61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1137 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1137  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 273 aa  570  1e-161  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.558403  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0966  radical SAM domain-containing protein  94.51 
 
 		 273 aa  543  1e-153  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_955  radical SAM domain protein  92.31 
 
 		 273 aa  532  1e-150  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0241  radical SAM domain-containing protein  59 
 
 		 256 aa  324  1e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_77  radical SAM domain protein  56.13 
 
 		 274 aa  319  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0090  radical SAM domain-containing protein  44.35 
 
 		 271 aa  194  2e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0109  radical SAM domain-containing protein  43.29 
 
 		 249 aa  181  9.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0280  radical SAM domain-containing protein  43.29 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_100  radical SAM domain protein  41.56 
 
 		 249 aa  170  3e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1337  radical SAM domain protein  41.56 
 
 		 249 aa  169  4e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0089  radical SAM domain-containing protein  39.24 
 
 		 283 aa  169  5e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.110563  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_75  radical SAM domain protein  35.22 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_79  radical SAM domain protein  34.13 
 
 		 248 aa  158  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0243  radical SAM domain-containing protein  34.41 
 
 		 246 aa  156  4e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0453811  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0622  radical SAM domain-containing protein  38.63 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165455  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0595  radical SAM domain-containing protein  36.6 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_563  radical SAM domain protein  37.45 
 
 		 249 aa  152  4e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0239  radical SAM domain-containing protein  33.19 
 
 		 223 aa  133  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1463  radical SAM domain-containing protein  29.63 
 
 		 266 aa  95.1  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0519  radical SAM domain-containing protein  29.63 
 
 		 266 aa  93.2  4e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.149546  normal  0.440492 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1357  pyruvate formate-lyase activating enzyme  23.61 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1170  pyruvate formate-lyase activating enzyme  23.61 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.763287  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1671  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  28.99 
 
 		 246 aa  52.8  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0803873  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1254  radical SAM domain-containing protein  31.25 
 
 		 384 aa  51.2  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0297  radical SAM domain-containing protein  29.19 
 
 		 363 aa  50.4  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1430  radical SAM domain-containing protein  29.19 
 
 		 302 aa  49.3  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.698676  hitchhiker  0.00476012 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2837  pyruvate formate-lyase activating enzyme  28.79 
 
 		 255 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.128251 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003978  pyruvate formate-lyase activating enzyme  23.44 
 
 		 246 aa  48.1  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01544  pyruvate formate-lyase 1 activating enzyme  24.81 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1953  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  25.56 
 
 		 245 aa  48.1  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1722  radical SAM domain-containing protein  36.9 
 
 		 371 aa  46.6  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1903  radical SAM domain-containing protein  28.47 
 
 		 364 aa  46.2  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.378187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  23.5 
 
 		 329 aa  46.6  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  23.5 
 
 		 329 aa  46.6  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4973  pyruvate formate lyase activating enzyme  25.2 
 
 		 287 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.577557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4819  pyruvate formate lyase activating enzyme  25.59 
 
 		 287 aa  46.2  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1396  glycerol dehydratase activating enzyme  27.41 
 
 		 322 aa  45.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.214688  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4886  pyruvate formate lyase activating enzyme  25.2 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0614153  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1460  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  26.57 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4921  pyruvate formate lyase activating enzyme  25.2 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2884  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  24.48 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00506631  hitchhiker  0.00000444162 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0802  radical SAM family Fe-S protein  23.6 
 
 		 561 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1497  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  27.54 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1582  radical SAM domain-containing protein  24.52 
 
 		 355 aa  44.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0102098  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1533  radical SAM domain-containing protein  24.52 
 
 		 355 aa  44.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000125557  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2049  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  23.11 
 
 		 595 aa  43.5  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000650281  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1605  pyruvate-formate lyase activating enzyme  25.35 
 
 		 266 aa  43.5  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2391  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  26.39 
 
 		 246 aa  43.9  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227753  normal  0.208715 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0355  Radical SAM domain protein  31.71 
 
 		 365 aa  43.9  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0885  pyruvate formate-lyase 1-activating enzyme  24.1 
 
 		 293 aa  43.1  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1707  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  23.78 
 
 		 246 aa  43.5  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0231805 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  27.75 
 
 		 468 aa  43.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3308  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  24.09 
 
 		 246 aa  43.1  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.760643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1034  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  24.84 
 
 		 265 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.633483  normal  0.712061 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0975  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  24.84 
 
 		 265 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.462536  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1083  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  24.84 
 
 		 265 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.704189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1068  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  24.84 
 
 		 265 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.763935 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1003  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  24.84 
 
 		 265 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3258  glycyl-radical enzyme activating protein family  32.46 
 
 		 303 aa  42.4  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.807185  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1422  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  26.11 
 
 		 246 aa  42.4  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4927  radical SAM domain-containing protein  27.1 
 
 		 287 aa  42  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>