More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1268 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1268  radical SAM family Fe-S protein  100 
 
 
312 aa  643    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.45793  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0133  nitrogen fixation protein  69.48 
 
 
321 aa  464  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0813  radical SAM family protein  58.78 
 
 
298 aa  363  2e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.152673  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0422  radical SAM domain-containing protein  59.71 
 
 
299 aa  359  4e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.2652  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0665  radical SAM domain-containing protein  58.7 
 
 
297 aa  356  1.9999999999999998e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.513594 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0654  radical SAM domain-containing protein  55.79 
 
 
303 aa  350  2e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00641861  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0679  hypothetical protein  56.06 
 
 
310 aa  345  6e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0300  Radical SAM domain protein  55.51 
 
 
303 aa  340  2e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.308872 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3463  radical SAM domain-containing protein  57.2 
 
 
289 aa  333  3e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0681  radical SAM family protein  55.51 
 
 
290 aa  330  3e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.414867 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1209  radical SAM domain-containing protein  55.72 
 
 
288 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279615  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2083  Radical SAM domain protein  54.95 
 
 
285 aa  322  7e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2135  Radical SAM domain protein  54.21 
 
 
285 aa  320  3e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000451795 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2799  radical SAM domain-containing protein  54.41 
 
 
290 aa  317  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0422  Radical SAM domain protein  53.53 
 
 
273 aa  312  4.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0069051  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1358  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  51.59 
 
 
479 aa  305  6e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1148  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB, putative  52.51 
 
 
276 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0204  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  50 
 
 
522 aa  301  1e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.037885  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3912  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  50.18 
 
 
475 aa  301  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5904  nitrogenase FeMo cofactor biosynthesis protein NifB  49.82 
 
 
520 aa  299  4e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1245  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  50.18 
 
 
522 aa  298  6e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.720089  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1529  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  50.18 
 
 
499 aa  298  7e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1200  radical SAM domain-containing protein  45.21 
 
 
313 aa  298  8e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3646  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  50 
 
 
519 aa  297  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0111  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  49.47 
 
 
520 aa  297  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4042  radical SAM domain-containing protein  47.57 
 
 
313 aa  297  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00822978 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0396  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  49.82 
 
 
527 aa  297  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.452553  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4472  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  48.62 
 
 
518 aa  295  6e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5111  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  48.06 
 
 
518 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4244  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  48.94 
 
 
484 aa  292  4e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6871  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  48.76 
 
 
655 aa  292  5e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4478  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  48.07 
 
 
527 aa  290  2e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0277889  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2361  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  49.47 
 
 
495 aa  289  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.968196  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0959  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  48.76 
 
 
518 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438509  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0513  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  50.91 
 
 
468 aa  288  6e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2124  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  49.11 
 
 
483 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477225 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1063  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  48.41 
 
 
519 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0737  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  49.81 
 
 
423 aa  287  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0944  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  50 
 
 
469 aa  286  2.9999999999999996e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0409704  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0149  radical SAM domain-containing protein  48.48 
 
 
285 aa  286  4e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1251  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  50 
 
 
423 aa  285  5.999999999999999e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000233074  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1404  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  46.48 
 
 
529 aa  284  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0678  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  45.48 
 
 
424 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0514333  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1684  radical SAM domain-containing protein  53.05 
 
 
297 aa  282  5.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1030  Radical SAM domain protein  48.31 
 
 
304 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0994  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  46.13 
 
 
503 aa  281  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0229  radical SAM domain-containing protein  52.29 
 
 
297 aa  281  1e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.819086  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1454  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  44.37 
 
 
500 aa  280  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1446  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  45.58 
 
 
531 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756004 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1956  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  48.69 
 
 
423 aa  280  3e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1206  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  49.26 
 
 
464 aa  279  4e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.65726  normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2814  radical SAM domain-containing protein  47.14 
 
 
299 aa  278  8e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0917  radical SAM domain-containing protein  51.32 
 
 
297 aa  278  9e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354984  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1780  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  47.31 
 
 
491 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1808  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  47.31 
 
 
491 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3202  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  47.46 
 
 
482 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4133  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  47.18 
 
 
489 aa  276  4e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250662  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1574  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  44.48 
 
 
531 aa  275  7e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.274095  normal  0.786135 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1568  radical SAM family protein  50.57 
 
 
291 aa  275  8e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1576  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  46.29 
 
 
490 aa  275  1.0000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1056  Radical SAM domain protein  49.04 
 
 
280 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4005  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  48.03 
 
 
498 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2107  MoaA/NifB/PqqE family nitrogen fixation protein  46.86 
 
 
297 aa  273  3e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0281  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  48.01 
 
 
351 aa  272  5.000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.144373  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3602  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  45.77 
 
 
498 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.95628  normal  0.038494 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2622  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  45.55 
 
 
427 aa  268  7e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1533  radical SAM domain-containing protein  48.52 
 
 
297 aa  268  1e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1634  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  46.1 
 
 
424 aa  267  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00241084  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1535  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  46.38 
 
 
420 aa  267  2e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51010  Nitrogenase cofactor biosynthesis protein  44.56 
 
 
503 aa  266  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0231468  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1241  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  42.76 
 
 
491 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.420081  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0843  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  47.96 
 
 
418 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7742  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  44.84 
 
 
535 aa  266  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379245  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2197  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  42.76 
 
 
491 aa  266  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.157561  normal  0.878423 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1972  radical SAM domain-containing protein  45.49 
 
 
275 aa  265  8.999999999999999e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.396519  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1758  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  46.82 
 
 
424 aa  263  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0688077  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0546  NifB family--FeMo cofactor biosynthesis protein  42.4 
 
 
491 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.351769  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3024  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  45.96 
 
 
495 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5043  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  42.54 
 
 
363 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0411446  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2906  Radical SAM domain protein  45.35 
 
 
296 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0586  radical SAM domain-containing protein  46.92 
 
 
318 aa  258  1e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6233  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  43.62 
 
 
490 aa  256  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4924  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  44.33 
 
 
490 aa  256  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3098  radical SAM domain-containing protein  44.61 
 
 
473 aa  255  6e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0796  radical SAM family protein  46.18 
 
 
331 aa  251  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1011  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  40.15 
 
 
423 aa  247  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1360  Radical SAM domain protein  43.06 
 
 
318 aa  242  6e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0575  Radical SAM domain protein  43.61 
 
 
296 aa  241  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3054  Radical SAM domain protein  44.23 
 
 
325 aa  233  3e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.164409 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1961  radical SAM domain-containing protein  43.66 
 
 
293 aa  233  4.0000000000000004e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0251824  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2598  Radical SAM domain protein  43.73 
 
 
307 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0138317  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1610  Radical SAM domain protein  34.19 
 
 
269 aa  160  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2618  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.82 
 
 
419 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20010  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.67 
 
 
338 aa  69.7  0.00000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0117672 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0240  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.76 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0326  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.65 
 
 
318 aa  66.6  0.0000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1915  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.7 
 
 
321 aa  65.5  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1486  radical SAM family protein  27.15 
 
 
292 aa  63.9  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0969  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.85 
 
 
373 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.243717 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2160  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.25 
 
 
322 aa  63.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.921473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>