229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3292 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3292  Radical SAM domain protein  100 
 
 
366 aa  758    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0073  pyruvate formate lyase-activating enzyme, putative  70.86 
 
 
365 aa  543  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2684  Radical SAM domain protein  68.56 
 
 
367 aa  520  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307935  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2539  Radical SAM domain protein  68.36 
 
 
360 aa  520  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2555  Radical SAM domain protein  67.81 
 
 
366 aa  509  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466932  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1585  hypothetical protein  67.52 
 
 
364 aa  501  1e-141  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0396  radical SAM family protein  66 
 
 
358 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1172  hypothetical protein  66.67 
 
 
358 aa  488  1e-137  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1005  radical SAM domain-containing protein  64.96 
 
 
370 aa  490  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1178  hypothetical protein  66.09 
 
 
358 aa  486  1e-136  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1969  radical SAM family protein  67.66 
 
 
370 aa  486  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.327469 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0728  Radical SAM domain protein  64.86 
 
 
361 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000489129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0574  radical SAM domain protein  64.86 
 
 
361 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0898  radical SAM domain-containing protein  62.93 
 
 
369 aa  482  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0932  radical SAM domain-containing protein  63.66 
 
 
362 aa  481  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1058  radical SAM domain-containing protein  64.72 
 
 
382 aa  482  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1870  radical SAM domain-containing protein  65.8 
 
 
374 aa  480  1e-134  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1325  radical SAM domain-containing protein  63.87 
 
 
365 aa  474  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.322233  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6305  Radical SAM domain-containing protein  63.87 
 
 
388 aa  472  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2217  Radical SAM domain protein  67.07 
 
 
374 aa  474  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0893  radical SAM domain-containing protein  62.64 
 
 
361 aa  469  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.910266 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13159  pyruvate formate lyase activating protein pflA  64.16 
 
 
362 aa  464  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2213  radical SAM domain-containing protein  61.25 
 
 
367 aa  452  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5878  Radical SAM domain protein  61.92 
 
 
362 aa  453  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0206709  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2430  radical SAM domain-containing protein  61.17 
 
 
365 aa  452  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0451112 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1497  radical SAM domain-containing protein  59.27 
 
 
365 aa  449  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.398952  normal  0.0425103 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6076  radical SAM family protein  61.86 
 
 
363 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0449  radical SAM family protein  59.54 
 
 
370 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355453  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0088  radical SAM domain-containing protein  57.4 
 
 
357 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.400989  normal  0.227798 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0086  radical SAM family protein  54.65 
 
 
356 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.508004  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0093  Radical SAM domain protein  53.75 
 
 
356 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0103  Radical SAM domain protein  54.05 
 
 
356 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2948  radical SAM family Fe-S protein  51.22 
 
 
347 aa  351  1e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0629  Radical SAM domain protein  43.62 
 
 
343 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000217214  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0761  Radical SAM domain protein  43.24 
 
 
340 aa  293  3e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00535967  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1995  radical SAM domain-containing protein  42.69 
 
 
405 aa  291  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  41.95 
 
 
333 aa  285  1.0000000000000001e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1849  radical SAM family protein  42.77 
 
 
329 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0354  radical SAM domain-containing protein  43.54 
 
 
337 aa  283  3.0000000000000004e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.898506 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1728  hypothetical protein  42.17 
 
 
336 aa  280  3e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.241184  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1006  radical SAM family protein  43.07 
 
 
336 aa  280  4e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  41.95 
 
 
353 aa  279  6e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0779  radical SAM domain-containing protein  40.18 
 
 
336 aa  279  7e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2551  pyruvate formate-lyase activating enzyme-like protein  39.94 
 
 
354 aa  278  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592966  normal  0.73651 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  41.57 
 
 
337 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  39.05 
 
 
339 aa  275  1.0000000000000001e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2854  radical SAM domain-containing protein  41.79 
 
 
337 aa  272  6e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1963  Radical SAM domain protein  43.38 
 
 
334 aa  270  2e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0105086  decreased coverage  0.00565461 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1524  radical SAM domain-containing protein  41.39 
 
