201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1597 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1597  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 589 aa  1220    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0498  radical SAM family Fe-S protein  49.39 
 
 		 580 aa  625  1e-178  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1593  radical SAM domain-containing protein  49.4 
 
 		 587 aa  608  1e-173  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.170926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0026  radical SAM domain-containing protein  50.17 
 
 		 578 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1997  radical SAM family protein  45.39 
 
 		 585 aa  560  1e-158  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0511  hypothetical protein  44.85 
 
 		 590 aa  550  1e-155  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2049  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  43.82 
 
 		 595 aa  520  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000650281  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1469  radical SAM domain-containing protein  44.88 
 
 		 609 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.447014  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1689  hypothetical protein  43.95 
 
 		 592 aa  514  1e-144  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2282  hypothetical protein  42.2 
 
 		 633 aa  509  1e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00815982  normal  0.295963 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2070  Radical SAM domain protein  44.01 
 
 		 593 aa  509  1e-143  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0158  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  44.14 
 
 		 589 aa  504  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1484  radical SAM domain-containing protein  43.29 
 
 		 603 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2363  radical SAM domain-containing protein  41.39 
 
 		 566 aa  459  9.999999999999999e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.607234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2000  radical SAM family protein  35.75 
 
 		 565 aa  370  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.345237  normal  0.435892 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1474  radical SAM domain-containing protein  34.88 
 
 		 335 aa  163  6e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  29.91 
 
 		 329 aa  163  7e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  29.91 
 
 		 329 aa  163  7e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0219  Radical SAM domain protein  31.6 
 
 		 337 aa  150  5e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0211251  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  28.66 
 
 		 333 aa  145  3e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1712  Radical SAM domain protein  29.25 
 
 		 351 aa  144  4e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0325  Radical SAM domain protein  29.97 
 
 		 333 aa  144  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1999  radical SAM domain-containing protein  30.09 
 
 		 351 aa  140  8.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.156539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0917  Radical SAM domain protein  29.93 
 
 		 324 aa  139  2e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1524  radical SAM domain-containing protein  30.51 
 
 		 337 aa  137  8e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2551  pyruvate formate-lyase activating enzyme-like protein  28.05 
 
 		 354 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592966  normal  0.73651 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1240  radical SAM domain-containing protein  28.66 
 
 		 331 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2294  radical SAM family protein  32.43 
 
 		 332 aa  134  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1215  radical SAM domain-containing protein  28.35 
 
 		 331 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0540  radical SAM domain-containing protein  27.9 
 
 		 326 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  29.15 
 
 		 344 aa  130  9.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  28.62 
 
 		 362 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1815  radical SAM domain-containing protein  28.48 
 
 		 364 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  27.61 
 
 		 353 aa  128  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1625  radical SAM domain-containing protein  28.83 
 
 		 363 aa  128  3e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1648  radical SAM domain-containing protein  29.43 
 
 		 363 aa  128  3e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0629  Radical SAM domain protein  28.97 
 
 		 343 aa  128  3e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000217214  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0464  Radical SAM domain protein  27.96 
 
 		 348 aa  127  5e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.521225  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1460  radical SAM domain-containing protein  28.97 
 
 		 332 aa  127  7e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0542  radical SAM domain-containing protein  27.96 
 
 		 384 aa  126  9e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0194035 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1963  Radical SAM domain protein  29.69 
 
 		 334 aa  126  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0105086  decreased coverage  0.00565461 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0338  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 		 348 aa  125  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1123  radical SAM domain-containing protein  29.67 
 
 		 345 aa  125  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1034  radical SAM domain-containing protein  29.25 
 
 		 337 aa  124  4e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  27.44 
 
 		 342 aa  124  7e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1314  radical SAM domain-containing protein  28.52 
 
 		 345 aa  123  8e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0759  radical SAM domain-containing protein  29.63 
 
 		 336 aa  123  8e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0922  radical SAM domain-containing protein  29.49 
 
 		 333 aa  121  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1095  radical SAM domain protein  28.86 
 
