165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1997 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1997  radical SAM family protein  100 
 
 		 585 aa  1216    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1597  Radical SAM domain protein  45.39 
 
 		 589 aa  560  1e-158  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0498  radical SAM family Fe-S protein  43.18 
 
 		 580 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0026  radical SAM domain-containing protein  41.74 
 
 		 578 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1593  radical SAM domain-containing protein  42.19 
 
 		 587 aa  504  1e-141  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.170926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0511  hypothetical protein  40.45 
 
 		 590 aa  474  1e-132  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0158  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  39.72 
 
 		 589 aa  456  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1689  hypothetical protein  39.69 
 
 		 592 aa  449  1e-125  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1469  radical SAM domain-containing protein  39.05 
 
 		 609 aa  449  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.447014  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2070  Radical SAM domain protein  38.01 
 
 		 593 aa  427  1e-118  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2049  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  36.52 
 
 		 595 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000650281  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2282  hypothetical protein  36.38 
 
 		 633 aa  412  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00815982  normal  0.295963 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1484  radical SAM domain-containing protein  35.93 
 
 		 603 aa  385  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2363  radical SAM domain-containing protein  35.58 
 
 		 566 aa  378  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.607234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2000  radical SAM family protein  32.55 
 
 		 565 aa  313  5.999999999999999e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.345237  normal  0.435892 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1474  radical SAM domain-containing protein  31.68 
 
 		 335 aa  158  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1215  radical SAM domain-containing protein  27.55 
 
 		 331 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1240  radical SAM domain-containing protein  27.55 
 
 		 331 aa  122  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0917  Radical SAM domain protein  26.42 
 
 		 324 aa  110  6e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1712  Radical SAM domain protein  26.1 
 
 		 351 aa  107  6e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  27.57 
 
 		 344 aa  107  9e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  25.75 
 
 		 362 aa  106  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1314  radical SAM domain-containing protein  25.82 
 
 		 345 aa  103  6e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1995  radical SAM domain-containing protein  28.4 
 
 		 405 aa  103  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0022  radical SAM domain-containing protein  25.15 
 
 		 360 aa  103  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0542  radical SAM domain-containing protein  25.22 
 
 		 384 aa  103  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0194035 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1095  radical SAM domain protein  24.76 
 
 		 345 aa  102  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  27.41 
 
 		 329 aa  100  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  27.41 
 
 		 329 aa  100  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0779  radical SAM domain-containing protein  26.6 
 
 		 336 aa  99  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0540  radical SAM domain-containing protein  26.51 
 
 		 326 aa  99  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1728  hypothetical protein  26.07 
 
 		 336 aa  97.8  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.241184  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1625  radical SAM domain-containing protein  24.12 
 
 		 363 aa  98.2  4e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0539  radical SAM domain-containing protein  24.85 
 
 		 376 aa  97.1  9e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00688869  normal  0.395603 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2294  radical SAM family protein  26.67 
 
 		 332 aa  96.3  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1470  radical SAM domain-containing protein  25.9 
 
 		 342 aa  96.7  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.808287  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1648  radical SAM domain-containing protein  23.82 
 
 		 363 aa  96.7  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1123  radical SAM domain-containing protein  25.33 
 
 		 345 aa  96.7  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1524  radical SAM domain-containing protein  26.94 
 
 		 337 aa  96.7  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1460  radical SAM domain-containing protein  27.42 
 
 		 332 aa  96.7  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2243  Radical SAM domain protein  29.07 
 
 		 337 aa  95.9  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0325  Radical SAM domain protein  24.42 
 
 		 333 aa  95.5  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1815  radical SAM domain-containing protein  23.89 
 
 		 364 aa  95.5  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  23.76 
 
 		 333 aa  96.3  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0922  radical SAM domain-containing protein  28.28 
 
 		 333 aa  94.4  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0354  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 		 337 aa  94.4  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.898506 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1017  Radical SAM domain protein  25.76 
 
 		 335 aa  92.8  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.677632  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0217  radical SAM domain-containing protein  23.99 
 
