185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1484 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1484  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 603 aa  1236    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2049  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  45.53 
 
 		 595 aa  531  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000650281  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1593  radical SAM domain-containing protein  42.93 
 
 		 587 aa  524  1e-147  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.170926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0498  radical SAM family Fe-S protein  40.59 
 
 		 580 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0158  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  43.03 
 
 		 589 aa  485  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0026  radical SAM domain-containing protein  43.45 
 
 		 578 aa  475  1e-132  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1597  Radical SAM domain protein  43.29 
 
 		 589 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1469  radical SAM domain-containing protein  40.88 
 
 		 609 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.447014  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1689  hypothetical protein  39.49 
 
 		 592 aa  449  1e-125  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2070  Radical SAM domain protein  37.16 
 
 		 593 aa  428  1e-118  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2363  radical SAM domain-containing protein  39.33 
 
 		 566 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.607234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0511  hypothetical protein  35.57 
 
 		 590 aa  388  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1997  radical SAM family protein  35.93 
 
 		 585 aa  385  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2000  radical SAM family protein  36.94 
 
 		 565 aa  360  3e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.345237  normal  0.435892 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2282  hypothetical protein  32.88 
 
 		 633 aa  356  7.999999999999999e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00815982  normal  0.295963 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  33.66 
 
 		 353 aa  152  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1474  radical SAM domain-containing protein  32.42 
 
 		 335 aa  152  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0922  radical SAM domain-containing protein  34.67 
 
 		 333 aa  147  6e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  28.83 
 
 		 333 aa  144  4e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2551  pyruvate formate-lyase activating enzyme-like protein  29.07 
 
 		 354 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592966  normal  0.73651 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1524  radical SAM domain-containing protein  33.11 
 
 		 337 aa  137  5e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1625  radical SAM domain-containing protein  31.15 
 
 		 363 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1052  radical SAM family protein  31.99 
 
 		 335 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1150  DNA mismatch repair protein  29.14 
 
 		 338 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.926871 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1648  radical SAM domain-containing protein  30.92 
 
 		 363 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  29.37 
 
 		 344 aa  135  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0542  radical SAM domain-containing protein  29.7 
 
 		 384 aa  135  3e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0194035 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2294  radical SAM family protein  29.9 
 
 		 332 aa  134  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0779  radical SAM domain-containing protein  31.31 
 
 		 336 aa  134  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1064  radical SAM domain-containing protein  30.82 
 
 		 364 aa  133  6.999999999999999e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  31.7 
 
 		 362 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  30.46 
 
 		 342 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1815  radical SAM domain-containing protein  30.82 
 
 		 364 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0629  Radical SAM domain protein  30.12 
 
 		 343 aa  132  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000217214  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0338  radical SAM domain-containing protein  31.86 
 
 		 348 aa  131  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4120  radical SAM domain-containing protein  28.35 
 
 		 372 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.424935 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0917  Radical SAM domain protein  30.38 
 
 		 324 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1034  radical SAM domain-containing protein  27.95 
 
 		 337 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0759  radical SAM domain-containing protein  29.84 
 
 		 336 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1712  Radical SAM domain protein  27.38 
 
 		 351 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  30.2 
 
 		 337 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  31.48 
 
 		 342 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2136  Radical SAM domain protein  29.29 
 
 		 356 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.219183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1017  Radical SAM domain protein  30.41 
 
 		 335 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.677632  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  32.67 
 
 		 339 aa  128  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0761  Radical SAM domain protein  29.55 
 
 		 340 aa  127  5e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00535967  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1215  radical SAM domain-containing protein  27.41 
 
 		 331 aa  127  6e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1240  radical SAM domain-containing protein  27.41 
 
 		 331 aa  127  6e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1006  radical SAM family protein  29.39 
 
 		 336 aa  127  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0904  Radical SAM domain protein  27.02 
 
 		 395 aa  126  9e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0776722 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2854  radical SAM domain-containing protein  30.84 
 
