More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1064 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1064  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 364 aa  744    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0022  radical SAM domain-containing protein  78.33 
 
 		 360 aa  599  1e-170  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0858  radical SAM domain-containing protein  64.01 
 
 		 338 aa  455  1e-127  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.844085 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  43.47 
 
 		 362 aa  262  8e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1150  DNA mismatch repair protein  42.06 
 
 		 338 aa  248  1e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.926871 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2551  pyruvate formate-lyase activating enzyme-like protein  38.97 
 
 		 354 aa  246  6e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592966  normal  0.73651 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1240  radical SAM domain-containing protein  38.84 
 
 		 331 aa  243  5e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1215  radical SAM domain-containing protein  38.53 
 
 		 331 aa  241  1e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0539  radical SAM domain-containing protein  39.47 
 
 		 376 aa  239  4e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00688869  normal  0.395603 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1470  radical SAM domain-containing protein  42.68 
 
 		 342 aa  239  5e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.808287  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1625  radical SAM domain-containing protein  42.34 
 
 		 363 aa  238  1e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1815  radical SAM domain-containing protein  42.12 
 
 		 364 aa  236  4e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  36.05 
 
 		 344 aa  235  1.0000000000000001e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0348  radical SAM domain-containing protein  37.39 
 
 		 336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.224287  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1006  radical SAM family protein  39.7 
 
 		 336 aa  233  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1055  radical SAM domain-containing protein  37.01 
 
 		 335 aa  234  3e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.146783  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0779  radical SAM domain-containing protein  38.86 
 
 		 336 aa  231  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1017  Radical SAM domain protein  39.04 
 
 		 335 aa  231  2e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.677632  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1648  radical SAM domain-containing protein  40.84 
 
 		 363 aa  230  3e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1563  radical SAM domain-containing protein  36.01 
 
 		 336 aa  229  5e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.356418 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1063  radical SAM domain-containing protein  37.09 
 
 		 336 aa  229  6e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.665632  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  38.72 
 
 		 342 aa  229  6e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1999  radical SAM domain-containing protein  38.73 
 
 		 351 aa  229  8e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.156539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0761  Radical SAM domain protein  38.11 
 
 		 340 aa  229  8e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00535967  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0542  radical SAM domain-containing protein  39.53 
 
 		 384 aa  228  1e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0194035 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  37.2 
 
 		 333 aa  227  2e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1995  radical SAM domain-containing protein  38.48 
 
 		 405 aa  227  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  35.28 
 
 		 329 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  35.28 
 
 		 329 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  37.24 
 
 		 353 aa  224  1e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1712  Radical SAM domain protein  36.86 
 
 		 351 aa  224  3e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1034  radical SAM domain-containing protein  38.86 
 
 		 337 aa  223  3e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2294  radical SAM family protein  38.79 
 
 		 332 aa  222  7e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0759  radical SAM domain-containing protein  38.14 
 
 		 336 aa  222  9e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0540  radical SAM domain-containing protein  35.65 
 
 		 326 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0086  radical SAM family protein  41.79 
 
 		 356 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.508004  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  37.84 
 
 		 337 aa  218  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0354  radical SAM domain-containing protein  38.44 
 
 		 337 aa  218  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.898506 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2854  radical SAM domain-containing protein  37.65 
 
 		 337 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 333 aa  216  5e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  38.55 
 
 		 342 aa  216  7e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1698  radical SAM domain-containing protein  35.59 
 
 		 337 aa  216  7e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0103  Radical SAM domain protein  41.16 
 
 		 356 aa  215  9e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2456  Radical SAM domain protein  37.84 
 
 		 337 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4120  radical SAM domain-containing protein  36.39 
 
 		 372 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.424935 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0217  radical SAM domain-containing protein  34.9 
 
 		 356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1963  Radical SAM domain protein  39.57 
 
 		 334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0105086  decreased coverage  0.00565461 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1524  radical SAM domain-containing protein  36.89 
 
 		 337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0093  Radical SAM domain protein  40.92 
 
