169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0297 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0297  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 363 aa  734    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1903  radical SAM domain-containing protein  82.97 
 
 		 364 aa  611  9.999999999999999e-175  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.378187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1430  radical SAM domain-containing protein  84.93 
 
 		 302 aa  518  1e-146  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.698676  hitchhiker  0.00476012 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1254  radical SAM domain-containing protein  54.47 
 
 		 384 aa  394  1e-108  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1490  radical SAM domain-containing protein  46.59 
 
 		 377 aa  340  2e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.343112  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0403  Radical SAM domain protein  42.03 
 
 		 351 aa  301  2e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00459412  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0355  Radical SAM domain protein  43.65 
 
 		 365 aa  294  1e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1722  radical SAM domain-containing protein  43.72 
 
 		 371 aa  294  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4016  radical SAM domain-containing protein  45.54 
 
 		 379 aa  293  4e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.643398  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1582  radical SAM domain-containing protein  40.48 
 
 		 355 aa  269  5e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0102098  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1533  radical SAM domain-containing protein  40.48 
 
 		 355 aa  269  5e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000125557  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5878  Radical SAM domain protein  28.53 
 
 		 362 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0206709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2551  pyruvate formate-lyase activating enzyme-like protein  27.3 
 
 		 354 aa  98.6  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592966  normal  0.73651 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2539  Radical SAM domain protein  29.32 
 
 		 360 aa  98.2  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0088  radical SAM domain-containing protein  29.91 
 
 		 357 aa  97.1  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.400989  normal  0.227798 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2684  Radical SAM domain protein  28.8 
 
 		 367 aa  96.7  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307935  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  25.79 
 
 		 339 aa  96.7  6e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0338  radical SAM domain-containing protein  28.8 
 
 		 348 aa  94  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0354  radical SAM domain-containing protein  25.74 
 
 		 337 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.898506 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0093  Radical SAM domain protein  29.71 
 
 		 356 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  24.92 
 
 		 333 aa  90.9  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1969  radical SAM family protein  27.76 
 
 		 370 aa  90.5  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.327469 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3292  Radical SAM domain protein  27.69 
 
 		 366 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0103  Radical SAM domain protein  29.55 
 
 		 356 aa  90.1  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0086  radical SAM family protein  29.71 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.508004  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2948  radical SAM family Fe-S protein  27.24 
 
 		 347 aa  89  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0761  Radical SAM domain protein  25.57 
 
 		 340 aa  89.4  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00535967  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  24.75 
 
 		 282 aa  88.2  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0932  radical SAM domain-containing protein  27.6 
 
 		 362 aa  87.8  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1325  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 365 aa  87.4  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.322233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1995  radical SAM domain-containing protein  28.26 
 
 		 405 aa  86.7  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0893  radical SAM domain-containing protein  26.71 
 
 		 361 aa  85.9  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.910266 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1849  radical SAM family protein  25.16 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0728  Radical SAM domain protein  26.9 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000489129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0574  radical SAM domain protein  26.9 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2430  radical SAM domain-containing protein  27.97 
 
 		 365 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0451112 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1585  hypothetical protein  26.92 
 
 		 364 aa  84.3  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0759  radical SAM domain-containing protein  26.06 
 
 		 336 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0396  radical SAM family protein  26.98 
 
 		 358 aa  84  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1524  radical SAM domain-containing protein  24.84 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1034  radical SAM domain-containing protein  23.93 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0629  Radical SAM domain protein  26.03 
 
 		 343 aa  82.8  0.000000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000217214  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  25.57 
 
 		 353 aa  82  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1150  DNA mismatch repair protein  26.4 
 
 		 338 aa  81.6  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.926871 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1005  radical SAM domain-containing protein  26.95 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1172  hypothetical protein  24.1 
 
 		 358 aa  81.3  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0904  Radical SAM domain protein  23.72 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0776722 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2213  radical SAM domain-containing protein  27.33 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  24.52 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6305  Radical SAM domain-containing protein  26.38 
 
 		 388 aa  80.1  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1052  radical SAM family protein  24.43 
 
 		 335 aa  80.1  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  23.84 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  23.84 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1841  Radical SAM domain protein  27.51 
 
 		 340 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1712  Radical SAM domain protein  25.72 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6076  radical SAM family protein  27.27 
 
 		 363 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  26.28 
 
 		 333 aa  79.3  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1058  radical SAM domain-containing protein  26.8 
 
 		 382 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0898  radical SAM domain-containing protein  28.01 
 
 		 369 aa  79  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1178  hypothetical protein  23.86 
 
 		 358 aa  78.2  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2555  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 366 aa  78.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466932  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1215  radical SAM domain-containing protein  25.08 
 
 		 331 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0270  radical SAM domain-containing protein  25.32 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1240  radical SAM domain-containing protein  25.08 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2243  Radical SAM domain protein  25.72 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0539  radical SAM domain-containing protein  26.1 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00688869  normal  0.395603 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0073  pyruvate formate lyase-activating enzyme, putative  25.4 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0449  radical SAM family protein  27.39 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355453  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2402  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1870  radical SAM domain-containing protein  27.6 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1815  radical SAM domain-containing protein  25.08 
 
 		 364 aa  74.7  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  24.46 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2217  Radical SAM domain protein  26.9 
 
 		 374 aa  73.9  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1625  radical SAM domain-containing protein  25.82 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1999  radical SAM domain-containing protein  25.56 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.156539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0219  Radical SAM domain protein  24.92 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0211251  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0922  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1963  Radical SAM domain protein  25.32 
 
 		 334 aa  72.4  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0105086  decreased coverage  0.00565461 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1055  radical SAM domain-containing protein  25.89 
 
 		 335 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.146783  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2136  Radical SAM domain protein  24.03 
 
 		 356 aa  72  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.219183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1497  radical SAM domain-containing protein  25.99 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.398952  normal  0.0425103 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  24.7 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0463  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.838883  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0542  radical SAM domain-containing protein  26.98 
 
 		 384 aa  69.7  0.00000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0194035 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1670  radical SAM domain-containing protein  27.46 
 
 		 362 aa  69.7  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0537367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0325  Radical SAM domain protein  25.41 
 
 		 333 aa  69.3  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4120  radical SAM domain-containing protein  24.11 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.424935 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1648  radical SAM domain-containing protein  25.25 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1095  radical SAM domain protein  22.83 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  24.31 
 
 		 339 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0858  radical SAM domain-containing protein  26.05 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.844085 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13159  pyruvate formate lyase activating protein pflA  26.47 
 
 		 362 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1017  Radical SAM domain protein  24.43 
 
 		 335 aa  67  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.677632  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  23.93 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1542  pyruvate formate-lyase activating enzyme  30.7 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00863407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0022  radical SAM domain-containing protein  24.55 
 
 		 360 aa  65.5  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  25.25 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1123  radical SAM domain-containing protein  21.86 
 
 		 345 aa  64.7  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0044  Radical SAM domain protein  22.98 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0217  radical SAM domain-containing protein  24.12 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>