More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0041 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 362 aa  750    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0539  radical SAM domain-containing protein  52.65 
 
 		 376 aa  360  1e-98  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00688869  normal  0.395603 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1815  radical SAM domain-containing protein  54.55 
 
 		 364 aa  354  1e-96  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0542  radical SAM domain-containing protein  54.1 
 
 		 384 aa  347  1e-94  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0194035 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0217  radical SAM domain-containing protein  49.42 
 
 		 356 aa  347  2e-94  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1999  radical SAM domain-containing protein  48.69 
 
 		 351 aa  344  1e-93  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.156539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1648  radical SAM domain-containing protein  53.19 
 
 		 363 aa  341  1e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  50.44 
 
 		 353 aa  340  2e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1712  Radical SAM domain protein  47.41 
 
 		 351 aa  338  8e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1625  radical SAM domain-containing protein  52.89 
 
 		 363 aa  338  9e-92  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2551  pyruvate formate-lyase activating enzyme-like protein  45.82 
 
 		 354 aa  323  3e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592966  normal  0.73651 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0779  radical SAM domain-containing protein  46.13 
 
 		 336 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  49.07 
 
 		 333 aa  306  5.0000000000000004e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1006  radical SAM family protein  46.43 
 
 		 336 aa  305  7e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1563  radical SAM domain-containing protein  46.2 
 
 		 336 aa  302  8.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.356418 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  46.9 
 
 		 337 aa  301  9e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1524  radical SAM domain-containing protein  44.94 
 
 		 337 aa  301  1e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0348  radical SAM domain-containing protein  45.61 
 
 		 336 aa  300  2e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.224287  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1063  radical SAM domain-containing protein  45.91 
 
 		 336 aa  299  4e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.665632  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1728  hypothetical protein  45.24 
 
 		 336 aa  298  7e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.241184  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  46.42 
 
 		 342 aa  298  9e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2456  Radical SAM domain protein  46.59 
 
 		 337 aa  298  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1150  DNA mismatch repair protein  49.38 
 
 		 338 aa  296  3e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.926871 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1055  radical SAM domain-containing protein  46.18 
 
 		 335 aa  296  4e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.146783  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2854  radical SAM domain-containing protein  46.41 
 
 		 337 aa  293  5e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1034  radical SAM domain-containing protein  47.71 
 
 		 337 aa  292  5e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0761  Radical SAM domain protein  44.67 
 
 		 340 aa  292  6e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00535967  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1995  radical SAM domain-containing protein  45.29 
 
 		 405 aa  290  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1123  radical SAM domain-containing protein  44.98 
 
 		 345 aa  290  4e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1698  radical SAM domain-containing protein  44.44 
 
 		 337 aa  288  8e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2294  radical SAM family protein  46.61 
 
 		 332 aa  288  8e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  43.11 
 
 		 342 aa  287  2e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0759  radical SAM domain-containing protein  47.06 
 
 		 336 aa  286  2.9999999999999996e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0354  radical SAM domain-containing protein  45.75 
 
 		 337 aa  286  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.898506 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0044  Radical SAM domain protein  43.5 
 
 		 343 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1314  radical SAM domain-containing protein  45.26 
 
 		 345 aa  285  7e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0629  Radical SAM domain protein  42.86 
 
 		 343 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000217214  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  45.45 
 
 		 344 aa  282  5.000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2243  Radical SAM domain protein  46.08 
 
 		 337 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0922  radical SAM domain-containing protein  43.62 
 
 		 333 aa  280  2e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1963  Radical SAM domain protein  45.94 
 
 		 334 aa  277  2e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0105086  decreased coverage  0.00565461 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0093  Radical SAM domain protein  43.2 
 
 		 356 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1240  radical SAM domain-containing protein  44.89 
 
 		 331 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0103  Radical SAM domain protein  42.31 
 
 		 356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1215  radical SAM domain-containing protein  44.89 
 
 		 331 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1095  radical SAM domain protein  42.55 
 
 		 345 aa  273  3e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1670  radical SAM domain-containing protein  40.86 
 
 		 362 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0537367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0904  Radical SAM domain protein  41.67 
 
 		 395 aa  273  5.000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0776722 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0086  radical SAM family protein  42.31 
 
 		 356 aa  272  8.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.508004  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1841  Radical SAM domain protein  40.95 
 