 		 356 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1052  radical SAM family protein  37.46 
 
 		 335 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0629  Radical SAM domain protein  37.31 
 
 		 343 aa  213  5.999999999999999e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000217214  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0922  radical SAM domain-containing protein  34.04 
 
 		 333 aa  210  4e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1728  hypothetical protein  36.5 
 
 		 336 aa  209  5e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.241184  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1460  radical SAM domain-containing protein  32.52 
 
 		 332 aa  209  6e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0325  Radical SAM domain protein  34.94 
 
 		 333 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2213  radical SAM domain-containing protein  37.85 
 
 		 367 aa  205  9e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0219  Radical SAM domain protein  37.2 
 
 		 337 aa  204  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0211251  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2555  Radical SAM domain protein  38.24 
 
 		 366 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466932  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0904  Radical SAM domain protein  33.82 
 
 		 395 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0776722 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2293  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  35.05 
 
 		 336 aa  202  6e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.388191  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0464  Radical SAM domain protein  38.48 
 
 		 348 aa  202  6e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.521225  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1123  radical SAM domain-containing protein  34.51 
 
 		 345 aa  202  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  38.6 
 
 		 282 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2430  radical SAM domain-containing protein  37.29 
 
 		 365 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0451112 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  33.93 
 
 		 339 aa  200  3.9999999999999996e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3292  Radical SAM domain protein  38.44 
 
 		 366 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1314  radical SAM domain-containing protein  33.92 
 
 		 345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1585  hypothetical protein  37.35 
 
 		 364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2539  Radical SAM domain protein  38.95 
 
 		 360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1005  radical SAM domain-containing protein  36.15 
 
 		 370 aa  197  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2948  radical SAM family Fe-S protein  37.65 
 
 		 347 aa  197  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0044  Radical SAM domain protein  35.44 
 
 		 343 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1841  Radical SAM domain protein  36.53 
 
 		 340 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2431  radical SAM domain-containing protein  35.44 
 
 		 396 aa  196  6e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1670  radical SAM domain-containing protein  35.05 
 
 		 362 aa  196  6e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0537367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  36.53 
 
 		 339 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2136  Radical SAM domain protein  33.63 
 
 		 356 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.219183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0396  radical SAM family protein  36.36 
 
 		 358 aa  193  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0239  Radical SAM domain protein  34.91 
 
 		 358 aa  191  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1325  radical SAM domain-containing protein  36.87 
 
 		 365 aa  191  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.322233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1870  radical SAM domain-containing protein  36.71 
 
 		 374 aa  191  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0449  radical SAM family protein  37.89 
 
 		 370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355453  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2217  Radical SAM domain protein  38.15 
 
 		 374 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6076  radical SAM family protein  36.47 
 
 		 363 aa  190  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2684  Radical SAM domain protein  36.47 
 
 		 367 aa  189  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307935  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2243  Radical SAM domain protein  36.2 
 
 		 337 aa  188  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0088  radical SAM domain-containing protein  39.41 
 
 		 357 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.400989  normal  0.227798 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0898  radical SAM domain-containing protein  34.59 
 
 		 369 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1178  hypothetical protein  35.09 
 
 		 358 aa  186  4e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0574  radical SAM domain protein  35.06 
 
 		 361 aa  186  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0728  Radical SAM domain protein  35.06 
 
 		 361 aa  186  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000489129 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0270  radical SAM domain-containing protein  37.02 
 
 		 286 aa  186  7e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  37.46 
 
 		 294 aa  186  7e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1058  radical SAM domain-containing protein  34.29 
 
 		 382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1095  radical SAM domain protein  32.15 
 
 		 345 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0917  Radical SAM domain protein  35.8 
 
 		 324 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1172  hypothetical protein  34.8 
 
 		 358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2402  radical SAM domain-containing protein  35.46 
 
 		 297 aa  183  5.0000000000000004e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0932  radical SAM domain-containing protein  35.26 
 
 		 362 aa  182  6e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1849  radical SAM family protein  32.82 
 
 		 329 aa  181  2e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>