 
337 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1034  radical SAM domain-containing protein  42.02 
 
 
337 aa  266  4e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2456  Radical SAM domain protein  40.54 
 
 
337 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  40.91 
 
 
342 aa  265  1e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1150  DNA mismatch repair protein  41.49 
 
 
338 aa  265  1e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.926871 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0904  Radical SAM domain protein  38.07 
 
 
395 aa  263  3e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0776722 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  38.62 
 
 
329 aa  262  8e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  38.62 
 
 
329 aa  262  8e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0348  radical SAM domain-containing protein  40.37 
 
 
336 aa  259  4e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.224287  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0759  radical SAM domain-containing protein  42.51 
 
 
336 aa  259  4e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4120  radical SAM domain-containing protein  39.83 
 
 
372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.424935 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  41.02 
 
 
342 aa  258  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1052  radical SAM family protein  42.2 
 
 
335 aa  256  3e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2293  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  41.79 
 
 
336 aa  256  3e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.388191  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1563  radical SAM domain-containing protein  39.45 
 
 
336 aa  257  3e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.356418 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1841  Radical SAM domain protein  39.35 
 
 
340 aa  256  4e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1063  radical SAM domain-containing protein  39.76 
 
 
336 aa  256  6e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.665632  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1648  radical SAM domain-containing protein  40.49 
 
 
363 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2431  radical SAM domain-containing protein  40.31 
 
 
396 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2136  Radical SAM domain protein  35 
 
 
356 aa  251  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.219183  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1815  radical SAM domain-containing protein  39.26 
 
 
364 aa  249  5e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0217  radical SAM domain-containing protein  34.72 
 
 
356 aa  248  2e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0922  radical SAM domain-containing protein  38.92 
 
 
333 aa  248  2e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2294  radical SAM family protein  39.34 
 
 
332 aa  246  4e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2243  Radical SAM domain protein  39.64 
 
 
337 aa  246  6e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0200  Radical SAM domain protein  41.24 
 
 
386 aa  245  8e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0338  radical SAM domain-containing protein  39.3 
 
 
348 aa  245  9e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0464  Radical SAM domain protein  44.05 
 
 
348 aa  243  3e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.521225  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1625  radical SAM domain-containing protein  40.17 
 
 
363 aa  243  6e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  36.5 
 
 
344 aa  242  7.999999999999999e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0044  Radical SAM domain protein  38.07 
 
 
343 aa  241  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1017  Radical SAM domain protein  38.46 
 
 
335 aa  241  1e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.677632  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0542  radical SAM domain-containing protein  37.57 
 
 
384 aa  241  2e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0194035 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0539  radical SAM domain-containing protein  37.46 
 
 
376 aa  239  4e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00688869  normal  0.395603 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0219  Radical SAM domain protein  39.1 
 
 
337 aa  240  4e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0211251  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  38.55 
 
 
339 aa  238  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1240  radical SAM domain-containing protein  37.05 
 
 
331 aa  238  2e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  36.67 
 
 
362 aa  237  3e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1670  radical SAM domain-containing protein  36.41 
 
 
362 aa  236  4e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0537367  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1215  radical SAM domain-containing protein  36.75 
 
 
331 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  38.23 
 
 
333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0540  radical SAM domain-containing protein  38.05 
 
 
326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0270  radical SAM domain-containing protein  40.97 
 
 
286 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0325  Radical SAM domain protein  38.91 
 
 
333 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1055  radical SAM domain-containing protein  36.53 
 
 
335 aa  231  2e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.146783  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1999  radical SAM domain-containing protein  38.24 
 
 
351 aa  231  2e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.156539  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1698  radical SAM domain-containing protein  37.5 
 
 
337 aa  229  4e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1712  Radical SAM domain protein  39.2 
 
 
351 aa  227  2e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1694  Radical SAM domain protein  44.68 
 
 
280 aa  227  3e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.953973 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1123  radical SAM domain-containing protein  36.62 
 
 
345 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  40.91 
 
 
282 aa  223  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1095  radical SAM domain protein  34.8 
 
 
345 aa  219  5e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>