144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2000 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2000  radical SAM family protein  100 
 
 		 565 aa  1174    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.345237  normal  0.435892 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0026  radical SAM domain-containing protein  36.93 
 
 		 578 aa  395  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1593  radical SAM domain-containing protein  36.33 
 
 		 587 aa  395  1e-108  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.170926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1689  hypothetical protein  37.25 
 
 		 592 aa  391  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2049  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  36.8 
 
 		 595 aa  385  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000650281  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1597  Radical SAM domain protein  35.75 
 
 		 589 aa  370  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2363  radical SAM domain-containing protein  35.46 
 
 		 566 aa  368  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.607234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2070  Radical SAM domain protein  33.86 
 
 		 593 aa  365  2e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1484  radical SAM domain-containing protein  36.94 
 
 		 603 aa  360  3e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0498  radical SAM family Fe-S protein  34.21 
 
 		 580 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1469  radical SAM domain-containing protein  34.33 
 
 		 609 aa  352  8.999999999999999e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.447014  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0158  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  33.57 
 
 		 589 aa  343  4e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0511  hypothetical protein  32.43 
 
 		 590 aa  325  2e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1997  radical SAM family protein  32.55 
 
 		 585 aa  313  5.999999999999999e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2282  hypothetical protein  29.26 
 
 		 633 aa  290  4e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00815982  normal  0.295963 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1474  radical SAM domain-containing protein  31.8 
 
 		 335 aa  163  6e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0540  radical SAM domain-containing protein  28.21 
 
 		 326 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0219  Radical SAM domain protein  31.52 
 
 		 337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0211251  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  26.06 
 
 		 329 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1648  radical SAM domain-containing protein  26.76 
 
 		 363 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  26.06 
 
 		 329 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1625  radical SAM domain-containing protein  27.35 
 
 		 363 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1815  radical SAM domain-containing protein  25.88 
 
 		 364 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  29.74 
 
 		 333 aa  131  4.0000000000000003e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0917  Radical SAM domain protein  28.3 
 
 		 324 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1524  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 		 337 aa  127  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1460  radical SAM domain-containing protein  31.46 
 
 		 332 aa  127  6e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0858  radical SAM domain-containing protein  27.55 
 
 		 338 aa  125  2e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.844085 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  27.88 
 
 		 344 aa  125  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  28.01 
 
 		 362 aa  125  3e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  29.81 
 
 		 333 aa  125  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0761  Radical SAM domain protein  26.89 
 
 		 340 aa  124  4e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00535967  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1215  radical SAM domain-containing protein  27.52 
 
 		 331 aa  124  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0542  radical SAM domain-containing protein  26.02 
 
 		 384 aa  124  6e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0194035 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1240  radical SAM domain-containing protein  27.52 
 
 		 331 aa  124  6e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2294  radical SAM family protein  28.66 
 
 		 332 aa  123  8e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1712  Radical SAM domain protein  26.02 
 
 		 351 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1841  Radical SAM domain protein  30.09 
 
 		 340 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1999  radical SAM domain-containing protein  26.24 
 
 		 351 aa  119  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.156539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0325  Radical SAM domain protein  28.83 
 
 		 333 aa  118  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0044  Radical SAM domain protein  30.54 
 
 		 343 aa  117  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0904  Radical SAM domain protein  30.1 
 
 		 395 aa  117  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0776722 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2293  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  29.94 
 
 		 336 aa  117  6.9999999999999995e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.388191  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  26.97 
 
 		 337 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2136  Radical SAM domain protein  27.79 
 
 		 356 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.219183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0338  radical SAM domain-containing protein  29.19 
 
 		 348 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2551  pyruvate formate-lyase activating enzyme-like protein  24.39 
 
 		 354 aa  114  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592966  normal  0.73651 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0354  radical SAM domain-containing protein  29.43 
 
 		 337 aa  113  7.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.898506 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0022  radical SAM domain-containing protein  25.86 
 
 		 360 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1497  radical SAM domain-containing protein  28.9 
 
