101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_79 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_79  radical SAM domain protein  100 
 
 		 248 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0239  radical SAM domain-containing protein  97.31 
 
 		 223 aa  447  1e-125  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0090  radical SAM domain-containing protein  41 
 
 		 271 aa  199  3e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0089  radical SAM domain-containing protein  40.73 
 
 		 283 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.110563  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0241  radical SAM domain-containing protein  37.15 
 
 		 256 aa  168  7e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_77  radical SAM domain protein  36.76 
 
 		 274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_955  radical SAM domain protein  34.13 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1137  radical SAM domain-containing protein  34.13 
 
 		 273 aa  158  8e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.558403  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0109  radical SAM domain-containing protein  36.52 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0966  radical SAM domain-containing protein  32.94 
 
 		 273 aa  156  4e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_100  radical SAM domain protein  36.96 
 
 		 249 aa  155  4e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1337  radical SAM domain protein  36.96 
 
 		 249 aa  156  4e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0280  radical SAM domain-containing protein  36.09 
 
 		 249 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0622  radical SAM domain-containing protein  35.65 
 
 		 249 aa  149  4e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165455  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0595  radical SAM domain-containing protein  34.5 
 
 		 249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_563  radical SAM domain protein  35.22 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_75  radical SAM domain protein  36.12 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0243  radical SAM domain-containing protein  35.24 
 
 		 246 aa  135  8e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0453811  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1463  radical SAM domain-containing protein  31.78 
 
 		 266 aa  108  6e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0519  radical SAM domain-containing protein  32.2 
 
 		 266 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.149546  normal  0.440492 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  29.36 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  29.36 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4120  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 372 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.424935 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0270  radical SAM domain-containing protein  27.66 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  24.79 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1524  radical SAM domain-containing protein  23.39 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0355  Radical SAM domain protein  32.11 
 
 		 365 aa  59.3  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0219  Radical SAM domain protein  26.57 
 
 		 337 aa  58.9  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0211251  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1006  radical SAM family protein  22.51 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0922  radical SAM domain-containing protein  23.19 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1490  radical SAM domain-containing protein  30.08 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.343112  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2402  radical SAM domain-containing protein  23.23 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  20.19 
 
 		 339 aa  55.5  0.0000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0506  pyruvate formate-lyase activating enzyme  25.75 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0339577  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16340  pyruvate formate-lyase 1-activating enzyme  24.1 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.243728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4016  radical SAM domain-containing protein  32.58 
 
 		 379 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.643398  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0779  radical SAM domain-containing protein  22.98 
 
 		 336 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2293  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  30.47 
 
 		 336 aa  53.5  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.388191  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  24.4 
 
 		 342 aa  53.5  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0354  radical SAM domain-containing protein  22.27 
 
 		 337 aa  52.8  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.898506 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0338  radical SAM domain-containing protein  28.79 
 
 		 348 aa  52.8  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0629  Radical SAM domain protein  22.22 
 
 		 343 aa  52.4  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000217214  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0044  Radical SAM domain protein  19.92 
 
 		 343 aa  52  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2999  radical SAM family protein  27.06 
 
 		 265 aa  51.2  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1469  radical SAM domain-containing protein  24.46 
 
 		 609 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.447014  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1254  radical SAM domain-containing protein  34.83 
 
 		 384 aa  51.6  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1325  radical SAM domain-containing protein  24.88 
 
 		 365 aa  51.6  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.322233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0403  Radical SAM domain protein  23.38 
 
 		 351 aa  51.2  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00459412  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  24.78 
 
 		 339 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2555  Radical SAM domain protein  23.12 
 
 		 366 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466932  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2430  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 365 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0451112 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1722  radical SAM domain-containing protein  30.33 
 
 		 371 aa  49.7  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0761  Radical SAM domain protein  23.39 
 
 		 340 aa  49.7  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00535967  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1017  Radical SAM domain protein  27.56 
 
 		 335 aa  49.3  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.677632  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0158  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  27.6 
 
 		 589 aa  49.3  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2837  pyruvate formate-lyase activating enzyme  29.86 
 
 		 255 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.128251 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  22.6 
 
 		 337 aa  48.9  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  23.86 
 
 		 294 aa  48.9  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1460  radical SAM domain-containing protein  23.89 
 
 		 332 aa  48.9  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0200  Radical SAM domain protein  22.45 
 
 		 386 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1155  Radical SAM domain protein  23.77 
 
 		 319 aa  48.1  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  21.37 
 
 		 342 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0463  radical SAM domain-containing protein  32.89 
 
 		 332 aa  47.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.838883  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2854  radical SAM domain-containing protein  20.19 
 
 		 337 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0026  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 		 578 aa  47  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2456  Radical SAM domain protein  23.08 
 
 		 337 aa  47  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2539  Radical SAM domain protein  26.09 
 
 		 360 aa  47  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1484  radical SAM domain-containing protein  23.24 
 
 		 603 aa  46.2  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5205  Radical SAM domain protein  23.27 
 
 		 268 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1150  DNA mismatch repair protein  20.67 
 
 		 338 aa  46.2  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.926871 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1689  hypothetical protein  22.84 
 
 		 592 aa  45.4  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1694  Radical SAM domain protein  26.62 
 
 		 280 aa  45.8  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.953973 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  21.58 
 
 		 333 aa  45.8  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1052  radical SAM family protein  22.67 
 
 		 335 aa  45.4  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0325  Radical SAM domain protein  23.67 
 
 		 333 aa  45.4  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0498  radical SAM family Fe-S protein  24.32 
 
 		 580 aa  44.7  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1430  radical SAM domain-containing protein  33.71 
 
 		 302 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.698676  hitchhiker  0.00476012 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  23.01 
 
 		 344 aa  44.7  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0917  Radical SAM domain protein  22.71 
 
 		 324 aa  45.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1497  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  25.62 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1533  radical SAM domain-containing protein  25.6 
 
 		 355 aa  44.3  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000125557  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0540  radical SAM domain-containing protein  23.92 
 
 		 326 aa  44.3  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0088  radical SAM domain-containing protein  27.83 
 
 		 357 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.400989  normal  0.227798 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1582  radical SAM domain-containing protein  25.6 
 
 		 355 aa  44.3  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0102098  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1894  pyruvate formate-lyase activating enzyme  24.51 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.703525  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1398  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  25 
 
 		 262 aa  43.5  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1081  pyruvate formate-lyase activating  31.29 
 
 		 267 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.257983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2981  pyruvate formate-lyase activating  30.61 
 
 		 267 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.743712  normal  0.290746 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  25.45 
 
 		 333 aa  43.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2213  radical SAM domain-containing protein  23.5 
 
 		 367 aa  42.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1841  Radical SAM domain protein  21.53 
 
 		 340 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23160  pyruvate formate-lyase activating enzyme  24.31 
 
 		 247 aa  42.7  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1314  radical SAM domain-containing protein  23.79 
 
 		 345 aa  42.7  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2000  radical SAM family protein  24.05 
 
 		 565 aa  42.7  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.345237  normal  0.435892 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3308  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  29.29 
 
 		 246 aa  42.4  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.760643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1064  radical SAM domain-containing protein  23.27 
 
 		 364 aa  42.4  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1593  radical SAM domain-containing protein  23.12 
 
 		 587 aa  42.4  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.170926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0432  pyruvate formate-lyase activating enzyme  32.29 
 
 		 243 aa  42.7  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0425  formate acetyltransferase activating enzyme (pyruvate formate-lyase activating enzyme)  31.52 
 
 		 243 aa  42  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2049  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  25.68 
 
 		 595 aa  42.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000650281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>