More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0761 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0761  Radical SAM domain protein  100 
 
 
340 aa  703    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00535967  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0629  Radical SAM domain protein  57.18 
 
 
343 aa  428  1e-119  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000217214  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1524  radical SAM domain-containing protein  52.24 
 
 
337 aa  363  3e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  51.93 
 
 
337 aa  358  8e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2456  Radical SAM domain protein  52.52 
 
 
337 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1006  radical SAM family protein  50.75 
 
 
336 aa  346  3e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2854  radical SAM domain-containing protein  52.08 
 
 
337 aa  346  4e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0779  radical SAM domain-containing protein  49.85 
 
 
336 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2243  Radical SAM domain protein  50.44 
 
 
337 aa  340  1e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0354  radical SAM domain-containing protein  48.66 
 
 
337 aa  340  2e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.898506 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1728  hypothetical protein  48.96 
 
 
336 aa  333  3e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.241184  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  48.51 
 
 
342 aa  332  4e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1841  Radical SAM domain protein  44.44 
 
 
340 aa  328  8e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  45.7 
 
 
342 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1670  radical SAM domain-containing protein  44.28 
 
 
362 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0537367  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0922  radical SAM domain-containing protein  47.76 
 
 
333 aa  325  8.000000000000001e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  45.72 
 
 
339 aa  317  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  47.34 
 
 
333 aa  316  4e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0044  Radical SAM domain protein  45.02 
 
 
343 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2539  Radical SAM domain protein  45.67 
 
 
360 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4120  radical SAM domain-containing protein  43.41 
 
 
372 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.424935 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2551  pyruvate formate-lyase activating enzyme-like protein  45.83 
 
 
354 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592966  normal  0.73651 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  45.05 
 
 
353 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1849  radical SAM family protein  46.97 
 
 
329 aa  301  8.000000000000001e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1325  radical SAM domain-containing protein  42.81 
 
 
365 aa  300  3e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.322233  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1215  radical SAM domain-containing protein  49.26 
 
 
331 aa  300  3e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1240  radical SAM domain-containing protein  49.26 
 
 
331 aa  300  3e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1150  DNA mismatch repair protein  45.37 
 
 
338 aa  299  5e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.926871 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  45.48 
 
 
329 aa  296  5e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  45.48 
 
 
329 aa  296  5e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0932  radical SAM domain-containing protein  43.9 
 
 
362 aa  295  8e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3292  Radical SAM domain protein  43.24 
 
 
366 aa  293  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  44.67 
 
 
362 aa  292  5e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1497  radical SAM domain-containing protein  44.31 
 
 
365 aa  292  7e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.398952  normal  0.0425103 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1005  radical SAM domain-containing protein  44.28 
 
 
370 aa  289  4e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0200  Radical SAM domain protein  40.61 
 
 
386 aa  286  4e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2948  radical SAM family Fe-S protein  43.47 
 
 
347 aa  286  4e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0728  Radical SAM domain protein  43.37 
 
 
361 aa  286  5e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000489129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0574  radical SAM domain protein  43.37 
 
 
361 aa  286  5e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0103  Radical SAM domain protein  43.07 
 
 
356 aa  285  8e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0093  Radical SAM domain protein  43.67 
 
 
356 aa  285  9e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1178  hypothetical protein  43.45 
 
 
358 aa  284  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0086  radical SAM family protein  43.98 
 
 
356 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.508004  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1963  Radical SAM domain protein  43.81 
 
 
334 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0105086  decreased coverage  0.00565461 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0073  pyruvate formate lyase-activating enzyme, putative  42.77 
 
 
365 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1172  hypothetical protein  43.15 
 
 
358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1969  radical SAM family protein  42.68 
 
 
370 aa  282  5.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.327469 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0893  radical SAM domain-containing protein  40.3 
 
 
361 aa  282  5.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.910266 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1034  radical SAM domain-containing protein  43.37 
 
 
337 aa  282  6.000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1870  radical SAM domain-containing protein  41.21 
 
 
374 aa  280  3e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0898  radical SAM domain-containing protein  42.64 
 
