172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2049 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2049  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  100 
 
 		 595 aa  1241    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000650281  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0498  radical SAM family Fe-S protein  44.97 
 
 		 580 aa  554  1e-156  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1593  radical SAM domain-containing protein  43.72 
 
 		 587 aa  533  1e-150  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.170926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1484  radical SAM domain-containing protein  45.53 
 
 		 603 aa  531  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1597  Radical SAM domain protein  43.82 
 
 		 589 aa  520  1e-146  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1689  hypothetical protein  42.02 
 
 		 592 aa  483  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0026  radical SAM domain-containing protein  41.56 
 
 		 578 aa  483  1e-135  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2070  Radical SAM domain protein  40.54 
 
 		 593 aa  479  1e-134  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0158  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  41.95 
 
 		 589 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0511  hypothetical protein  38.73 
 
 		 590 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1469  radical SAM domain-containing protein  39.8 
 
 		 609 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.447014  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2363  radical SAM domain-containing protein  38.9 
 
 		 566 aa  427  1e-118  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.607234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1997  radical SAM family protein  36.52 
 
 		 585 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2282  hypothetical protein  36.74 
 
 		 633 aa  413  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00815982  normal  0.295963 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2000  radical SAM family protein  36.8 
 
 		 565 aa  385  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.345237  normal  0.435892 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1474  radical SAM domain-containing protein  31.6 
 
 		 335 aa  159  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0464  Radical SAM domain protein  29.82 
 
 		 348 aa  146  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.521225  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1625  radical SAM domain-containing protein  29.79 
 
 		 363 aa  144  4e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0922  radical SAM domain-containing protein  31.1 
 
 		 333 aa  144  4e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1815  radical SAM domain-containing protein  29.48 
 
 		 364 aa  143  8e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  29.63 
 
 		 333 aa  141  3e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2551  pyruvate formate-lyase activating enzyme-like protein  26.92 
 
 		 354 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592966  normal  0.73651 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0761  Radical SAM domain protein  30.24 
 
 		 340 aa  139  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00535967  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  29.79 
 
 		 362 aa  138  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0629  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 		 343 aa  137  4e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000217214  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1648  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 363 aa  137  5e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1215  radical SAM domain-containing protein  28.75 
 
 		 331 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1712  Radical SAM domain protein  29.91 
 
 		 351 aa  137  7.000000000000001e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1240  radical SAM domain-containing protein  28.75 
 
 		 331 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0542  radical SAM domain-containing protein  27.96 
 
 		 384 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0194035 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1064  radical SAM domain-containing protein  31.17 
 
 		 364 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1999  radical SAM domain-containing protein  29.52 
 
 		 351 aa  135  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.156539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0022  radical SAM domain-containing protein  30.31 
 
 		 360 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0219  Radical SAM domain protein  32.42 
 
 		 337 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0211251  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  31.68 
 
 		 337 aa  134  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1524  radical SAM domain-containing protein  30.58 
 
 		 337 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0779  radical SAM domain-containing protein  29.67 
 
 		 336 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0539  radical SAM domain-containing protein  27.58 
 
 		 376 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00688869  normal  0.395603 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  27.61 
 
 		 329 aa  131  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  27.61 
 
 		 329 aa  131  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  29.39 
 
 		 353 aa  130  9.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0093  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 356 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0858  radical SAM domain-containing protein  29.64 
 
 		 338 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.844085 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0917  Radical SAM domain protein  29.75 
 
 		 324 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1006  radical SAM family protein  28.93 
 
 		 336 aa  128  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2456  Radical SAM domain protein  31.06 
 
 		 337 aa  128  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1728  hypothetical protein  28.62 
 
 		 336 aa  128  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.241184  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2294  radical SAM family protein  30.15 
 
 		 332 aa  126  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0325  Radical SAM domain protein  28.04 
 
 		 333 aa  125  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0103  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 356 aa  125  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0086  radical SAM family protein  27.92 
 
 		 356 aa  125  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.508004  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  28.38 
 
 		 333 aa  125  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2854  radical SAM domain-containing protein  27.95 
 
 		 337 aa  124  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  27.62 
 
 		 342 aa  123  8e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  27.22 
 
 		 339 aa  122  9.999999999999999e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0217  radical SAM domain-containing protein  26.24 
 
 		 356 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1150  DNA mismatch repair protein  28.7 
 
 		 338 aa  120  6e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.926871 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1123  radical SAM domain-containing protein  29.61 
 
 		 345 aa  120  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0904  Radical SAM domain protein  27.74 
 
 		 395 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0776722 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0044  Radical SAM domain protein  27.63 
 
 		 343 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0354  radical SAM domain-containing protein  29.1 
 
 		 337 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.898506 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0540  radical SAM domain-containing protein  27.07 
 
 		 326 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1095  radical SAM domain protein  28.71 
 
 		 345 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  26.99 
 
 		 342 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1314  radical SAM domain-containing protein  28.67 
 
 		 345 aa  118  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1052  radical SAM family protein  29.66 
 
 		 335 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4120  radical SAM domain-containing protein  27.38 
 
 		 372 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.424935 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0338  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 348 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1670  radical SAM domain-containing protein  29.33 
 
 		 362 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0537367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0348  radical SAM domain-containing protein  27.52 
 
 		 336 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.224287  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1460  radical SAM domain-containing protein  27.44 
 
 		 332 aa  114  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2402  radical SAM domain-containing protein  26.79 
 
 		 297 aa  114  5e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1055  radical SAM domain-containing protein  25.9 
 
 		 335 aa  114  6e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.146783  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1849  radical SAM family protein  25.24 
 
 		 329 aa  113  9e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1034  radical SAM domain-containing protein  25.5 
 
 		 337 aa  113  9e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  29.23 
 
 		 339 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1017  Radical SAM domain protein  26.13 
 
 		 335 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.677632  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1063  radical SAM domain-containing protein  27.83 
 
 		 336 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.665632  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  26.93 
 
 		 344 aa  112  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2948  radical SAM family Fe-S protein  27.54 
 
 		 347 aa  111  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1698  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 337 aa  112  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2136  Radical SAM domain protein  27.99 
 
 		 356 aa  111  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.219183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1563  radical SAM domain-containing protein  28.1 
 
 		 336 aa  110  6e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.356418 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2243  Radical SAM domain protein  27.83 
 
 		 337 aa  109  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1963  Radical SAM domain protein  26.85 
 
 		 334 aa  107  9e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0105086  decreased coverage  0.00565461 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0759  radical SAM domain-containing protein  26.63 
 
 		 336 aa  107  9e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1841  Radical SAM domain protein  29.57 
 
 		 340 aa  106  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2539  Radical SAM domain protein  26.5 
 
 		 360 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2431  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 396 aa  104  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2293  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  27.73 
 
 		 336 aa  103  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.388191  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1497  radical SAM domain-containing protein  26.02 
 
 		 365 aa  102  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.398952  normal  0.0425103 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  28 
 
 		 294 aa  102  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1178  hypothetical protein  24.25 
 
 		 358 aa  101  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1694  Radical SAM domain protein  29.35 
 
 		 280 aa  101  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.953973 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2681  Radical SAM domain protein  27.36 
 
 		 314 aa  101  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480916  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0728  Radical SAM domain protein  25.51 
 
 		 361 aa  99.8  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000489129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0574  radical SAM domain protein  25.51 
 
 		 361 aa  99.8  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1172  hypothetical protein  24.48 
 
 		 358 aa  99  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1585  hypothetical protein  25.75 
 
 		 364 aa  99  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0396  radical SAM family protein  24.92 
 
 		 358 aa  99.4  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>