 		 340 aa  271  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1052  radical SAM family protein  42.59 
 
 		 335 aa  269  7e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  42.94 
 
 		 333 aa  268  8.999999999999999e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2948  radical SAM family Fe-S protein  42.28 
 
 		 347 aa  267  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2136  Radical SAM domain protein  39.76 
 
 		 356 aa  265  8.999999999999999e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.219183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1017  Radical SAM domain protein  42.2 
 
 		 335 aa  265  1e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.677632  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2431  radical SAM domain-containing protein  41.88 
 
 		 396 aa  263  4e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1064  radical SAM domain-containing protein  43.47 
 
 		 364 aa  262  8e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0540  radical SAM domain-containing protein  44.35 
 
 		 326 aa  261  1e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2555  Radical SAM domain protein  39.31 
 
 		 366 aa  259  6e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466932  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2213  radical SAM domain-containing protein  38.95 
 
 		 367 aa  256  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0464  Radical SAM domain protein  41.23 
 
 		 348 aa  256  5e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.521225  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2539  Radical SAM domain protein  41.07 
 
 		 360 aa  256  6e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1005  radical SAM domain-containing protein  39.94 
 
 		 370 aa  255  8e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0338  radical SAM domain-containing protein  42.42 
 
 		 348 aa  253  3e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4120  radical SAM domain-containing protein  39.94 
 
 		 372 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.424935 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  41.84 
 
 		 339 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1178  hypothetical protein  38.55 
 
 		 358 aa  252  5.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0022  radical SAM domain-containing protein  41.08 
 
 		 360 aa  252  9.000000000000001e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2430  radical SAM domain-containing protein  38.95 
 
 		 365 aa  251  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0451112 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0088  radical SAM domain-containing protein  40.83 
 
 		 357 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.400989  normal  0.227798 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1325  radical SAM domain-containing protein  38.92 
 
 		 365 aa  251  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.322233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0898  radical SAM domain-containing protein  37.87 
 
 		 369 aa  251  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1172  hypothetical protein  38.25 
 
 		 358 aa  250  3e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0219  Radical SAM domain protein  41.76 
 
 		 337 aa  249  5e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0211251  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  40.53 
 
 		 339 aa  249  5e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1969  radical SAM family protein  39.81 
 
 		 370 aa  249  6e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.327469 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2684  Radical SAM domain protein  39.63 
 
 		 367 aa  249  7e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307935  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1058  radical SAM domain-containing protein  38.46 
 
 		 382 aa  247  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0073  pyruvate formate lyase-activating enzyme, putative  38.79 
 
 		 365 aa  246  4e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0200  Radical SAM domain protein  40.29 
 
 		 386 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1460  radical SAM domain-containing protein  38.58 
 
 		 332 aa  246  6e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0325  Radical SAM domain protein  38.78 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1585  hypothetical protein  39.94 
 
 		 364 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0932  radical SAM domain-containing protein  37.03 
 
 		 362 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1497  radical SAM domain-containing protein  39.16 
 
 		 365 aa  243  5e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.398952  normal  0.0425103 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1870  radical SAM domain-containing protein  38.22 
 
 		 374 aa  242  6e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2217  Radical SAM domain protein  39.52 
 
 		 374 aa  240  4e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  38.3 
 
 		 329 aa  239  6.999999999999999e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  38.3 
 
 		 329 aa  239  6.999999999999999e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0574  radical SAM domain protein  39.63 
 
 		 361 aa  239  8e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0728  Radical SAM domain protein  39.63 
 
 		 361 aa  239  8e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000489129 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  45.18 
 
 		 294 aa  238  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3292  Radical SAM domain protein  36.67 
 
 		 366 aa  237  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0858  radical SAM domain-containing protein  41.85 
 
 		 338 aa  235  8e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.844085 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0396  radical SAM family protein  38.39 
 
 		 358 aa  235  9e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2681  Radical SAM domain protein  42.5 
 
 		 314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480916  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6076  radical SAM family protein  39.94 
 
 		 363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5878  Radical SAM domain protein  35.34 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0206709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13159  pyruvate formate lyase activating protein pflA  37.72 
 
 		 362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0893  radical SAM domain-containing protein  34.43 
 
 		 361 aa  232  9e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.910266 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>