 		 365 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.398952  normal  0.0425103 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1064  radical SAM domain-containing protein  26.61 
 
 		 364 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0539  radical SAM domain-containing protein  25.22 
 
 		 376 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00688869  normal  0.395603 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0217  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 		 356 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0239  Radical SAM domain protein  26.82 
 
 		 358 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0922  radical SAM domain-containing protein  27.66 
 
 		 333 aa  111  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1670  radical SAM domain-containing protein  29.94 
 
 		 362 aa  112  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0537367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0629  Radical SAM domain protein  26.25 
 
 		 343 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000217214  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  28.79 
 
 		 342 aa  110  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2456  Radical SAM domain protein  26.06 
 
 		 337 aa  110  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1963  Radical SAM domain protein  27.58 
 
 		 334 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0105086  decreased coverage  0.00565461 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2243  Radical SAM domain protein  27.42 
 
 		 337 aa  110  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1123  radical SAM domain-containing protein  26.52 
 
 		 345 aa  108  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  26.42 
 
 		 339 aa  107  5e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  29.61 
 
 		 339 aa  107  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1017  Radical SAM domain protein  26.73 
 
 		 335 aa  107  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.677632  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2854  radical SAM domain-containing protein  27.52 
 
 		 337 aa  106  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0464  Radical SAM domain protein  26.69 
 
 		 348 aa  106  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.521225  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0898  radical SAM domain-containing protein  26.42 
 
 		 369 aa  106  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  28.27 
 
 		 282 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1314  radical SAM domain-containing protein  26.07 
 
 		 345 aa  105  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1585  hypothetical protein  26.25 
 
 		 364 aa  105  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2948  radical SAM family Fe-S protein  28.03 
 
 		 347 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1034  radical SAM domain-containing protein  26.63 
 
 		 337 aa  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1006  radical SAM family protein  27.76 
 
 		 336 aa  104  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1728  hypothetical protein  28.43 
 
 		 336 aa  103  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.241184  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1995  radical SAM domain-containing protein  28.09 
 
 		 405 aa  103  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  24.92 
 
 		 353 aa  103  8e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1172  hypothetical protein  26.67 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0396  radical SAM family protein  24.86 
 
 		 358 aa  103  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1095  radical SAM domain protein  25.53 
 
 		 345 aa  103  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6076  radical SAM family protein  27.81 
 
 		 363 aa  102  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0759  radical SAM domain-containing protein  26.42 
 
 		 336 aa  102  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2539  Radical SAM domain protein  26.91 
 
 		 360 aa  102  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1052  radical SAM family protein  27 
 
 		 335 aa  102  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1150  DNA mismatch repair protein  26.51 
 
 		 338 aa  101  3e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.926871 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2431  radical SAM domain-containing protein  26.59 
 
 		 396 aa  102  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2555  Radical SAM domain protein  27.04 
 
 		 366 aa  101  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466932  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1694  Radical SAM domain protein  29.2 
 
 		 280 aa  100  6e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.953973 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0779  radical SAM domain-containing protein  27.95 
 
 		 336 aa  100  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2430  radical SAM domain-containing protein  26.35 
 
 		 365 aa  99.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0451112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2213  radical SAM domain-containing protein  26.33 
 
 		 367 aa  99.8  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1178  hypothetical protein  26 
 
 		 358 aa  99  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0093  Radical SAM domain protein  25.85 
 
 		 356 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0086  radical SAM family protein  26.15 
 
 		 356 aa  99.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.508004  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2865  radical SAM domain-containing protein  27.58 
 
 		 331 aa  99  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1870  radical SAM domain-containing protein  27 
 
 		 374 aa  98.2  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0932  radical SAM domain-containing protein  27.19 
 
 		 362 aa  97.8  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  25.15 
 
 		 342 aa  97.4  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0348  radical SAM domain-containing protein  26.05 
 
 		 336 aa  97.1  7e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.224287  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2217  Radical SAM domain protein  26.29 
 
 		 374 aa  96.7  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>