224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0498 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1593  radical SAM domain-containing protein  51.29 
 
 
587 aa  648    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.170926  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0498  radical SAM family Fe-S protein  100 
 
 
580 aa  1199    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0026  radical SAM domain-containing protein  50.78 
 
 
578 aa  641    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1597  Radical SAM domain protein  49.39 
 
 
589 aa  625  1e-178  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0511  hypothetical protein  47.06 
 
 
590 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1689  hypothetical protein  45.45 
 
 
592 aa  561  1e-158  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2049  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  44.97 
 
 
595 aa  554  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000650281  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2070  Radical SAM domain protein  45.88 
 
 
593 aa  540  9.999999999999999e-153  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1997  radical SAM family protein  43.18 
 
 
585 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0158  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  43.67 
 
 
589 aa  533  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1469  radical SAM domain-containing protein  41.86 
 
 
609 aa  520  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.447014  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2282  hypothetical protein  42.76 
 
 
633 aa  513  1e-144  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00815982  normal  0.295963 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1484  radical SAM domain-containing protein  40.59 
 
 
603 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2363  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 
566 aa  442  1e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.607234  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2000  radical SAM family protein  34.21 
 
 
565 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.345237  normal  0.435892 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1474  radical SAM domain-containing protein  31.9 
 
 
335 aa  169  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2294  radical SAM family protein  31.76 
 
 
332 aa  143  7e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  28.7 
 
 
329 aa  140  6e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  28.7 
 
 
329 aa  140  6e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0325  Radical SAM domain protein  29.38 
 
 
333 aa  140  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2551  pyruvate formate-lyase activating enzyme-like protein  30.13 
 
 
354 aa  139  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592966  normal  0.73651 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2293  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  30.25 
 
 
336 aa  136  9e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.388191  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  28.22 
 
 
333 aa  133  1.0000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  30.37 
 
 
353 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0464  Radical SAM domain protein  26.44 
 
 
348 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.521225  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  29.85 
 
 
362 aa  127  5e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0086  radical SAM family protein  28.62 
 
 
356 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.508004  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0922  radical SAM domain-containing protein  28.76 
 
 
333 aa  126  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0270  radical SAM domain-containing protein  31.54 
 
 
286 aa  125  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1095  radical SAM domain protein  30.16 
 
 
345 aa  124  4e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0103  Radical SAM domain protein  27.47 
 
 
356 aa  123  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0093  Radical SAM domain protein  27.47 
 
 
356 aa  123  9e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  31.54 
 
 
282 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1123  radical SAM domain-containing protein  30.07 
 
 
345 aa  123  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2431  radical SAM domain-containing protein  28.4 
 
 
396 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0044  Radical SAM domain protein  28.71 
 
 
343 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0219  Radical SAM domain protein  29.88 
 
 
337 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0211251  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1712  Radical SAM domain protein  26.33 
 
 
351 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  27.72 
 
 
342 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1052  radical SAM family protein  27.07 
 
 
335 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0761  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 
340 aa  120  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00535967  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1460  radical SAM domain-containing protein  27.72 
 
 
332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1314  radical SAM domain-containing protein  28.48 
 
 
345 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  28.92 
 
 
333 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1524  radical SAM domain-containing protein  29.63 
 
 
337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2213  radical SAM domain-containing protein  28.33 
 
 
367 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2430  radical SAM domain-containing protein  27.48 
 
 
365 aa  118  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0451112 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  28.9 
 
 
344 aa  118  3e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1240  radical SAM domain-containing protein  28.71 
 
 
331 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1215  radical SAM domain-containing protein  28.71 
 
 
331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2402  radical SAM domain-containing protein  29.33 
 
 
297 aa  117  5e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2217  Radical SAM domain protein  27.24 
 
 
374 aa  117  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1694  Radical SAM domain protein  27.9 
 
 
280 aa  117  6e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.953973 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1150  DNA mismatch repair protein  27.85 
 
 
338 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.926871 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  27.76 
 
 
339 aa  115  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0354  radical SAM domain-containing protein  26.69 
 
 
337 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.898506 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  26.81 
 
 
342 aa  114  5e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0779  radical SAM domain-containing protein  26.07 
 
 
336 aa  114  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0338  radical SAM domain-containing protein  26.78 
 
 
348 aa  114  6e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0542  radical SAM domain-containing protein  26.72 
 
 
384 aa  113  8.000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0194035 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1625  radical SAM domain-containing protein  26.47 
 
 
363 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0629  Radical SAM domain protein  26.23 
 
 
343 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000217214  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  27.3 
 
 
339 aa  112  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0904  Radical SAM domain protein  26.01 
 
 
395 aa  111  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0776722 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1034  radical SAM domain-containing protein  26.99 
 
 
337 aa  111  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2854  radical SAM domain-containing protein  25.71 
 
 
337 aa  110  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0759  radical SAM domain-containing protein  25.25 
 
 
336 aa  110  7.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1585  hypothetical protein  26.77 
 
 
364 aa  110  8.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1017  Radical SAM domain protein  27.3 
 
 
335 aa  109  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.677632  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1006  radical SAM family protein  26.4 
 
 
336 aa  110  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1064  radical SAM domain-containing protein  27.41 
 
 
364 aa  110  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1963  Radical SAM domain protein  26.33 
 
 
334 aa  109  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0105086  decreased coverage  0.00565461 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1670  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 
362 aa  109  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0537367  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1815  radical SAM domain-containing protein  26.33 
 
 
364 aa  108  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2555  Radical SAM domain protein  25.97 
 
 
366 aa  108  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466932  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2456  Radical SAM domain protein  25.67 
 
 
337 aa  108  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0932  radical SAM domain-containing protein  29.8 
 
 
362 aa  108  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  25.74 
 
 
337 aa  108  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0239  Radical SAM domain protein  28.04 
 
 
358 aa  107  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0022  radical SAM domain-containing protein  27.06 
 
 
360 aa  108  4e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2681  Radical SAM domain protein  28.96 
 
 
314 aa  107  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480916  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0539  radical SAM domain-containing protein  26.22 
 
 
376 aa  106  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00688869  normal  0.395603 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2136  Radical SAM domain protein  25.32 
 
 
356 aa  106  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.219183  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0540  radical SAM domain-containing protein  28.81 
 
 
326 aa  106  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  31.56 
 
 
294 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1648  radical SAM domain-containing protein  26.04 
 
 
363 aa  106  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2539  Radical SAM domain protein  26.76 
 
 
360 aa  106  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0449  radical SAM family protein  25.71 
 
 
370 aa  105  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355453  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4120  radical SAM domain-containing protein  23.84 
 
 
372 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.424935 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0728  Radical SAM domain protein  26.69 
 
 
361 aa  105  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000489129 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1995  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 
405 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0574  radical SAM domain protein  26.69 
 
 
361 aa  105  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0217  radical SAM domain-containing protein  24.85 
 
 
356 aa  105  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0396  radical SAM family protein  24.18 
 
 
358 aa  104  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1728  hypothetical protein  25.62 
 
 
336 aa  104  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.241184  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1497  radical SAM domain-containing protein  27.06 
 
 
365 aa  103  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.398952  normal  0.0425103 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1470  radical SAM domain-containing protein  25.75 
 
 
342 aa  102  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.808287  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0917  Radical SAM domain protein  25 
 
 
324 aa  102  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5878  Radical SAM domain protein  23.81 
 
 
362 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0206709  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0348  radical SAM domain-containing protein  27.47 
 
 
336 aa  101  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.224287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>