 		 345 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1017  Radical SAM domain protein  28.52 
 
 		 335 aa  120  7e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.677632  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  28.73 
 
 		 282 aa  120  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0761  Radical SAM domain protein  28.81 
 
 		 340 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00535967  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  28.81 
 
 		 333 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1150  DNA mismatch repair protein  29.29 
 
 		 338 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.926871 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1064  radical SAM domain-containing protein  28.62 
 
 		 364 aa  119  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  28.71 
 
 		 337 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2293  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  29.14 
 
 		 336 aa  116  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.388191  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0022  radical SAM domain-containing protein  26.71 
 
 		 360 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0044  Radical SAM domain protein  28.86 
 
 		 343 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2402  radical SAM domain-containing protein  28.47 
 
 		 297 aa  115  3e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0858  radical SAM domain-containing protein  27.61 
 
 		 338 aa  115  3e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.844085 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0270  radical SAM domain-containing protein  30.17 
 
 		 286 aa  115  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2456  Radical SAM domain protein  28.33 
 
 		 337 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0354  radical SAM domain-containing protein  27.76 
 
 		 337 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.898506 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0217  radical SAM domain-containing protein  24.32 
 
 		 356 aa  114  5e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  31.77 
 
 		 339 aa  114  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1052  radical SAM family protein  29.61 
 
 		 335 aa  114  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2854  radical SAM domain-containing protein  27.39 
 
 		 337 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0539  radical SAM domain-containing protein  28.28 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00688869  normal  0.395603 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1670  radical SAM domain-containing protein  29.28 
 
 		 362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0537367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1006  radical SAM family protein  27.3 
 
 		 336 aa  111  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  26.09 
 
 		 339 aa  112  3e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1995  radical SAM domain-containing protein  26.69 
 
 		 405 aa  111  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1698  radical SAM domain-containing protein  27.95 
 
 		 337 aa  112  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1728  hypothetical protein  27.03 
 
 		 336 aa  111  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.241184  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2431  radical SAM domain-containing protein  27.85 
 
 		 396 aa  109  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0086  radical SAM family protein  27.38 
 
 		 356 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.508004  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0904  Radical SAM domain protein  26.38 
 
 		 395 aa  109  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0776722 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0093  Radical SAM domain protein  27.09 
 
 		 356 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2243  Radical SAM domain protein  28.71 
 
 		 337 aa  108  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0779  radical SAM domain-containing protein  28.86 
 
 		 336 aa  107  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  26.76 
 
 		 342 aa  107  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1470  radical SAM domain-containing protein  27.36 
 
 		 342 aa  107  7e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.808287  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2681  Radical SAM domain protein  26.28 
 
 		 314 aa  107  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480916  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4120  radical SAM domain-containing protein  26.16 
 
 		 372 aa  106  9e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.424935 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0103  Radical SAM domain protein  26.8 
 
 		 356 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1694  Radical SAM domain protein  28.73 
 
 		 280 aa  102  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.953973 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2217  Radical SAM domain protein  27.6 
 
 		 374 aa  103  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1841  Radical SAM domain protein  27.61 
 
 		 340 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1585  hypothetical protein  25.17 
 
 		 364 aa  100  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0348  radical SAM domain-containing protein  27.48 
 
 		 336 aa  100  8e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.224287  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0396  radical SAM family protein  23.91 
 
 		 358 aa  100  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2136  Radical SAM domain protein  25.08 
 
 		 356 aa  100  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.219183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  27.86 
 
 		 294 aa  99.8  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1063  radical SAM domain-containing protein  27.76 
 
 		 336 aa  99.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.665632  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2555  Radical SAM domain protein  26.36 
 
 		 366 aa  99  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466932  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1055  radical SAM domain-containing protein  27.48 
 
 		 335 aa  99  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.146783  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2865  radical SAM domain-containing protein  25.85 
 
 		 331 aa  98.2  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1563  radical SAM domain-containing protein  26.94 
 
 		 336 aa  98.6  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.356418 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0239  Radical SAM domain protein  23.99 
 
 		 358 aa  97.4  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>