281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0158 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0158  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  100 
 
 		 589 aa  1214    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1689  hypothetical protein  53.55 
 
 		 592 aa  669    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1469  radical SAM domain-containing protein  56.23 
 
 		 609 aa  693    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.447014  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2070  Radical SAM domain protein  50.09 
 
 		 593 aa  616  1e-175  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0026  radical SAM domain-containing protein  48.45 
 
 		 578 aa  541  9.999999999999999e-153  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1593  radical SAM domain-containing protein  43.78 
 
 		 587 aa  537  1e-151  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.170926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0498  radical SAM family Fe-S protein  43.67 
 
 		 580 aa  533  1e-150  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1597  Radical SAM domain protein  44.14 
 
 		 589 aa  504  1e-141  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1484  radical SAM domain-containing protein  43.03 
 
 		 603 aa  485  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0511  hypothetical protein  40.61 
 
 		 590 aa  472  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2049  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  41.95 
 
 		 595 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000650281  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1997  radical SAM family protein  39.72 
 
 		 585 aa  456  1e-127  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2282  hypothetical protein  39.8 
 
 		 633 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00815982  normal  0.295963 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2363  radical SAM domain-containing protein  39.75 
 
 		 566 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.607234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2000  radical SAM family protein  33.57 
 
 		 565 aa  343  4e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.345237  normal  0.435892 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1474  radical SAM domain-containing protein  34.87 
 
 		 335 aa  160  9e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1123  radical SAM domain-containing protein  28.99 
 
 		 345 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0338  radical SAM domain-containing protein  30.59 
 
 		 348 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2294  radical SAM family protein  32.78 
 
 		 332 aa  134  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1095  radical SAM domain protein  29.08 
 
 		 345 aa  133  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0325  Radical SAM domain protein  27.88 
 
 		 333 aa  133  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  28.48 
 
 		 333 aa  133  9e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1314  radical SAM domain-containing protein  28.87 
 
 		 345 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2551  pyruvate formate-lyase activating enzyme-like protein  27.72 
 
 		 354 aa  132  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592966  normal  0.73651 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  28.52 
 
 		 329 aa  130  7.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  28.52 
 
 		 329 aa  130  7.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1017  Radical SAM domain protein  30.43 
 
 		 335 aa  130  9.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.677632  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0464  Radical SAM domain protein  29.08 
 
 		 348 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.521225  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0219  Radical SAM domain protein  31.8 
 
 		 337 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0211251  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1215  radical SAM domain-containing protein  28.86 
 
 		 331 aa  128  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1240  radical SAM domain-containing protein  28.86 
 
 		 331 aa  128  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  26.05 
 
 		 344 aa  128  4.0000000000000003e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  27.19 
 
 		 353 aa  127  5e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0270  radical SAM domain-containing protein  32.49 
 
 		 286 aa  125  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1150  DNA mismatch repair protein  28.09 
 
 		 338 aa  124  6e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.926871 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  29.19 
 
 		 342 aa  123  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  29.61 
 
 		 337 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0022  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 360 aa  123  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  28.62 
 
 		 333 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0922  radical SAM domain-containing protein  29 
 
 		 333 aa  121  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1064  radical SAM domain-containing protein  28.7 
 
 		 364 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0239  Radical SAM domain protein  27.41 
 
 		 358 aa  121  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1524  radical SAM domain-containing protein  25.85 
 
 		 337 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0103  Radical SAM domain protein  29.64 
 
 		 356 aa  120  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2217  Radical SAM domain protein  28.62 
 
 		 374 aa  119  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0044  Radical SAM domain protein  27.04 
 
 		 343 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0761  Radical SAM domain protein  25.99 
 
 		 340 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00535967  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0093  Radical SAM domain protein  29.32 
 
 		 356 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1995  radical SAM domain-containing protein  28.39 
 
 		 405 aa  118  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2456  Radical SAM domain protein  28.48 
 
