50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0966 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0966  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 273 aa  570  1e-161  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_955  radical SAM domain protein  93.41 
 
 		 273 aa  541  1e-153  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1137  radical SAM domain-containing protein  94.51 
 
 		 273 aa  543  1e-153  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.558403  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0241  radical SAM domain-containing protein  58.62 
 
 		 256 aa  322  3e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_77  radical SAM domain protein  55.76 
 
 		 274 aa  318  3.9999999999999996e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0090  radical SAM domain-containing protein  43.91 
 
 		 271 aa  191  8e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0109  radical SAM domain-containing protein  42.49 
 
 		 249 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0280  radical SAM domain-containing protein  42.49 
 
 		 249 aa  175  6e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0089  radical SAM domain-containing protein  39.24 
 
 		 283 aa  168  7e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.110563  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_100  radical SAM domain protein  40.69 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1337  radical SAM domain protein  40.69 
 
 		 249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_79  radical SAM domain protein  32.94 
 
 		 248 aa  156  4e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_75  radical SAM domain protein  33.6 
 
 		 246 aa  155  9e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0243  radical SAM domain-containing protein  33.2 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0453811  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0595  radical SAM domain-containing protein  35.32 
 
 		 249 aa  149  5e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0622  radical SAM domain-containing protein  36.91 
 
 		 249 aa  149  7e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165455  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_563  radical SAM domain protein  36.17 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0239  radical SAM domain-containing protein  32.31 
 
 		 223 aa  133  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0519  radical SAM domain-containing protein  30.04 
 
 		 266 aa  95.9  7e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.149546  normal  0.440492 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1463  radical SAM domain-containing protein  29.22 
 
 		 266 aa  95.1  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1170  pyruvate formate-lyase activating enzyme  27.01 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.763287  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0297  radical SAM domain-containing protein  29.93 
 
 		 363 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1357  pyruvate formate-lyase activating enzyme  27.01 
 
 		 235 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1722  radical SAM domain-containing protein  38.1 
 
 		 371 aa  53.5  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1254  radical SAM domain-containing protein  34.09 
 
 		 384 aa  52.8  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1430  radical SAM domain-containing protein  29.2 
 
 		 302 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.698676  hitchhiker  0.00476012 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1903  radical SAM domain-containing protein  28.47 
 
 		 364 aa  50.1  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.378187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0355  Radical SAM domain protein  34.15 
 
 		 365 aa  48.5  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2837  pyruvate formate-lyase activating enzyme  28.03 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.128251 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1671  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  27.54 
 
 		 246 aa  47.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0803873  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1095  radical SAM domain protein  24.57 
 
 		 345 aa  47  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0403  Radical SAM domain protein  27.41 
 
 		 351 aa  46.6  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00459412  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  23.08 
 
 		 329 aa  46.2  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  23.08 
 
 		 329 aa  46.2  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1694  Radical SAM domain protein  26.69 
 
 		 280 aa  45.8  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.953973 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1953  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  27.07 
 
 		 245 aa  45.8  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1874  radical SAM domain-containing protein  23.2 
 
 		 241 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1123  radical SAM domain-containing protein  23.73 
 
 		 345 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01544  pyruvate formate-lyase 1 activating enzyme  24.81 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003978  pyruvate formate-lyase activating enzyme  22.97 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0802  radical SAM family Fe-S protein  24.22 
 
 		 561 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  30.69 
 
 		 347 aa  43.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4973  pyruvate formate lyase activating enzyme  24.81 
 
 		 287 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.577557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1582  radical SAM domain-containing protein  30.63 
 
 		 355 aa  43.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0102098  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  23.43 
 
 		 468 aa  43.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1533  radical SAM domain-containing protein  30.63 
 
 		 355 aa  43.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000125557  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0917  Radical SAM domain protein  25.46 
 
 		 324 aa  42.7  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1396  glycerol dehydratase activating enzyme  26.67 
 
 		 322 aa  42.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.214688  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  21.66 
 
 		 339 aa  42.4  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1314  radical SAM domain-containing protein  23.28 
 
 		 345 aa  42.4  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>