41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_75 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_75  radical SAM domain protein  100 
 
 		 246 aa  513  1e-144  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0243  radical SAM domain-containing protein  97.97 
 
 		 246 aa  501  1e-141  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0453811  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0595  radical SAM domain-containing protein  42.97 
 
 		 249 aa  214  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_563  radical SAM domain protein  42.97 
 
 		 249 aa  210  1e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0622  radical SAM domain-containing protein  42.17 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165455  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0109  radical SAM domain-containing protein  41.13 
 
 		 249 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_100  radical SAM domain protein  41.53 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1337  radical SAM domain protein  41.13 
 
 		 249 aa  198  5e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0280  radical SAM domain-containing protein  40.73 
 
 		 249 aa  197  9e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_955  radical SAM domain protein  35.08 
 
 		 273 aa  162  6e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1137  radical SAM domain-containing protein  35.22 
 
 		 273 aa  160  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.558403  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0090  radical SAM domain-containing protein  36.4 
 
 		 271 aa  159  5e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0966  radical SAM domain-containing protein  33.6 
 
 		 273 aa  155  7e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0089  radical SAM domain-containing protein  34.04 
 
 		 283 aa  153  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.110563  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_79  radical SAM domain protein  36.12 
 
 		 248 aa  141  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0241  radical SAM domain-containing protein  32.26 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_77  radical SAM domain protein  32.26 
 
 		 274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0239  radical SAM domain-containing protein  34.15 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0519  radical SAM domain-containing protein  29.66 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.149546  normal  0.440492 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1463  radical SAM domain-containing protein  30.51 
 
 		 266 aa  91.3  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0540  radical SAM domain-containing protein  23.79 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2363  radical SAM domain-containing protein  24.39 
 
 		 566 aa  55.8  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.607234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  26.96 
 
 		 282 aa  51.2  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2061  Radical SAM domain protein  24.82 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000288905 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1215  radical SAM domain-containing protein  21.15 
 
 		 331 aa  47  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1240  radical SAM domain-containing protein  21.15 
 
 		 331 aa  46.6  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3944  radical SAM domain-containing protein  21.82 
 
 		 292 aa  45.8  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2284  radical SAM domain-containing protein  24.26 
 
 		 298 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00260507  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1601  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  25 
 
 		 236 aa  45.8  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2401  radical SAM domain-containing protein  28.35 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312992  unclonable  0.00000836266 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01544  pyruvate formate-lyase 1 activating enzyme  25.15 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  20.3 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1953  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  25.29 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2065  radical SAM domain-containing protein  23.36 
 
 		 300 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1490  radical SAM domain-containing protein  25.7 
 
 		 377 aa  43.5  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.343112  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  25.64 
 
 		 294 aa  43.5  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  22.99 
 
 		 362 aa  43.1  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5892  radical SAM domain protein  23.26 
 
 		 287 aa  42.7  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4977  radical SAM domain-containing protein  23.23 
 
 		 287 aa  42  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.258865  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0403  Radical SAM domain protein  22.28 
 
 		 351 aa  42  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00459412  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4614  radical SAM domain-containing protein  23.23 
 
 		 287 aa  42  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>