256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1490 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1490  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 377 aa  784    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.343112  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1722  radical SAM domain-containing protein  52.6 
 
 		 371 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0355  Radical SAM domain protein  53.02 
 
 		 365 aa  365  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4016  radical SAM domain-containing protein  51.23 
 
 		 379 aa  355  5e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.643398  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1254  radical SAM domain-containing protein  50.41 
 
 		 384 aa  343  4e-93  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0297  radical SAM domain-containing protein  46.59 
 
 		 363 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1903  radical SAM domain-containing protein  45.63 
 
 		 364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.378187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0403  Radical SAM domain protein  42.74 
 
 		 351 aa  297  2e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00459412  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1430  radical SAM domain-containing protein  46.58 
 
 		 302 aa  275  9e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.698676  hitchhiker  0.00476012 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1533  radical SAM domain-containing protein  40.32 
 
 		 355 aa  258  8e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000125557  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1582  radical SAM domain-containing protein  40.32 
 
 		 355 aa  258  8e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0102098  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  26.2 
 
 		 329 aa  91.3  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  26.2 
 
 		 329 aa  91.3  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0922  radical SAM domain-containing protein  25.57 
 
 		 333 aa  89.7  6e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  23.55 
 
 		 282 aa  88.2  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1150  DNA mismatch repair protein  23.93 
 
 		 338 aa  88.2  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.926871 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  25.65 
 
 		 294 aa  88.2  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2431  radical SAM domain-containing protein  26.9 
 
 		 396 aa  86.3  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0354  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 337 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.898506 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0103  Radical SAM domain protein  25.96 
 
 		 356 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  24.45 
 
 		 342 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0629  Radical SAM domain protein  23.46 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000217214  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2551  pyruvate formate-lyase activating enzyme-like protein  26.45 
 
 		 354 aa  84  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592966  normal  0.73651 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  24.27 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0093  Radical SAM domain protein  25.32 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0086  radical SAM family protein  25 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.508004  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1006  radical SAM family protein  25.16 
 
 		 336 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5878  Radical SAM domain protein  25.32 
 
 		 362 aa  81.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0206709  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1728  hypothetical protein  25.57 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.241184  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  23.28 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0464  Radical SAM domain protein  26.5 
 
 		 348 aa  79.7  0.00000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.521225  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0574  radical SAM domain protein  25.4 
 
 		 361 aa  79.7  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1034  radical SAM domain-containing protein  26.11 
 
 		 337 aa  79.7  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0728  Radical SAM domain protein  25.4 
 
 		 361 aa  79.7  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000489129 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0761  Radical SAM domain protein  24.13 
 
 		 340 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00535967  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0396  radical SAM family protein  24.92 
 
 		 358 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  26.48 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2293  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  24.36 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.388191  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2243  Radical SAM domain protein  26.35 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1585  hypothetical protein  24.28 
 
 		 364 aa  76.6  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0219  Radical SAM domain protein  25.57 
 
 		 337 aa  75.9  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0211251  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  21.86 
 
 		 339 aa  75.9  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  26.01 
 
 		 353 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  24.2 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1215  radical SAM domain-containing protein  24.84 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4120  radical SAM domain-containing protein  25.3 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.424935 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0463  radical SAM domain-containing protein  26.84 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.838883  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1524  radical SAM domain-containing protein  23.95 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1240  radical SAM domain-containing protein  24.26 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  24.52 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  23.03 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0338  radical SAM domain-containing protein  25.4 
 
 		 348 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0779  radical SAM domain-containing protein  25.65 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0348  radical SAM domain-containing protein  24.43 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.224287  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1963  Radical SAM domain protein  25.41 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0105086  decreased coverage  0.00565461 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0088  radical SAM domain-containing protein  22.44 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.400989  normal  0.227798 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2456  Radical SAM domain protein  24.21 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1849  radical SAM family protein  22.04 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2539  Radical SAM domain protein  23.08 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1563  radical SAM domain-containing protein  24.35 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.356418 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0932  radical SAM domain-containing protein  23.4 
 
 		 362 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0217  radical SAM domain-containing protein  24.43 
 
 		 356 aa  68.6  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0759  radical SAM domain-containing protein  22.93 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2555  Radical SAM domain protein  22.93 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466932  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0189  Radical SAM domain protein  25.32 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0270  radical SAM domain-containing protein  26.62 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0449  radical SAM family protein  25.64 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355453  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1052  radical SAM family protein  25.39 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2948  radical SAM family Fe-S protein  23.47 
 
 		 347 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0506  pyruvate formate-lyase activating enzyme  25.36 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0339577  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1005  radical SAM domain-containing protein  24.14 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1017  Radical SAM domain protein  23.4 
 
 		 335 aa  67  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.677632  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1841  Radical SAM domain protein  24.13 
 
 		 340 aa  67  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0089  radical SAM domain-containing protein  27.13 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.110563  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1969  radical SAM family protein  25 
 
 		 370 aa  65.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.327469 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1698  radical SAM domain-containing protein  23.32 
 
 		 337 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1460  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  26.96 
 
 		 246 aa  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2217  Radical SAM domain protein  23.64 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1063  radical SAM domain-containing protein  23.86 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.665632  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2245  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  27.72 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0539  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00688869  normal  0.395603 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1055  radical SAM domain-containing protein  25.24 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.146783  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0917  Radical SAM domain protein  24.68 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1701  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  26.73 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.276107 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003978  pyruvate formate-lyase activating enzyme  25.74 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23160  pyruvate formate-lyase activating enzyme  29.19 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1095  radical SAM domain protein  22.81 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1314  radical SAM domain-containing protein  23.05 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1712  Radical SAM domain protein  23.53 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1123  radical SAM domain-containing protein  23.49 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2684  Radical SAM domain protein  23.05 
 
 		 367 aa  63.2  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307935  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0044  Radical SAM domain protein  22.81 
 
 		 343 aa  62.8  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3292  Radical SAM domain protein  22.36 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1996  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  25.49 
 
 		 246 aa  62  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1034  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  26.24 
 
 		 265 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.633483  normal  0.712061 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1272  radical-activating enzyme  32.95 
 
 		 309 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1083  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  26.24 
 
 		 265 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.704189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2219  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  25.98 
 
 		 246 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.542279 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0200  Radical SAM domain protein  23.65 
 
 		 386 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1068  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  26.24 
 
 		 265 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.763935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>