 		 337 aa  126  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2456  Radical SAM domain protein  29.87 
 
 		 337 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0325  Radical SAM domain protein  27.87 
 
 		 333 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2948  radical SAM family Fe-S protein  29.94 
 
 		 347 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0217  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 		 356 aa  125  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0348  radical SAM domain-containing protein  28.3 
 
 		 336 aa  125  3e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.224287  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2431  radical SAM domain-containing protein  29.9 
 
 		 396 aa  125  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  26.85 
 
 		 339 aa  125  3e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1999  radical SAM domain-containing protein  27.46 
 
 		 351 aa  124  5e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.156539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1460  radical SAM domain-containing protein  28.33 
 
 		 332 aa  124  6e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1670  radical SAM domain-containing protein  30.35 
 
 		 362 aa  124  7e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0537367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0540  radical SAM domain-containing protein  26.35 
 
 		 326 aa  124  7e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0103  Radical SAM domain protein  31.58 
 
 		 356 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2213  radical SAM domain-containing protein  30.09 
 
 		 367 aa  123  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  25.84 
 
 		 329 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  25.84 
 
 		 329 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1063  radical SAM domain-containing protein  28.3 
 
 		 336 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.665632  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1123  radical SAM domain-containing protein  28.75 
 
 		 345 aa  122  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0464  Radical SAM domain protein  29.13 
 
 		 348 aa  122  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.521225  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2430  radical SAM domain-containing protein  29.71 
 
 		 365 aa  121  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0451112 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0086  radical SAM family protein  29.28 
 
 		 356 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.508004  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0093  Radical SAM domain protein  29.9 
 
 		 356 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1963  Radical SAM domain protein  28.12 
 
 		 334 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0105086  decreased coverage  0.00565461 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0219  Radical SAM domain protein  29.73 
 
 		 337 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0211251  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0022  radical SAM domain-containing protein  28.66 
 
 		 360 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2555  Radical SAM domain protein  28.9 
 
 		 366 aa  120  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466932  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1095  radical SAM domain protein  30.1 
 
 		 345 aa  120  7e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0354  radical SAM domain-containing protein  30.43 
 
 		 337 aa  120  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.898506 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1563  radical SAM domain-containing protein  28.1 
 
 		 336 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.356418 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0044  Radical SAM domain protein  29.7 
 
 		 343 aa  118  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2243  Radical SAM domain protein  30.52 
 
 		 337 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1314  radical SAM domain-containing protein  29.17 
 
 		 345 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1849  radical SAM family protein  27.06 
 
 		 329 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0539  radical SAM domain-containing protein  26.58 
 
 		 376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00688869  normal  0.395603 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1055  radical SAM domain-containing protein  28.2 
 
 		 335 aa  114  7.000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.146783  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0239  Radical SAM domain protein  26.4 
 
 		 358 aa  113  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1995  radical SAM domain-containing protein  27.95 
 
 		 405 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0200  Radical SAM domain protein  29.43 
 
 		 386 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1585  hypothetical protein  26.67 
 
 		 364 aa  112  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1728  hypothetical protein  28.09 
 
 		 336 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.241184  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1470  radical SAM domain-containing protein  28.04 
 
 		 342 aa  110  6e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.808287  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0858  radical SAM domain-containing protein  28.76 
 
 		 338 aa  110  8.000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.844085 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0396  radical SAM family protein  27.48 
 
 		 358 aa  109  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0270  radical SAM domain-containing protein  29.96 
 
 		 286 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1698  radical SAM domain-containing protein  27.04 
 
 		 337 aa  108  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2293  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  25.25 
 
 		 336 aa  107  7e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.388191  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  26.28 
 
 		 282 aa  107  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  24.07 
 
 		 333 aa  106  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6076  radical SAM family protein  27.81 
 
 		 363 aa  106  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1841  Radical SAM domain protein  28.05 
 
 		 340 aa  105  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>