73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0280 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0280  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 249 aa  512  1e-144  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0109  radical SAM domain-containing protein  99.6 
 
 		 249 aa  509  1e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_100  radical SAM domain protein  83.53 
 
 		 249 aa  434  1e-121  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1337  radical SAM domain protein  83.13 
 
 		 249 aa  434  1e-121  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0595  radical SAM domain-containing protein  52.4 
 
 		 249 aa  272  3e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0622  radical SAM domain-containing protein  52.4 
 
 		 249 aa  270  2e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165455  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_563  radical SAM domain protein  52 
 
 		 249 aa  267  1e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_75  radical SAM domain protein  40.73 
 
 		 246 aa  197  9e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0243  radical SAM domain-containing protein  39.92 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0453811  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1137  radical SAM domain-containing protein  43.29 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.558403  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_955  radical SAM domain protein  43.04 
 
 		 273 aa  176  4e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0966  radical SAM domain-containing protein  42.49 
 
 		 273 aa  175  5e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0090  radical SAM domain-containing protein  40.42 
 
 		 271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0241  radical SAM domain-containing protein  42.86 
 
 		 256 aa  171  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_77  radical SAM domain protein  43.29 
 
 		 274 aa  170  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0089  radical SAM domain-containing protein  37.66 
 
 		 283 aa  159  4e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.110563  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_79  radical SAM domain protein  36.09 
 
 		 248 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0239  radical SAM domain-containing protein  36.71 
 
 		 223 aa  137  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0519  radical SAM domain-containing protein  34.41 
 
 		 266 aa  107  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.149546  normal  0.440492 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1463  radical SAM domain-containing protein  34.45 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0403  Radical SAM domain protein  27.23 
 
 		 351 aa  57  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00459412  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0761  Radical SAM domain protein  23.74 
 
 		 340 aa  54.7  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00535967  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1006  radical SAM family protein  25.37 
 
 		 336 aa  53.5  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1469  radical SAM domain-containing protein  26.18 
 
 		 609 aa  53.1  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.447014  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0779  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 336 aa  52  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  27.06 
 
 		 329 aa  50.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4120  radical SAM domain-containing protein  22.86 
 
 		 372 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.424935 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  27.06 
 
 		 329 aa  50.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1254  radical SAM domain-containing protein  31.11 
 
 		 384 aa  50.8  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0629  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 343 aa  50.4  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000217214  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1722  radical SAM domain-containing protein  33.73 
 
 		 371 aa  50.1  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1670  radical SAM domain-containing protein  24.49 
 
 		 362 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0537367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1874  radical SAM domain-containing protein  28.05 
 
 		 241 aa  49.3  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1841  Radical SAM domain protein  25.88 
 
 		 340 aa  48.9  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0355  Radical SAM domain protein  33.73 
 
 		 365 aa  48.5  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1953  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  26.32 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1490  radical SAM domain-containing protein  26.45 
 
 		 377 aa  48.1  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.343112  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2456  Radical SAM domain protein  25.83 
 
 		 337 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2070  Radical SAM domain protein  26.06 
 
 		 593 aa  47.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1524  radical SAM domain-containing protein  25.68 
 
 		 337 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1215  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 331 aa  46.6  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 		 339 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  24.83 
 
 		 337 aa  46.2  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2016  Radical SAM domain protein  28.1 
 
 		 315 aa  46.2  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0248343  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1728  hypothetical protein  22.12 
 
 		 336 aa  45.8  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.241184  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  25.34 
 
 		 342 aa  45.8  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1240  radical SAM domain-containing protein  26.03 
 
 		 331 aa  45.4  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  30.13 
 
 		 294 aa  45.4  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0917  Radical SAM domain protein  23.94 
 
 		 324 aa  45.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2761  radical SAM domain-containing protein  30.97 
 
 		 348 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0874334  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1318  glycyl-radical activating family protein  29.82 
 
 		 299 aa  45.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0352967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  28.48 
 
 		 427 aa  44.7  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01544  pyruvate formate-lyase 1 activating enzyme  24.81 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  20.47 
 
 		 333 aa  44.3  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2402  radical SAM domain-containing protein  25.57 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  24.04 
 
 		 608 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3258  glycyl-radical enzyme activating protein family  26.09 
 
 		 303 aa  44.3  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.807185  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  33.93 
 
 		 282 aa  43.9  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1580  Radical SAM domain protein  30.19 
 
 		 429 aa  43.5  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4886  pyruvate formate lyase activating enzyme  29.13 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0614153  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4921  pyruvate formate lyase activating enzyme  27.45 
 
 		 287 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0540  radical SAM domain-containing protein  24.14 
 
 		 326 aa  43.9  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4819  pyruvate formate lyase activating enzyme  26.92 
 
 		 287 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  24.26 
 
 		 342 aa  43.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 344 aa  43.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2362  Radical SAM domain protein  25.7 
 
 		 512 aa  42.7  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1460  radical SAM domain-containing protein  29.81 
 
 		 332 aa  42.7  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0886  radical SAM domain-containing protein  22.59 
 
 		 441 aa  42.7  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73593  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0354  radical SAM domain-containing protein  23.31 
 
 		 337 aa  42.4  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.898506 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1170  pyruvate formate-lyase activating enzyme  25.34 
 
 		 235 aa  42.4  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.763287  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4973  pyruvate formate lyase activating enzyme  26.47 
 
 		 287 aa  42.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.577557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0692  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  26.36 
 
 		 293 aa  42  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.104164  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2000  radical SAM family protein  23.81 
 
 		 565 aa  42  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.345237  normal  0.435892 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>