 		 337 aa  117  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1460  radical SAM domain-containing protein  28.06 
 
 		 332 aa  117  5e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0086  radical SAM family protein  30.1 
 
 		 356 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.508004  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1585  hypothetical protein  26.58 
 
 		 364 aa  117  8.999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0354  radical SAM domain-containing protein  28.96 
 
 		 337 aa  117  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.898506 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  26.33 
 
 		 339 aa  116  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  25.84 
 
 		 342 aa  115  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0217  radical SAM domain-containing protein  25.66 
 
 		 356 aa  115  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0917  Radical SAM domain protein  26.93 
 
 		 324 aa  115  3e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2293  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  29.37 
 
 		 336 aa  114  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.388191  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1712  Radical SAM domain protein  26.04 
 
 		 351 aa  114  7.000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0759  radical SAM domain-containing protein  26.9 
 
 		 336 aa  113  8.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  27.05 
 
 		 362 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2854  radical SAM domain-containing protein  32.05 
 
 		 337 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0540  radical SAM domain-containing protein  29.25 
 
 		 326 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1034  radical SAM domain-containing protein  27.62 
 
 		 337 aa  113  9e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5878  Radical SAM domain protein  27.6 
 
 		 362 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0206709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0396  radical SAM family protein  26.73 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1963  Radical SAM domain protein  26.98 
 
 		 334 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0105086  decreased coverage  0.00565461 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2243  Radical SAM domain protein  27.81 
 
 		 337 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6076  radical SAM family protein  27.94 
 
 		 363 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1325  radical SAM domain-containing protein  27.99 
 
 		 365 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.322233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3292  Radical SAM domain protein  27.84 
 
 		 366 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1006  radical SAM family protein  28.33 
 
 		 336 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4120  radical SAM domain-containing protein  25.57 
 
 		 372 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.424935 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0539  radical SAM domain-containing protein  24.77 
 
 		 376 aa  111  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00688869  normal  0.395603 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1728  hypothetical protein  27.57 
 
 		 336 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.241184  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1625  radical SAM domain-containing protein  29.04 
 
 		 363 aa  109  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0574  radical SAM domain protein  27.6 
 
 		 361 aa  109  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0728  Radical SAM domain protein  27.6 
 
 		 361 aa  109  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000489129 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1470  radical SAM domain-containing protein  27.85 
 
 		 342 aa  109  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.808287  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2555  Radical SAM domain protein  28 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466932  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0629  Radical SAM domain protein  24.55 
 
 		 343 aa  109  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000217214  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1648  radical SAM domain-containing protein  27.91 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0779  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 336 aa  108  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1999  radical SAM domain-containing protein  25.36 
 
 		 351 aa  107  4e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.156539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2431  radical SAM domain-containing protein  28.76 
 
 		 396 aa  107  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1815  radical SAM domain-containing protein  26.95 
 
 		 364 aa  107  5e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0542  radical SAM domain-containing protein  26.05 
 
 		 384 aa  107  5e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0194035 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  28.06 
 
 		 282 aa  107  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0858  radical SAM domain-containing protein  29.14 
 
 		 338 aa  107  7e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.844085 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  27.61 
 
 		 339 aa  106  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0073  pyruvate formate lyase-activating enzyme, putative  26.62 
 
 		 365 aa  106  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2402  radical SAM domain-containing protein  25.18 
 
 		 297 aa  105  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1969  radical SAM family protein  25.83 
 
 		 370 aa  105  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.327469 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1005  radical SAM domain-containing protein  27.24 
 
 		 370 aa  105  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2539  Radical SAM domain protein  27.96 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1497  radical SAM domain-containing protein  27.12 
 
 		 365 aa  103  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.398952  normal  0.0425103 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2430  radical SAM domain-containing protein  27.06 
 
 		 365 aa  101  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0451112 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1670  radical SAM domain-containing protein  27.48 
 
 		 362 aa  101  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0537367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  29.47 
 
 		 294 aa  101  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>