251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0355 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0355  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 365 aa  740    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1722  radical SAM domain-containing protein  56.44 
 
 		 371 aa  424  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1490  radical SAM domain-containing protein  53.02 
 
 		 377 aa  392  1e-108  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.343112  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1254  radical SAM domain-containing protein  52.33 
 
 		 384 aa  355  7.999999999999999e-97  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4016  radical SAM domain-containing protein  49.05 
 
 		 379 aa  338  7e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.643398  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0297  radical SAM domain-containing protein  45.88 
 
 		 363 aa  310  2e-83  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1903  radical SAM domain-containing protein  45.88 
 
 		 364 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.378187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0403  Radical SAM domain protein  40.06 
 
 		 351 aa  282  7.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00459412  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1430  radical SAM domain-containing protein  46.58 
 
 		 302 aa  266  4e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.698676  hitchhiker  0.00476012 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1533  radical SAM domain-containing protein  38.24 
 
 		 355 aa  241  2e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000125557  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1582  radical SAM domain-containing protein  38.24 
 
 		 355 aa  241  2e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0102098  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1150  DNA mismatch repair protein  28.16 
 
 		 338 aa  99.8  6e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.926871 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  25.63 
 
 		 339 aa  95.1  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0629  Radical SAM domain protein  24.77 
 
 		 343 aa  92.8  8e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000217214  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  26.6 
 
 		 329 aa  89.4  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  26.6 
 
 		 329 aa  89.4  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1524  radical SAM domain-containing protein  26.35 
 
 		 337 aa  88.6  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0761  Radical SAM domain protein  25.08 
 
 		 340 aa  87.8  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00535967  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1841  Radical SAM domain protein  26.92 
 
 		 340 aa  87  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0922  radical SAM domain-containing protein  26.11 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0354  radical SAM domain-containing protein  24.92 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.898506 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0463  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 332 aa  82.8  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.838883  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1034  radical SAM domain-containing protein  26.77 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0759  radical SAM domain-containing protein  27.36 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1215  radical SAM domain-containing protein  26.05 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0044  Radical SAM domain protein  23.9 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  25.64 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0217  radical SAM domain-containing protein  25.16 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2551  pyruvate formate-lyase activating enzyme-like protein  24.6 
 
 		 354 aa  80.1  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592966  normal  0.73651 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1240  radical SAM domain-containing protein  25.72 
 
 		 331 aa  80.1  0.00000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0103  Radical SAM domain protein  26.42 
 
 		 356 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  24.44 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0088  radical SAM domain-containing protein  27.9 
 
 		 357 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.400989  normal  0.227798 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1712  Radical SAM domain protein  23.89 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0086  radical SAM family protein  26.17 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.508004  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2555  Radical SAM domain protein  25.71 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466932  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0396  radical SAM family protein  26.03 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1670  radical SAM domain-containing protein  24.77 
 
 		 362 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0537367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  27.13 
 
 		 362 aa  75.9  0.0000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1815  radical SAM domain-containing protein  26.28 
 
 		 364 aa  75.9  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0093  Radical SAM domain protein  26.48 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  24.68 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3292  Radical SAM domain protein  25.16 
 
 		 366 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1625  radical SAM domain-containing protein  25.64 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  24.84 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0219  Radical SAM domain protein  26.5 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0211251  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0464  Radical SAM domain protein  26.61 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.521225  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  22.96 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0189  Radical SAM domain protein  27.74 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0542  radical SAM domain-containing protein  25.16 
 
 		 384 aa  73.9  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0194035 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1969  radical SAM family protein  25.32 
 
 		 370 aa  72.8  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.327469 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0858  radical SAM domain-containing protein  26.54 
 
 		 338 aa  72.8  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.844085 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1963  Radical SAM domain protein  26.6 
 
 		 334 aa  72  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0105086  decreased coverage  0.00565461 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2243  Radical SAM domain protein  26.03 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1585  hypothetical protein  24.2 
 
 		 364 aa  71.2  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0917  Radical SAM domain protein  26.92 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1006  radical SAM family protein  25.16 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  25.8 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1064  radical SAM domain-containing protein  25.65 
 
 		 364 aa  69.7  0.00000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0932  radical SAM domain-containing protein  25.3 
 
 		 362 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5878  Radical SAM domain protein  22.94 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0206709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2456  Radical SAM domain protein  26.25 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1325  radical SAM domain-containing protein  24.68 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.322233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1874  radical SAM domain-containing protein  27.73 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6305  Radical SAM domain-containing protein  24.2 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1728  hypothetical protein  25.16 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.241184  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2681  Radical SAM domain protein  22.62 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480916  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0574  radical SAM domain protein  25.55 
 
 		 361 aa  67.4  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2948  radical SAM family Fe-S protein  24.29 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0728  Radical SAM domain protein  25.55 
 
 		 361 aa  67.4  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000489129 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1999  radical SAM domain-containing protein  23.96 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.156539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1849  radical SAM family protein  22.47 
 
 		 329 aa  66.6  0.0000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1694  Radical SAM domain protein  26.18 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.953973 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1648  radical SAM domain-containing protein  24.68 
 
 		 363 aa  66.2  0.0000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2539  Radical SAM domain protein  26.2 
 
 		 360 aa  66.2  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2684  Radical SAM domain protein  24.37 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307935  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0540  radical SAM domain-containing protein  25.24 
 
 		 326 aa  65.9  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2402  radical SAM domain-containing protein  24.13 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1995  radical SAM domain-containing protein  24.19 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0089  radical SAM domain-containing protein  23.14 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.110563  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0449  radical SAM family protein  26.6 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355453  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0338  radical SAM domain-containing protein  27.85 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0779  radical SAM domain-containing protein  23.66 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2213  radical SAM domain-containing protein  23.89 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0022  radical SAM domain-containing protein  23.38 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2854  radical SAM domain-containing protein  22.83 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  22.9 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2217  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 374 aa  62.4  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2430  radical SAM domain-containing protein  23.82 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0451112 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1870  radical SAM domain-containing protein  25.6 
 
 		 374 aa  62  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0539  radical SAM domain-containing protein  23.27 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00688869  normal  0.395603 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1052  radical SAM family protein  23.25 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2293  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  24.09 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.388191  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1497  radical SAM domain-containing protein  23.58 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.398952  normal  0.0425103 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_79  radical SAM domain protein  27.04 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13159  pyruvate formate lyase activating protein pflA  25.08 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1469  radical SAM domain-containing protein  26.8 
 
 		 609 aa  60.1  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.447014  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  22.68 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1460  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  27.14 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  22.64 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>