 		 356 aa  93.2  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1064  radical SAM domain-containing protein  25.61 
 
 		 364 aa  93.2  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1999  radical SAM domain-containing protein  24.44 
 
 		 351 aa  93.6  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.156539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1006  radical SAM family protein  26.32 
 
 		 336 aa  92.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1150  DNA mismatch repair protein  27.78 
 
 		 338 aa  92.4  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.926871 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4120  radical SAM domain-containing protein  26.82 
 
 		 372 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.424935 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  25.66 
 
 		 342 aa  91.7  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  25.08 
 
 		 353 aa  92  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1670  radical SAM domain-containing protein  27.36 
 
 		 362 aa  92  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0537367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0044  Radical SAM domain protein  25.78 
 
 		 343 aa  91.7  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0464  Radical SAM domain protein  25.3 
 
 		 348 aa  90.9  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.521225  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  27.37 
 
 		 282 aa  90.5  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1841  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 340 aa  88.2  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  25.25 
 
 		 337 aa  87.8  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2551  pyruvate formate-lyase activating enzyme-like protein  23.68 
 
 		 354 aa  87  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592966  normal  0.73651 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0449  radical SAM family protein  25.3 
 
 		 370 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355453  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1052  radical SAM family protein  24.62 
 
 		 335 aa  85.9  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2293  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  26 
 
 		 336 aa  85.9  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.388191  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0759  radical SAM domain-containing protein  24.85 
 
 		 336 aa  85.9  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0858  radical SAM domain-containing protein  28.62 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.844085 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  24.92 
 
 		 339 aa  84.3  0.000000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2456  Radical SAM domain protein  24.58 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1055  radical SAM domain-containing protein  25.99 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.146783  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  26.16 
 
 		 333 aa  83.2  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1849  radical SAM family protein  24.33 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1694  Radical SAM domain protein  27.02 
 
 		 280 aa  82.4  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.953973 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1034  radical SAM domain-containing protein  23.87 
 
 		 337 aa  82.4  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  27.46 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2431  radical SAM domain-containing protein  23.36 
 
 		 396 aa  82  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  23.68 
 
 		 342 aa  81.3  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0338  radical SAM domain-containing protein  26.04 
 
 		 348 aa  81.6  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0761  Radical SAM domain protein  25.65 
 
 		 340 aa  80.9  0.00000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00535967  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0219  Radical SAM domain protein  26.05 
 
 		 337 aa  80.9  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0211251  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0348  radical SAM domain-containing protein  25.08 
 
 		 336 aa  80.1  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.224287  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2136  Radical SAM domain protein  23.81 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.219183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1497  radical SAM domain-containing protein  24.83 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.398952  normal  0.0425103 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1063  radical SAM domain-containing protein  23.75 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.665632  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1963  Radical SAM domain protein  22.37 
 
 		 334 aa  78.2  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0105086  decreased coverage  0.00565461 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1563  radical SAM domain-containing protein  23.96 
 
 		 336 aa  77.8  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.356418 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  26.91 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0086  radical SAM family protein  24.01 
 
 		 356 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.508004  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2854  radical SAM domain-containing protein  24.6 
 
 		 337 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0239  Radical SAM domain protein  23.29 
 
 		 358 aa  76.6  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0904  Radical SAM domain protein  26.76 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0776722 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0103  Radical SAM domain protein  23.03 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0093  Radical SAM domain protein  23.03 
 
 		 356 aa  73.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0629  Radical SAM domain protein  23.51 
 
 		 343 aa  72.8  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000217214  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2684  Radical SAM domain protein  23.33 
 
 		 367 aa  73.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307935  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1005  radical SAM domain-containing protein  23.87 
 
 		 370 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2681  Radical SAM domain protein  24.16 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480916  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0270  radical SAM domain-containing protein  23.11 
 
 		 286 aa  72  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2213  radical SAM domain-containing protein  23.14 
 
 		 367 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1698  radical SAM domain-containing protein  25.24 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>