179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1430 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1430  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 302 aa  626  1e-178  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.698676  hitchhiker  0.00476012 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0297  radical SAM domain-containing protein  84.93 
 
 		 363 aa  518  1e-146  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1903  radical SAM domain-containing protein  85.22 
 
 		 364 aa  509  1e-143  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.378187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1254  radical SAM domain-containing protein  55.74 
 
 		 384 aa  338  7e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1490  radical SAM domain-containing protein  46.58 
 
 		 377 aa  275  6e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.343112  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1722  radical SAM domain-containing protein  44.52 
 
 		 371 aa  257  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0355  Radical SAM domain protein  46.23 
 
 		 365 aa  257  2e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0403  Radical SAM domain protein  41.92 
 
 		 351 aa  244  9.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00459412  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4016  radical SAM domain-containing protein  44.53 
 
 		 379 aa  236  5.0000000000000005e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.643398  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1582  radical SAM domain-containing protein  42.91 
 
 		 355 aa  230  2e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0102098  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1533  radical SAM domain-containing protein  42.91 
 
 		 355 aa  230  2e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000125557  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2539  Radical SAM domain protein  30.67 
 
 		 360 aa  89.7  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5878  Radical SAM domain protein  30.84 
 
 		 362 aa  89  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0206709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2684  Radical SAM domain protein  29.91 
 
 		 367 aa  87.4  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307935  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1995  radical SAM domain-containing protein  29.87 
 
 		 405 aa  85.5  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0338  radical SAM domain-containing protein  31.31 
 
 		 348 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3292  Radical SAM domain protein  29.02 
 
 		 366 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0088  radical SAM domain-containing protein  27.93 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.400989  normal  0.227798 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2555  Radical SAM domain protein  28.39 
 
 		 366 aa  82.4  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466932  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0932  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 362 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2430  radical SAM domain-containing protein  28.9 
 
 		 365 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0451112 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  26.09 
 
 		 339 aa  80.5  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0761  Radical SAM domain protein  27.11 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00535967  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0396  radical SAM family protein  28.7 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2551  pyruvate formate-lyase activating enzyme-like protein  27.75 
 
 		 354 aa  79.3  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592966  normal  0.73651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6305  Radical SAM domain-containing protein  28.7 
 
 		 388 aa  79.3  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1969  radical SAM family protein  27.8 
 
 		 370 aa  79  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.327469 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6076  radical SAM family protein  29.91 
 
 		 363 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1325  radical SAM domain-containing protein  27.63 
 
 		 365 aa  77.8  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.322233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0354  radical SAM domain-containing protein  26.75 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.898506 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0893  radical SAM domain-containing protein  27.03 
 
 		 361 aa  77.8  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.910266 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2213  radical SAM domain-containing protein  29.68 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1585  hypothetical protein  27.98 
 
 		 364 aa  76.6  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1034  radical SAM domain-containing protein  27.06 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0093  Radical SAM domain protein  28.23 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  25.61 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1849  radical SAM family protein  27.09 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0103  Radical SAM domain protein  28.23 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0574  radical SAM domain protein  28.81 
 
 		 361 aa  75.1  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0728  Radical SAM domain protein  28.81 
 
 		 361 aa  75.1  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000489129 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2136  Radical SAM domain protein  26.73 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.219183  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2402  radical SAM domain-containing protein  30.47 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0904  Radical SAM domain protein  27.11 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0776722 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0086  radical SAM family protein  29.08 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.508004  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0449  radical SAM family protein  29.36 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355453  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1005  radical SAM domain-containing protein  29.02 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0463  radical SAM domain-containing protein  25.11 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.838883  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2217  Radical SAM domain protein  27.98 
 
 		 374 aa  72.8  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1870  radical SAM domain-containing protein  27.97 
 
 		 374 aa  72.4  0.000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0629  Radical SAM domain protein  26.01 
 
 		 343 aa  72  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000217214  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1172  hypothetical protein  22.97 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  28.06 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  26.39 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0898  radical SAM domain-containing protein  29.02 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1524  radical SAM domain-containing protein  27.6 
 
 		 337 aa  68.9  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0270  radical SAM domain-containing protein  29.22 
 
 		 286 aa  68.9  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  26.6 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  26.6 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2948  radical SAM family Fe-S protein  26.69 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1178  hypothetical protein  22.52 
 
 		 358 aa  68.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1058  radical SAM domain-containing protein  27.85 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1150  DNA mismatch repair protein  27.44 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.926871 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1215  radical SAM domain-containing protein  26.21 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1542  pyruvate formate-lyase activating enzyme  28.95 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00863407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1240  radical SAM domain-containing protein  26.21 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0073  pyruvate formate lyase-activating enzyme, putative  25.45 
 
 		 365 aa  67  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  23.58 
 
 		 342 aa  67  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1841  Radical SAM domain protein  25.42 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13159  pyruvate formate lyase activating protein pflA  27.54 
 
 		 362 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0219  Radical SAM domain protein  26.43 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0211251  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  25.96 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1055  radical SAM domain-containing protein  28.19 
 
 		 335 aa  65.9  0.0000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.146783  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1712  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 351 aa  65.9  0.0000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1052  radical SAM family protein  26.73 
 
 		 335 aa  65.9  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  25.46 
 
 		 353 aa  65.5  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0922  radical SAM domain-containing protein  26.61 
 
 		 333 aa  65.9  0.0000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1497  radical SAM domain-containing protein  27.52 
 
 		 365 aa  65.5  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.398952  normal  0.0425103 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2243  Radical SAM domain protein  26.41 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1963  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0105086  decreased coverage  0.00565461 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0539  radical SAM domain-containing protein  25.34 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00688869  normal  0.395603 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0200  Radical SAM domain protein  27.4 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1095  radical SAM domain protein  25.68 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  26.32 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0759  radical SAM domain-containing protein  26.19 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0325  Radical SAM domain protein  26.43 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1123  radical SAM domain-containing protein  24.77 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  24.68 
 
 		 362 aa  58.9  0.00000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2837  pyruvate formate-lyase activating enzyme  25.99 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.128251 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0917  Radical SAM domain protein  25.81 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4120  radical SAM domain-containing protein  22.63 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.424935 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2681  Radical SAM domain protein  24.26 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480916  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1670  radical SAM domain-containing protein  26.29 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0537367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1894  pyruvate formate-lyase activating enzyme  25.21 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.703525  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0542  radical SAM domain-containing protein  27.8 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0194035 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2431  radical SAM domain-containing protein  23.64 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1999  radical SAM domain-containing protein  25.79 
 
 		 351 aa  57  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.156539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1625  radical SAM domain-containing protein  39.47 
 
 		 363 aa  56.2  0.0000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  26.13 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  26.48 
 
 		 344 aa  55.5  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>