48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0622 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0622  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 249 aa  517  1e-146  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165455  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0595  radical SAM domain-containing protein  96.39 
 
 		 249 aa  487  1e-137  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_563  radical SAM domain protein  96.39 
 
 		 249 aa  474  1e-133  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0109  radical SAM domain-containing protein  52.8 
 
 		 249 aa  287  9e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_100  radical SAM domain protein  53.6 
 
 		 249 aa  285  4e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0280  radical SAM domain-containing protein  52.4 
 
 		 249 aa  285  5.999999999999999e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1337  radical SAM domain protein  53.2 
 
 		 249 aa  284  8e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_75  radical SAM domain protein  42.17 
 
 		 246 aa  228  7e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0243  radical SAM domain-containing protein  41.37 
 
 		 246 aa  223  2e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0453811  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1137  radical SAM domain-containing protein  38.63 
 
 		 273 aa  168  7e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.558403  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_955  radical SAM domain protein  37.45 
 
 		 273 aa  166  4e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0090  radical SAM domain-containing protein  36.91 
 
 		 271 aa  165  5e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0241  radical SAM domain-containing protein  40.52 
 
 		 256 aa  161  8.000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_79  radical SAM domain protein  35.65 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0966  radical SAM domain-containing protein  36.91 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0089  radical SAM domain-containing protein  37.29 
 
 		 283 aa  159  3e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.110563  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_77  radical SAM domain protein  40.09 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0239  radical SAM domain-containing protein  34.78 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0519  radical SAM domain-containing protein  27.2 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.149546  normal  0.440492 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1463  radical SAM domain-containing protein  27.2 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  32.65 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  32.65 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1254  radical SAM domain-containing protein  24.84 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0355  Radical SAM domain protein  29.46 
 
 		 365 aa  56.2  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0403  Radical SAM domain protein  25.51 
 
 		 351 aa  55.8  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00459412  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1490  radical SAM domain-containing protein  24.84 
 
 		 377 aa  54.3  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.343112  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2070  Radical SAM domain protein  27.46 
 
 		 593 aa  53.1  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  25.3 
 
 		 282 aa  52.4  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1240  radical SAM domain-containing protein  27.35 
 
 		 331 aa  51.6  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1215  radical SAM domain-containing protein  27.35 
 
 		 331 aa  51.6  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1874  radical SAM domain-containing protein  24.86 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1460  radical SAM domain-containing protein  26.69 
 
 		 332 aa  49.7  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1582  radical SAM domain-containing protein  25.37 
 
 		 355 aa  48.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0102098  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1533  radical SAM domain-containing protein  25.37 
 
 		 355 aa  48.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000125557  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0219  Radical SAM domain protein  23.7 
 
 		 337 aa  47  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0211251  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1469  radical SAM domain-containing protein  23.04 
 
 		 609 aa  46.2  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.447014  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1712  Radical SAM domain protein  23.83 
 
 		 351 aa  45.8  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0158  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  23.96 
 
 		 589 aa  45.8  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2000  radical SAM family protein  25.23 
 
 		 565 aa  45.8  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.345237  normal  0.435892 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1722  radical SAM domain-containing protein  24.63 
 
 		 371 aa  45.4  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0498  radical SAM family Fe-S protein  31.71 
 
 		 580 aa  45.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2363  radical SAM domain-containing protein  24.07 
 
 		 566 aa  44.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.607234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0540  radical SAM domain-containing protein  22.31 
 
 		 326 aa  43.5  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2061  Radical SAM domain protein  26.45 
 
 		 298 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000288905 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0761  Radical SAM domain protein  21.72 
 
 		 340 aa  43.1  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00535967  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4016  radical SAM domain-containing protein  26.58 
 
 		 379 aa  42.4  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.643398  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0917  Radical SAM domain protein  23.16 
 
 		 324 aa  42  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  28.21 
 
 		 1226 aa  42  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>