 
369 aa  278  8e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  45.1 
 
 
333 aa  278  9e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2684  Radical SAM domain protein  40.3 
 
 
367 aa  278  9e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307935  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1995  radical SAM domain-containing protein  42.68 
 
 
405 aa  278  9e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2430  radical SAM domain-containing protein  40.36 
 
 
365 aa  278  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0451112 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0759  radical SAM domain-containing protein  43.12 
 
 
336 aa  277  2e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2213  radical SAM domain-containing protein  40.36 
 
 
367 aa  277  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1017  Radical SAM domain protein  44.44 
 
 
335 aa  275  7e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.677632  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  46.01 
 
 
344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0904  Radical SAM domain protein  41.64 
 
 
395 aa  274  1.0000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0776722 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1585  hypothetical protein  42.38 
 
 
364 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2681  Radical SAM domain protein  43.73 
 
 
314 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480916  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1058  radical SAM domain-containing protein  42.07 
 
 
382 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2555  Radical SAM domain protein  41.27 
 
 
366 aa  272  7e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466932  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0338  radical SAM domain-containing protein  43.54 
 
 
348 aa  272  8.000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2431  radical SAM domain-containing protein  41.44 
 
 
396 aa  271  9e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  42.47 
 
 
339 aa  271  1e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1052  radical SAM family protein  43.99 
 
 
335 aa  270  2e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0396  radical SAM family protein  40.9 
 
 
358 aa  269  5e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1123  radical SAM domain-containing protein  43.13 
 
 
345 aa  268  1e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1314  radical SAM domain-containing protein  41.32 
 
 
345 aa  267  2e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2217  Radical SAM domain protein  41.16 
 
 
374 aa  267  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5878  Radical SAM domain protein  40.98 
 
 
362 aa  266  5e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0206709  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6076  radical SAM family protein  42.42 
 
 
363 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0088  radical SAM domain-containing protein  40.18 
 
 
357 aa  265  8e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.400989  normal  0.227798 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0219  Radical SAM domain protein  43.18 
 
 
337 aa  263  4e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0211251  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1815  radical SAM domain-containing protein  41.21 
 
 
364 aa  262  6e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0325  Radical SAM domain protein  41.79 
 
 
333 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1095  radical SAM domain protein  44.09 
 
 
345 aa  261  1e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1055  radical SAM domain-containing protein  43.53 
 
 
335 aa  259  7e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.146783  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1648  radical SAM domain-containing protein  41.85 
 
 
363 aa  258  1e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2294  radical SAM family protein  41.1 
 
 
332 aa  257  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13159  pyruvate formate lyase activating protein pflA  41.92 
 
 
362 aa  255  9e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1625  radical SAM domain-containing protein  40.58 
 
 
363 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0542  radical SAM domain-containing protein  42.86 
 
 
384 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0194035 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0540  radical SAM domain-containing protein  41.84 
 
 
326 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0464  Radical SAM domain protein  39.88 
 
 
348 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.521225  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6305  Radical SAM domain-containing protein  41.57 
 
 
388 aa  251  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0539  radical SAM domain-containing protein  40.18 
 
 
376 aa  250  2e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00688869  normal  0.395603 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0449  radical SAM family protein  37.65 
 
 
370 aa  248  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355453  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2293  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  40.55 
 
 
336 aa  246  3e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.388191  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2136  Radical SAM domain protein  37.94 
 
 
356 aa  246  3e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.219183  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1999  radical SAM domain-containing protein  39.88 
 
 
351 aa  245  6.999999999999999e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.156539  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0348  radical SAM domain-containing protein  41.27 
 
 
336 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.224287  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  47.72 
 
 
282 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1563  radical SAM domain-containing protein  40.61 
 
 
336 aa  243  3e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.356418 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1460  radical SAM domain-containing protein  37.65 
 
 
332 aa  243  3.9999999999999997e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1712  Radical SAM domain protein  40.42 
 
 
351 aa  242  7.999999999999999e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1063  radical SAM domain-containing protein  41.27 
 
 
336 aa  241  9e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.665632  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0270  radical SAM domain-containing protein  42.27 
 
 
286 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>