77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0109 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0109  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 249 aa  512  1e-144  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0280  radical SAM domain-containing protein  99.6 
 
 		 249 aa  509  1e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_100  radical SAM domain protein  83.94 
 
 		 249 aa  437  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1337  radical SAM domain protein  83.53 
 
 		 249 aa  437  1e-121  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0595  radical SAM domain-containing protein  52.8 
 
 		 249 aa  275  5e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0622  radical SAM domain-containing protein  52.8 
 
 		 249 aa  272  3e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165455  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_563  radical SAM domain protein  52.4 
 
 		 249 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_75  radical SAM domain protein  41.13 
 
 		 246 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0243  radical SAM domain-containing protein  40.32 
 
 		 246 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0453811  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1137  radical SAM domain-containing protein  43.29 
 
 		 273 aa  181  7e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.558403  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_955  radical SAM domain protein  43.04 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0966  radical SAM domain-containing protein  42.49 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0090  radical SAM domain-containing protein  40.42 
 
 		 271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0241  radical SAM domain-containing protein  42.86 
 
 		 256 aa  172  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_77  radical SAM domain protein  43.29 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0089  radical SAM domain-containing protein  38.1 
 
 		 283 aa  162  6e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.110563  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_79  radical SAM domain protein  36.52 
 
 		 248 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0239  radical SAM domain-containing protein  37.2 
 
 		 223 aa  140  3e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0519  radical SAM domain-containing protein  34.41 
 
 		 266 aa  106  3e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.149546  normal  0.440492 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1463  radical SAM domain-containing protein  34.45 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0403  Radical SAM domain protein  27.23 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00459412  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0761  Radical SAM domain protein  23.04 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00535967  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1469  radical SAM domain-containing protein  26.18 
 
 		 609 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.447014  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0629  Radical SAM domain protein  24.19 
 
 		 343 aa  52.4  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000217214  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4120  radical SAM domain-containing protein  22.86 
 
 		 372 aa  52  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.424935 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1006  radical SAM family protein  24.88 
 
 		 336 aa  51.2  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0779  radical SAM domain-containing protein  26.84 
 
 		 336 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1254  radical SAM domain-containing protein  31.11 
 
 		 384 aa  50.4  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  26.61 
 
 		 329 aa  50.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  26.61 
 
 		 329 aa  50.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1722  radical SAM domain-containing protein  33.73 
 
 		 371 aa  50.1  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1670  radical SAM domain-containing protein  23.77 
 
 		 362 aa  48.9  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0537367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  26.03 
 
 		 342 aa  48.9  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0355  Radical SAM domain protein  33.73 
 
 		 365 aa  48.5  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1874  radical SAM domain-containing protein  28.21 
 
 		 241 aa  48.5  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1841  Radical SAM domain protein  25.88 
 
 		 340 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1524  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 337 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1490  radical SAM domain-containing protein  26.45 
 
 		 377 aa  47.4  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.343112  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2456  Radical SAM domain protein  24.5 
 
 		 337 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2070  Radical SAM domain protein  26.06 
 
 		 593 aa  47.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  24.83 
 
 		 337 aa  46.6  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 		 339 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2761  radical SAM domain-containing protein  31.61 
 
 		 348 aa  46.2  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0874334  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1215  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 331 aa  45.8  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1953  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  24.81 
 
 		 245 aa  46.2  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1728  hypothetical protein  22.08 
 
 		 336 aa  45.8  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.241184  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1240  radical SAM domain-containing protein  26.03 
 
 		 331 aa  44.7  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0540  radical SAM domain-containing protein  24.14 
 
 		 326 aa  44.7  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2016  Radical SAM domain protein  28.1 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0248343  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  33.93 
 
 		 282 aa  44.7  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1318  glycyl-radical activating family protein  29.82 
 
 		 299 aa  44.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0352967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  30.13 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  21.05 
 
 		 333 aa  45.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0692  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  27.27 
 
 		 293 aa  45.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.104164  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0917  Radical SAM domain protein  23.94 
 
 		 324 aa  44.3  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  24.04 
 
 		 608 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0885  pyruvate formate-lyase 1-activating enzyme  27.93 
 
 		 293 aa  43.9  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  24.63 
 
 		 342 aa  44.3  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3258  glycyl-radical enzyme activating protein family  26.09 
 
 		 303 aa  43.5  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.807185  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2402  radical SAM domain-containing protein  25.57 
 
 		 297 aa  43.5  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  27.88 
 
 		 427 aa  43.5  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1580  Radical SAM domain protein  30.19 
 
 		 429 aa  43.5  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4886  pyruvate formate lyase activating enzyme  27.55 
 
 		 287 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0614153  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4819  pyruvate formate lyase activating enzyme  27 
 
 		 287 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4921  pyruvate formate lyase activating enzyme  27.55 
 
 		 287 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 344 aa  42.7  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01544  pyruvate formate-lyase 1 activating enzyme  24.81 
 
 		 215 aa  43.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2362  Radical SAM domain protein  25.7 
 
 		 512 aa  43.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0354  radical SAM domain-containing protein  21.51 
 
 		 337 aa  42.7  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.898506 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1712  Radical SAM domain protein  22.6 
 
 		 351 aa  42.4  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2999  radical SAM family protein  27.93 
 
 		 265 aa  42.7  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1722  pyruvate formate-lyase activating enzyme  28 
 
 		 293 aa  42.4  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.461343  normal  0.162758 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16340  pyruvate formate-lyase 1-activating enzyme  26.79 
 
 		 287 aa  42.4  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.243728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2000  radical SAM family protein  23.81 
 
 		 565 aa  42  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.345237  normal  0.435892 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0886  radical SAM domain-containing protein  22.59 
 
 		 441 aa  42  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73593  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1170  pyruvate formate-lyase activating enzyme  26.06 
 
 		 235 aa  42  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.763287  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1460  radical SAM domain-containing protein  29.81 
 
 		 332 aa  42  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>