73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0239 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0239  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 223 aa  462  1e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_79  radical SAM domain protein  97.31 
 
 		 248 aa  447  1e-125  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0090  radical SAM domain-containing protein  42.06 
 
 		 271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0241  radical SAM domain-containing protein  37.12 
 
 		 256 aa  142  3e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_77  radical SAM domain protein  36.68 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0089  radical SAM domain-containing protein  37.33 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.110563  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0109  radical SAM domain-containing protein  37.2 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1337  radical SAM domain protein  37.2 
 
 		 249 aa  139  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_100  radical SAM domain protein  37.2 
 
 		 249 aa  138  6e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0280  radical SAM domain-containing protein  36.71 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_955  radical SAM domain protein  32.75 
 
 		 273 aa  135  5e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0966  radical SAM domain-containing protein  32.31 
 
 		 273 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1137  radical SAM domain-containing protein  33.19 
 
 		 273 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.558403  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0622  radical SAM domain-containing protein  34.78 
 
 		 249 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165455  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0595  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 249 aa  124  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_563  radical SAM domain protein  34.3 
 
 		 249 aa  123  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_75  radical SAM domain protein  34.15 
 
 		 246 aa  111  9e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0243  radical SAM domain-containing protein  33.17 
 
 		 246 aa  105  6e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0453811  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1463  radical SAM domain-containing protein  29.38 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0519  radical SAM domain-containing protein  29.38 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.149546  normal  0.440492 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  31.85 
 
 		 329 aa  68.9  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  31.85 
 
 		 329 aa  68.9  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4120  radical SAM domain-containing protein  28.42 
 
 		 372 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.424935 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0270  radical SAM domain-containing protein  27.42 
 
 		 286 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0922  radical SAM domain-containing protein  25.87 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0355  Radical SAM domain protein  31.19 
 
 		 365 aa  55.1  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  27.66 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1490  radical SAM domain-containing protein  29.32 
 
 		 377 aa  54.7  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.343112  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0219  Radical SAM domain protein  32.69 
 
 		 337 aa  53.9  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0211251  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1524  radical SAM domain-containing protein  25.53 
 
 		 337 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2293  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  31.25 
 
 		 336 aa  52.4  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.388191  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4016  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 379 aa  51.2  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.643398  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2402  radical SAM domain-containing protein  31.07 
 
 		 297 aa  50.8  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0506  pyruvate formate-lyase activating enzyme  27.75 
 
 		 238 aa  49.7  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0339577  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1722  radical SAM domain-containing protein  31.97 
 
 		 371 aa  50.1  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0338  radical SAM domain-containing protein  28.03 
 
 		 348 aa  50.1  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0403  Radical SAM domain protein  22.73 
 
 		 351 aa  49.7  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00459412  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2999  radical SAM family protein  27.06 
 
 		 265 aa  48.5  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1254  radical SAM domain-containing protein  29.34 
 
 		 384 aa  48.5  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1155  Radical SAM domain protein  26.42 
 
 		 319 aa  48.1  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16340  pyruvate formate-lyase 1-activating enzyme  23.49 
 
 		 287 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.243728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1469  radical SAM domain-containing protein  24.49 
 
 		 609 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.447014  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  22.36 
 
 		 339 aa  47.4  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0463  radical SAM domain-containing protein  28.46 
 
 		 332 aa  47  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.838883  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0629  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 343 aa  47.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000217214  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0779  radical SAM domain-containing protein  25.32 
 
 		 336 aa  46.6  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1006  radical SAM family protein  22.58 
 
 		 336 aa  46.6  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0200  Radical SAM domain protein  25.9 
 
 		 386 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1694  Radical SAM domain protein  26.62 
 
 		 280 aa  45.8  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.953973 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1017  Radical SAM domain protein  26.28 
 
 		 335 aa  45.4  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.677632  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2837  pyruvate formate-lyase activating enzyme  29.17 
 
 		 255 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.128251 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0354  radical SAM domain-containing protein  23.61 
 
 		 337 aa  45.1  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.898506 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1448  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic-like  31.08 
 
 		 234 aa  45.1  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.236799 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1398  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  28.48 
 
 		 262 aa  44.7  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0044  Radical SAM domain protein  22.29 
 
 		 343 aa  44.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0325  Radical SAM domain protein  29.63 
 
 		 333 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1460  radical SAM domain-containing protein  27.69 
 
 		 332 aa  45.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1484  radical SAM domain-containing protein  28.28 
 
 		 603 aa  43.9  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0761  Radical SAM domain protein  25.55 
 
 		 340 aa  44.3  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00535967  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2456  Radical SAM domain protein  25.17 
 
 		 337 aa  43.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  23.21 
 
 		 342 aa  42.7  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2854  radical SAM domain-containing protein  23.08 
 
 		 337 aa  42.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  25.44 
 
 		 342 aa  42.4  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  25.32 
 
 		 339 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001155  pyruvate formate-lyase activating enzyme  29.31 
 
 		 309 aa  42.4  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000234207  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1430  radical SAM domain-containing protein  34.94 
 
 		 302 aa  42.4  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.698676  hitchhiker  0.00476012 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1497  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  26.88 
 
 		 246 aa  42.4  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1605  pyruvate-formate lyase activating enzyme  27.84 
 
 		 266 aa  42  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  27.07 
 
 		 344 aa  42  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0026  radical SAM domain-containing protein  24.82 
 
 		 578 aa  41.6  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  26.79 
 
 		 294 aa  41.6  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0158  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  27.96 
 
 		 589 aa  41.6  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2555  Radical SAM domain protein  24.14 
 
 		 366 aa  41.6  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>