55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_563 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_563  radical SAM domain protein  100 
 
 		 249 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0595  radical SAM domain-containing protein  96.39 
 
 		 249 aa  483  1e-135  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0622  radical SAM domain-containing protein  96.39 
 
 		 249 aa  474  1e-133  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165455  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_100  radical SAM domain protein  54 
 
 		 249 aa  286  2e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1337  radical SAM domain protein  53.6 
 
 		 249 aa  285  5e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0109  radical SAM domain-containing protein  52.4 
 
 		 249 aa  284  9e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0280  radical SAM domain-containing protein  52 
 
 		 249 aa  281  5.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_75  radical SAM domain protein  42.97 
 
 		 246 aa  230  2e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0243  radical SAM domain-containing protein  42.57 
 
 		 246 aa  228  8e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0453811  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0090  radical SAM domain-containing protein  37.34 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_955  radical SAM domain protein  37.02 
 
 		 273 aa  166  4e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1137  radical SAM domain-containing protein  37.45 
 
 		 273 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.558403  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0966  radical SAM domain-containing protein  36.17 
 
 		 273 aa  159  3e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0089  radical SAM domain-containing protein  37.29 
 
 		 283 aa  158  6e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.110563  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0241  radical SAM domain-containing protein  39.91 
 
 		 256 aa  158  8e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_79  radical SAM domain protein  35.22 
 
 		 248 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_77  radical SAM domain protein  39.48 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0239  radical SAM domain-containing protein  34.3 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0519  radical SAM domain-containing protein  27.5 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.149546  normal  0.440492 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1463  radical SAM domain-containing protein  27.5 
 
 		 266 aa  78.6  0.00000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1254  radical SAM domain-containing protein  25.49 
 
 		 384 aa  59.3  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  32.65 
 
 		 329 aa  58.9  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  32.65 
 
 		 329 aa  58.9  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0403  Radical SAM domain protein  25.51 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00459412  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1490  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 377 aa  55.8  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.343112  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0355  Radical SAM domain protein  31.33 
 
 		 365 aa  55.8  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2070  Radical SAM domain protein  27.69 
 
 		 593 aa  55.5  0.0000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  25.7 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1240  radical SAM domain-containing protein  26.91 
 
 		 331 aa  50.8  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1215  radical SAM domain-containing protein  26.91 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0219  Radical SAM domain protein  26 
 
 		 337 aa  50.1  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0211251  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1460  radical SAM domain-containing protein  27.12 
 
 		 332 aa  49.7  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1533  radical SAM domain-containing protein  25.74 
 
 		 355 aa  48.9  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000125557  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1582  radical SAM domain-containing protein  25.74 
 
 		 355 aa  48.9  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0102098  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0498  radical SAM family Fe-S protein  27.27 
 
 		 580 aa  48.5  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0540  radical SAM domain-containing protein  23.14 
 
 		 326 aa  48.1  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17370  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  26.45 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.519669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1874  radical SAM domain-containing protein  23.78 
 
 		 241 aa  47  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1712  Radical SAM domain protein  23.32 
 
 		 351 aa  46.6  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1469  radical SAM domain-containing protein  25.13 
 
 		 609 aa  46.6  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.447014  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1722  radical SAM domain-containing protein  23.2 
 
 		 371 aa  46.2  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2061  Radical SAM domain protein  26.45 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000288905 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0761  Radical SAM domain protein  22.5 
 
 		 340 aa  45.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00535967  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0158  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  23.5 
 
 		 589 aa  45.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  23.16 
 
 		 339 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  23.77 
 
 		 342 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2284  radical SAM domain-containing protein  26.45 
 
 		 298 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00260507  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2000  radical SAM family protein  25.13 
 
 		 565 aa  43.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.345237  normal  0.435892 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4016  radical SAM domain-containing protein  26.58 
 
 		 379 aa  43.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.643398  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  27.66 
 
 		 333 aa  42.7  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0629  Radical SAM domain protein  26.19 
 
 		 343 aa  42.7  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000217214  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  28.21 
 
 		 1226 aa  42.4  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0026  radical SAM domain-containing protein  25.27 
 
 		 578 aa  42.4  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2293  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  24.77 
 
 		 336 aa  42  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.388191  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0270  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 286 aa  42  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>