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0574  radical SAM domain protein  24.76 
 
 		 361 aa  66.2  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0728  Radical SAM domain protein  24.76 
 
 		 361 aa  66.2  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000489129 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0044  Radical SAM domain protein  24.29 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  22.61 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  22.61 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1150  DNA mismatch repair protein  22.58 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.926871 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0629  Radical SAM domain protein  23.15 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000217214  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  23.13 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1585  hypothetical protein  27.01 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  26.28 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0217  radical SAM domain-containing protein  22.67 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2243  Radical SAM domain protein  26.75 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6305  Radical SAM domain-containing protein  25.24 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2684  Radical SAM domain protein  24.92 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307935  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0367  glycyl-radical enzyme activating protein family  27.57 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0103  Radical SAM domain protein  27.83 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2539  Radical SAM domain protein  28.3 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0086  radical SAM family protein  26.21 
 
 		 356 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.508004  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1524  radical SAM domain-containing protein  23.15 
 
 		 337 aa  62.4  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3292  Radical SAM domain protein  26.05 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2217  Radical SAM domain protein  26.37 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  24.37 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1670  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 362 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0537367  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2402  radical SAM domain-containing protein  23.57 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0200  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2681  Radical SAM domain protein  25.18 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480916  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2555  Radical SAM domain protein  25.32 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466932  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0093  Radical SAM domain protein  26.54 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0759  radical SAM domain-containing protein  25.43 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1005  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1034  radical SAM domain-containing protein  23.73 
 
 		 337 aa  59.3  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1123  radical SAM domain-containing protein  22.98 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1215  radical SAM domain-containing protein  24.12 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1314  radical SAM domain-containing protein  22.78 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1849  radical SAM family protein  21.9 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2948  radical SAM family Fe-S protein  24.27 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1240  radical SAM domain-containing protein  24.12 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2430  radical SAM domain-containing protein  24.6 
 
 		 365 aa  57  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0451112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2213  radical SAM domain-containing protein  25.56 
 
 		 367 aa  57  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0539  radical SAM domain-containing protein  24.48 
 
 		 376 aa  56.2  0.0000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00688869  normal  0.395603 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1006  radical SAM family protein  24.12 
 
 		 336 aa  56.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  21.62 
 
 		 344 aa  55.5  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0089  radical SAM domain-containing protein  32.93 
 
 		 283 aa  54.7  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.110563  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0348  radical SAM domain-containing protein  21.29 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.224287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1728  hypothetical protein  24.19 
 
 		 336 aa  55.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.241184  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6076  radical SAM family protein  26.6 
 
 		 363 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2431  radical SAM domain-containing protein  24.28 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1874  radical SAM domain-containing protein  26.97 
 
 		 241 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0022  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 		 360 aa  55.5  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1586  glycyl-radical enzyme activating protein family  34.58 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0487316  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1460  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  27.18 
 
 		 246 aa  55.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1698  radical SAM domain-containing protein  21.86 
 
 		 337 aa  54.7  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1272  radical-activating enzyme  28.67 
 
 		 309 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0219  Radical SAM domain protein  25.24 
 
 		 337 aa  54.3  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0211251  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1815  radical SAM domain-containing protein  25.24 
 
 		 364 aa  54.3  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1963  Radical SAM domain protein  25.8 
 
 		 334 aa  54.3  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0105086  decreased coverage  0.00565461 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1435  glycyl-radical enzyme activating protein family  35.34 
 
 		 312 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0779  radical SAM domain-containing protein  23.72 
 
 		 336 aa  54.3  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2752  glycyl-radical activating family protein  26.76 
 
 		 310 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1095  radical SAM domain protein  22.01 
 
 		 345 aa  53.9  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_955  radical SAM domain protein  38.1 
 
 		 273 aa  53.9  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0966  radical SAM domain-containing protein  38.1 
 
 		 273 aa  53.5  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1563  radical SAM domain-containing protein  21.29 
 
 		 336 aa  53.9  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.356418 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1625  radical SAM domain-containing protein  25.31 
 
 		 363 aa  53.1  0.000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  22.58 
 
 		 294 aa  53.1  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  22.48 
 
 		 333 aa  52.8  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>