64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_77 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_77  radical SAM domain protein  100 
 
 		 274 aa  574  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0241  radical SAM domain-containing protein  98.05 
 
 		 256 aa  528  1e-149  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1137  radical SAM domain-containing protein  56.13 
 
 		 273 aa  319  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.558403  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0966  radical SAM domain-containing protein  55.76 
 
 		 273 aa  318  3.9999999999999996e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_955  radical SAM domain protein  56.93 
 
 		 273 aa  315  4e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0090  radical SAM domain-containing protein  44.36 
 
 		 271 aa  210  2e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0089  radical SAM domain-containing protein  38.35 
 
 		 283 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.110563  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0280  radical SAM domain-containing protein  43.29 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0109  radical SAM domain-containing protein  43.29 
 
 		 249 aa  171  2e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_79  radical SAM domain protein  36.76 
 
 		 248 aa  166  4e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_100  radical SAM domain protein  41.88 
 
 		 249 aa  162  7e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1337  radical SAM domain protein  41.45 
 
 		 249 aa  160  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0595  radical SAM domain-containing protein  40.17 
 
 		 249 aa  145  6e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0622  radical SAM domain-containing protein  40.09 
 
 		 249 aa  145  8.000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165455  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0239  radical SAM domain-containing protein  36.68 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_563  radical SAM domain protein  39.48 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_75  radical SAM domain protein  32.26 
 
 		 246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0243  radical SAM domain-containing protein  31.45 
 
 		 246 aa  132  5e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0453811  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0519  radical SAM domain-containing protein  28.87 
 
 		 266 aa  99.4  6e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.149546  normal  0.440492 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1463  radical SAM domain-containing protein  27.62 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0761  Radical SAM domain protein  25.98 
 
 		 340 aa  63.9  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00535967  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  30.64 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  24.26 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  24.26 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1017  Radical SAM domain protein  29.86 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.677632  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1254  radical SAM domain-containing protein  34.58 
 
 		 384 aa  55.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0158  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  23.71 
 
 		 589 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2402  radical SAM domain-containing protein  24.36 
 
 		 297 aa  52.4  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0219  Radical SAM domain protein  23.95 
 
 		 337 aa  51.6  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0211251  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1095  radical SAM domain protein  24.16 
 
 		 345 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0403  Radical SAM domain protein  37.66 
 
 		 351 aa  51.2  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00459412  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1123  radical SAM domain-containing protein  24.81 
 
 		 345 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1694  Radical SAM domain protein  27 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.953973 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1453  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  25.31 
 
 		 236 aa  50.1  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0238832  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1460  radical SAM domain-containing protein  22.57 
 
 		 332 aa  50.1  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  24.32 
 
 		 294 aa  48.9  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  24.67 
 
 		 339 aa  48.9  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0917  Radical SAM domain protein  25.4 
 
 		 324 aa  48.1  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4016  radical SAM domain-containing protein  35.37 
 
 		 379 aa  47.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.643398  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1582  radical SAM domain-containing protein  26.78 
 
 		 355 aa  47  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0102098  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1533  radical SAM domain-containing protein  26.78 
 
 		 355 aa  47  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000125557  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0355  Radical SAM domain protein  35.44 
 
 		 365 aa  46.6  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3389  hypothetical protein  31.88 
 
 		 215 aa  46.6  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000102267  normal  0.0705776 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1215  radical SAM domain-containing protein  35.29 
 
 		 331 aa  46.2  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1722  radical SAM domain-containing protein  30.19 
 
 		 371 aa  46.6  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1240  radical SAM domain-containing protein  35.29 
 
 		 331 aa  46.2  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0511  hypothetical protein  20.96 
 
 		 590 aa  45.8  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0325  Radical SAM domain protein  23.16 
 
 		 333 aa  45.4  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1314  radical SAM domain-containing protein  22.68 
 
 		 345 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  25.43 
 
 		 468 aa  45.4  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0858  radical SAM domain-containing protein  27.43 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.844085 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0779  radical SAM domain-containing protein  23.89 
 
 		 336 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2049  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  20.42 
 
 		 595 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000650281  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4120  radical SAM domain-containing protein  22.07 
 
 		 372 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.424935 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1903  radical SAM domain-containing protein  27.07 
 
 		 364 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.378187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1593  radical SAM domain-containing protein  23.18 
 
 		 587 aa  43.9  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.170926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0270  radical SAM domain-containing protein  25.17 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1469  radical SAM domain-containing protein  21.19 
 
 		 609 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.447014  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4973  pyruvate formate lyase activating enzyme  27.27 
 
 		 287 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.577557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1490  radical SAM domain-containing protein  32.47 
 
 		 377 aa  42.7  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.343112  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1484  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 603 aa  42.7  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0922  radical SAM domain-containing protein  23.14 
 
 		 333 aa  42.7  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1568  radical SAM family protein  24.75 
 
 		 291 aa  42.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5892  radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 287 aa  42.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>