56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_955 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_955  radical SAM domain protein  100 
 
 		 273 aa  570  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0966  radical SAM domain-containing protein  93.41 
 
 		 273 aa  541  1e-153  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1137  radical SAM domain-containing protein  92.31 
 
 		 273 aa  532  1e-150  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.558403  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0241  radical SAM domain-containing protein  59.68 
 
 		 256 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_77  radical SAM domain protein  56.93 
 
 		 274 aa  315  4e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0090  radical SAM domain-containing protein  43.91 
 
 		 271 aa  193  3e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0109  radical SAM domain-containing protein  43.04 
 
 		 249 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0280  radical SAM domain-containing protein  43.04 
 
 		 249 aa  176  5e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0089  radical SAM domain-containing protein  40.51 
 
 		 283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.110563  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_100  radical SAM domain protein  41.99 
 
 		 249 aa  169  6e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1337  radical SAM domain protein  41.56 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_75  radical SAM domain protein  35.08 
 
 		 246 aa  162  7e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_79  radical SAM domain protein  34.13 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0243  radical SAM domain-containing protein  34.68 
 
 		 246 aa  159  4e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0453811  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0595  radical SAM domain-containing protein  37.45 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0622  radical SAM domain-containing protein  37.45 
 
 		 249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165455  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_563  radical SAM domain protein  37.02 
 
 		 249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0239  radical SAM domain-containing protein  32.75 
 
 		 223 aa  135  8e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1463  radical SAM domain-containing protein  28.81 
 
 		 266 aa  92  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0519  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.149546  normal  0.440492 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0297  radical SAM domain-containing protein  30.66 
 
 		 363 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1722  radical SAM domain-containing protein  38.1 
 
 		 371 aa  53.9  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1254  radical SAM domain-containing protein  34.09 
 
 		 384 aa  53.9  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2837  pyruvate formate-lyase activating enzyme  28.79 
 
 		 255 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.128251 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1903  radical SAM domain-containing protein  27.56 
 
 		 364 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.378187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1671  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  28.26 
 
 		 246 aa  50.4  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0803873  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1430  radical SAM domain-containing protein  29.2 
 
 		 302 aa  50.4  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.698676  hitchhiker  0.00476012 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1357  pyruvate formate-lyase activating enzyme  22.32 
 
 		 235 aa  49.7  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1170  pyruvate formate-lyase activating enzyme  22.32 
 
 		 235 aa  49.7  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.763287  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0403  Radical SAM domain protein  28 
 
 		 351 aa  49.3  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00459412  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0355  Radical SAM domain protein  34.15 
 
 		 365 aa  48.5  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003978  pyruvate formate-lyase activating enzyme  24.4 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  24.58 
 
 		 329 aa  47.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  24.58 
 
 		 329 aa  47.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1460  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  25.6 
 
 		 246 aa  47.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1533  radical SAM domain-containing protein  25.53 
 
 		 355 aa  46.6  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000125557  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1582  radical SAM domain-containing protein  25.53 
 
 		 355 aa  46.6  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0102098  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1953  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  24.4 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1490  radical SAM domain-containing protein  29.7 
 
 		 377 aa  46.2  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.343112  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4819  pyruvate formate lyase activating enzyme  23.53 
 
 		 287 aa  45.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0511  hypothetical protein  24.04 
 
 		 590 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01544  pyruvate formate-lyase 1 activating enzyme  26.87 
 
 		 215 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  23.85 
 
 		 468 aa  44.3  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1396  glycerol dehydratase activating enzyme  26.24 
 
 		 322 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.214688  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1707  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  23.78 
 
 		 246 aa  43.9  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0231805 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  30.69 
 
 		 347 aa  43.9  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2884  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  21.82 
 
 		 246 aa  43.5  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00506631  hitchhiker  0.00000444162 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1947  radical SAM domain-containing protein  23.94 
 
 		 372 aa  43.5  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0917  Radical SAM domain protein  23.65 
 
 		 324 aa  43.5  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1484  radical SAM domain-containing protein  21.46 
 
 		 603 aa  43.5  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4973  pyruvate formate lyase activating enzyme  23.55 
 
 		 287 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.577557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1497  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  23.92 
 
 		 246 aa  42.7  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3308  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  25.17 
 
 		 246 aa  42.7  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.760643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0802  radical SAM family Fe-S protein  27.34 
 
 		 561 aa  42.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  23.27 
 
 		 339 aa  42.4  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2391  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  25 
 
 		 246 aa  42  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227753  normal  0.208715 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>